问题标签 [owlready]

我正在做一个项目，我需要检索人类/鼠标本体的 rdf:label 值并在这些标签上运行匹配器。但是，我似乎找不到可以返回本体中所有类的所有标签的内置 Owlready2 方法。我可以使用所有类名，onto.classes()但这对我没有帮助，因为我无法从类名中获取标签。类名在数据集中只有 IRI，格式为human.NCIXXXXX.

我正在使用OWL/RDF格式为：http ://oaei.ontologymatching.org/2012/anatomy/index.html 的 OAEI 2012 数据集 （数据集的下载链接在数据集标题下）

这是人类猫头鹰本体文件的片段：

onto.classes()返回human.NCI_C13031。我想要 Python 列表中“subiculum”的 LABEL 值。

文档说，owlready2可以通过调用onto.search(label = "XXXXXX") (X = labelname). 但是，我想要反过来。我需要检索标签。我似乎找不到使用 owlready2 的方法。有没有办法在有/没有owlready2的情况下做到这一点？我知道 owlready2 中有一个 OWL/RDF 解析器（owlready 没有），我可以成功读取文件。我只需要某个标签查询即可工作。

请考虑我需要在 Python 中执行此操作，而且我对 Python 也很陌生。我尝试了 onspy，但它似乎没有本体查询的潜​​力，仅用于本体文档（如果我错了，请纠正我）。

谢谢！

编辑：我自己解决了。要获取标签，请将 设置set render function 为自定义函数，该函数接受一个实体并返回其标签。它全部在 owlready 文档中：https://pythonhosted.org/Owlready2/annotations.html#custom-rendering-of- entities`

我正在使用以下代码向本体添加注释

然后它显示一个IndexError，当我使用 on.save() 保存它时

我想借助 Python 的语义网络工具（最好是 owlready ）解决 A. Einstein 著名的斑马难题。

起点是链接在https://github.com/RDFLib/OWL-RL/issues/3中的两个 owl 文件。第一个（XML 语法）按预期工作。第二个（不同的作者，n3海龟语法）无法加载或仅在owlready中“部分”加载。为了更容易理解我的步骤，我将它们记录在此笔记本中：https ://github.com/cknoll/demo-material/blob/main/expertise_system/einstein-zebra-puzzle-owlready-solution-attempt.ipynb 。

<Edit1>为了更好地参考，我包括了笔记本的基本部分：

</编辑1>

结论：我可以加载此本体的 XML 版本，但我无法确认这些概念是否定义为owl:oneOf-objects，也无法找到断言之类的位置

告终。

我会很高兴得到一些提示。

（我认为，一旦正确表示了本体，就可以通过类似的方式获得解决方案sync_reasoner_pellet(infer_property_values=True, infer_data_property_values=True))

是否可以解析以曼彻斯特语法给出的本体，使其最终成为owlready的本体对象。

这是我到目前为止发现的：

• Owlready 本身只能导入“NTriples、RDF/XML 或 OWL/XML 格式”（ref1）。

• Ontospy可以（除其他外）在这些格式之间进行转换：（['xml', 'turtle', 'n3', 'nt', 'trix', 'rdfa']ref2 ）。

• rdflib有一个功能rdflib.extras.infixowl.manchesterSyntax(...)，但似乎没有很好地记录，似乎不适用于整个文件（或str多个语句）。

是否还有其他我遗漏的项目，或者是否有一种简单的方法可以组合（一些）这些项目以将曼彻斯特语法中的 owl 文件解析为 owlready 本体？

我正在使用 owlread 构建代码，代码必须抛出文本并将医学发现转换为 SNOMED ct

但是我收到关于 SNOMEDCT_US = PYM["SNOMEDCT_US"] 的错误，错误说 TypeError: 'NoneType' object is not subscriptable

我认为缺少可以识别 PYM["SNOMEDCT_US"] 的文件，但我仍然找不到它？

谢谢

我有一段非常简单的代码，但它已经遇到了错误。我的一段代码应该只遍历本体中的类名并将它们打印出来。这适用于前 20 个左右，但随后会发生此错误：

我使用 owlready2 的代码只有这 4 行：

你能指出我的错误吗？我最初在 MacBook 上尝试过，但现在我也在运行 Arch 的计算机上进行了测试，同样的错误。

我在 desctop Protege 中创建了本体。它由两个类组成 - test1 和 test2。然后我为他们声明了标签。第一个没有数据类型的标签，第二个 - 文字。OWL 文件内容如下。差异是字符串 'rdf:datatype="&rdfs;Literal"' 的存在尝试通过 owlready2 获取标签时，出现错误“ValueError：无法读取数据类型 305 的文字！” 用于文字类型标签。

这是 OWL 文件的内容：

这是打印子类标签的代码：

这是带有错误消息的输出：

如何获取 test2 的标签值？

我正在尝试加载一个导入其他一些本体的本体。这些其他本体位于我的机器上，而不是在网络上。如果我尝试 my_ontology.load() 它会尝试从它们的 URI 加载这些其他本体。但这失败了。我如何告诉 owlready2 这些本体在哪里？

我开发了一个使用包的 python 项目owlready2。对于它的一些功能，owlready2 显式地java -jar ...通过-package 进行调用subprocess。

在我的本地机器上，这工作正常。现在我想用drone.io 设置CI。

我现在的.drone.yml样子是这样的：

在测试摘要中，我收到错误：

这是非常合乎逻辑的，因为我使用图像“python：3.8”。

问题：如何使 java 在测试机上可用？

我正在尝试加载本体，但我收到一个错误，您可以在帖子中看到，代码如下所示。

代码：

错误：