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我正在做一个项目,我需要检索人类/鼠标本体的 rdf:label 值并在这些标签上运行匹配器。但是,我似乎找不到可以返回本体中所有类的所有标签的内置 Owlready2 方法。我可以使用所有类名,onto.classes()但这对我没有帮助,因为我无法从类名中获取标签。类名在数据集中只有 IRI,格式为human.NCIXXXXX.

我正在使用OWL/RDF格式为:http ://oaei.ontologymatching.org/2012/anatomy/index.html 的 OAEI 2012 数据集 (数据集的下载链接在数据集标题下)

这是人类猫头鹰本体文件的片段:

<owl:Class rdf:about="http://human.owl#NCI_C33648">
    <rdfs:label rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#string">Subiculum</rdfs:label>
    <rdfs:subClassOf rdf:resource="http://human.owl#NCI_C13031"/>
    <rdfs:subClassOf>
        <owl:Restriction>
            <owl:onProperty rdf:resource="http://human.owl#UNDEFINED_part_of"/>
            <owl:someValuesFrom rdf:resource="http://human.owl#NCI_C12353"/>
        </owl:Restriction>
    </rdfs:subClassOf>
    <oboInOwl:hasRelatedSynonym rdf:resource="http://human.owl#genid6200"/>
</owl:Class>

onto.classes()返回human.NCI_C13031。我想要 Python 列表中“subiculum”的 LABEL 值。

文档说,owlready2可以通过调用onto.search(label = "XXXXXX") (X = labelname). 但是,我想要反过来。我需要检索标签。我似乎找不到使用 owlready2 的方法。有没有办法在有/没有owlready2的情况下做到这一点?我知道 owlready2 中有一个 OWL/RDF 解析器(owlready 没有),我可以成功读取文件。我只需要某个标签查询即可工作。

请考虑我需要在 Python 中执行此操作,而且我对 Python 也很陌生。我尝试了 onspy,但它似乎没有本体查询的潜​​力,仅用于本体文档(如果我错了,请纠正我)。

谢谢!

编辑:我自己解决了。要获取标签,请将 设置set render function 为自定义函数,该函数接受一个实体并返回其标签。它全部在 owlready 文档中:https://pythonhosted.org/Owlready2/annotations.html#custom-rendering-of- entities`

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如果您有一个 protege 实体的实例,<class 'owlready2.entity.ThingClass'>您可以使用以下内容:entity.label获取 label 的值。

于 2020-10-29T07:29:33.663 回答