问题标签 [ncdf4]

我正在尝试打开数千个 netcdf 文件并将数据提取到可以保存为 csv 文件的数据框中。

因此，在将所有 ncdf 文件名作为列表放入 csv 文件后，我最终使用此代码创建了一个数据框，其中填充了来自 ncdf 文件的数据。

但我只获得第一行的准确数据，并为其余行填写一系列数字（1 到 28412）。我认为我的错误在于我编写代码的 nc_close 组件的方式。有任何想法吗？

我正在尝试使用 R 中的raster包从 NASA OPenDAP 服务器获取 TRMM 数据。最初我在身份验证方面遇到了一些困难，但该问题已解决。

NASA OPenDAP 服务器将 TRMM 3B42_daily 数据发布为单独的文件，每天一个，一个汇总的年度数据（使用 ncml）。所以，我现在的问题是，使用 Rraster包和身份验证文件.dodsrc，.netrc我可以下载单个 NetCDF 文件，但我无法下载聚合数据。

所以，这有效：

这不会：

并给我错误信息：

是否可以从发布聚合数据的 OPenDAP 服务器获取数据？

ncdim_def来自 package的命令ncdf4旨在鼓励自动创建与尺寸相关的坐标变量，这是一个非常好的做法。

但是，它只允许为此坐标变量创建“双”或“整数”精度。由于外部原因，我需要将坐标变量“时间”写为浮点数。

为此，我使用以下结构，其中包括与尺寸定义分开创建坐标变量（即使用create_dimvar = FALSE文档中描述的选项ncdim_def）

但是，这会返回错误：

实际上，生成的 netcdf 显示 (ncdump) ：

我想我需要在创建时强制无限“时间”维度的维度，但我不明白如何在ncdf4.

我有一个结构如下的 netcdf 文件：

文件 AA_14.nc (NC_FORMAT_CLASSIC)：

在变量“doy”中，我有 100、101 和 102 年的 3 天我想提取 101 年的所有变量。我尝试使用 nco 的 ncks 来完成，但我没有管理。

哪种方法是正确的？谢谢。

我在一个文件夹中有几个 ncdf 文件。我想将它们单独堆叠在一个循环中并在 R 中打印它们的信息。

我有以下代码：

通过在命令行中键入 ff[1]，我希望得到：

但我得到以下信息：

我看不到我的错误在哪里。谢谢你的帮助。

我有很多.nc带有变量的文件"skt"。我想要做的是将所有这些文件作为光栅砖加载到 R 中，并且除了变量之外还有时间。我试图用 来做到这一点levels，但没有成功。我真的很感激任何帮助。

我目前正在尝试使用与线相关的图绘制降水数据（y 轴值）和使用 R 的累积排放数据（x 轴）。这两个数据都可以在我已经阅读的两个单独的 netCDF 文件中找到最终，我想做的是绘制降水作为选定位置的累积排放的函数（如下面的代码所示）。到目前为止，我已经使用了以下代码（使用 # 突出显示每个步骤）：

print(Model1) 产生以下结果（我读入变量 #2 以供现在使用）：

文件累积排放量_1pctCO2.nc (NC_FORMAT_NETCDF4)：

print(Model2) 产生以下结果：

文件 MaxPrecCCCMACanESM21pctCO2.nc (NC_FORMAT_NETCDF4)：

所以，总的来说，这就是我想要实现的目标，但我不确定我在 ggplot 函数中所做的是否是正确的方法。

对此的任何帮助将不胜感激！

谢谢

我在 R 中工作，尝试使用此处找到的数据（https://datadryad.org/resource/doi:10.5061/dryad.dk1j0；两个顶级文件）创建一个类似于此的表：[administrative_name, GDP2010, GDP2011 ....., GDP 2015]

据我所知，我需要从“admin_areas_GDP_HDI.nc”文件中提取行政单位的名称，并将它们与 GDP_per_capita_PPP_1990_2015.nc 文件中的年度数据结合起来。

使用 ncdf4 包，我设法打开档案，并获取所有属性和变量，但是我不知道如何访问数据并提取它。

我整天都在尝试访问数据，但我对 NetCDF 存档的经验有限，并且没有设法提取数据。任何指针都会帮助我！

我已经从这里下载了 1 月份的海面温度https://oceancolor.gsfc.nasa.gov/l3/

并将其导入R。

我知道如何使用 extent(ymax, ymin, xmax,xmin) 进行裁剪，但我不知道如何仅针对一个站点 (53.9S, 174,1W) 或最接近该坐标的站点进行裁剪。有没有办法只为一个站点裁剪数据？

val <- extract(174.1,53.9) .local(x, y, ...) 中的错误：范围不重叠

我希望能够绘制 12 个月内该特定位置的 SST 变化

谢谢，

我正在测试一些将矩阵转换为 NetCDF 文件的代码。但是输出会产生一个奇怪的光栅/矩阵，它的顺序完全不同。知道原因吗？

这是矩阵

这是创建 netCDF 的代码

输出没有错误。但是当我使用打开 netCDF 文件时raster()，看起来矩阵的顺序完全不同

使用矩阵将输出显示为as.matrix(outputNetCDf)

我在我的实际数据集（非常大）上使用了相同的代码，并且输出栅格是颠倒的。代码中有什么我遗漏的吗？非常感谢您的帮助！