问题标签 [multcompview]

网站上提到broom它可以用于TukeyHSD和multcomp（见这里）。但是，我无法弄清楚如何使用broomforTukeyHSD和multcomp.

请参阅下面给出的 MWE。

所以我已经将multcomp和multcompview包安装到了 RStudio；但是，当我使用 cld 函数时，我不断收到此错误

我的数据如下：

cld 的正确格式应该是什么？我希望结果从最低到最高均值，然后在字母下方进行成对比较。

我不明白 multcompView 的函数 multcompletters 中的字母顺序。根据文档，它应该根据该组的平均值。在以下示例中，中间组得到 c（来自 abc）并且应该得到 b。这是一个错误吗？

我正在使用 glht 函数 (multcomp) 来计算回归后系数线性组合的点估计值和标准误差。回归包括一个四向交互项，并非所有组合都有数据点，因此它们的系数缺失。当我使用 glht 函数时，我收到以下错误消息：

modelparm.default(model, ...) 中的错误：

系数和协方差矩阵的维度不匹配

当我对不包括 NA 系数的回归结果（例如没有 4 路交互）做同样的事情时， glht 命令有效，这让我认为 NA 行是问题所在。我已经在 Stata 中做到了这一点并且它有效，但我不确定 Stata 对这些 NA 行做了什么。

回归

多压缩包

爱尔兰的线性组合*优秀的英语

这些是回归结果的一部分

我正在分析一组多变量数据，首先将其与对照进行比较，然后比较不同的治疗方法。数据可以在这里找到。

为了与控件进行比较，我使用的是ggpubr：

但是，当我进行成对比较时，我会分别进行每个分析

然后我aggregate把所有的图表都放在一张里。但是，我想将成对比较添加到组合图中（如第一个代码中所示）。

有没有办法将 cld 添加到组合图中？

我正在按照本教程和本问题 1和问题 2绘制带有刻面的双向箱线图，字母表示处理之间的静态差异。有谁知道如何做这种图表？

关于我的尝试的一些代码：

我收到此错误

quantile.default(X[[i]], ...) 中的错误：不允许使用因子

我知道我必须输入数字，而不是分位数的因素，但我不知道我是否修复了该错误，它会出现在我的图表中的字母。

我正在尝试使用 lme4 和 glht 对线性混合模型进行 Dunnett 测试。我设置并运行模型如下

当我运行它时，我得到以下输出

有人能解释一下所有的治疗方法是如何以相同的 Std 告终的吗？错误？有什么我做错了吗？

我为农业数据拟合了一个线性混合模型，通过传递weights = varIdent(...)给 lme. lsmeans显示与显着差异不一致的标准误差。

我的代码示例如下。可在此处找到重现输出的数据。

品种怎么可能Brown没有显着差异Golden？这可以接受吗？有没有人看到类似的结果？

我试图在条形图中可视化我的方差分析和事后 Tukey 的统计测量。到目前为止，这已经解决了，但是我的字母顺序错误，“mit Downsampling”（2）栏应该是与其他人不同的，而不是第一个“ohne Sampling”。

我正在使用的代码：

因此，通过查看a.sd.lda表格，您已经可以看到错误的字母为 a、b、b、b 而不是 a、b、a、a。同样通过检查 tukey 结果，ohne Sampling、mit Upsampling 和 Gewichtung 之间没有显着差异。所以我猜这个multcompLetters4()功能导致了错误。

我会非常感谢任何建议！！！

寻找答案时，我发现了这个 stackoverflow 条目（R multcompView 包中的错误 Tukey-letter ordering），但没有一个答案能解决我的问题。

只是为了总结一下，这是可视化的代码，尽管我的代码中的错误必须在上面

multcompLetter4() 函数和相关的源代码可以在这里找到：https ://rdrr.io/cran/multcompView/f/

我有这个例子，我想对治疗进行多重比较。这是数据：

这就是我所做的：

运行它pairs.comp.glht.cld给了我我需要的输出。

我正在寻找最小差异的值来调用差异并显示不同的字母。我假设该值应该在 this object:pairs.comp.glht或 herepairs.comp.glht.cld中，但我无法提取该值。