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mdanalysis - 如何使用 MDAnalysis 计算蛋白质的质心？
我的情况有点不寻常。根据残基名称，有七种不同的蛋白质存储在一个文件中。每种蛋白质具有不同的序列长度。现在我需要计算每个蛋白质的质心并生成时间序列数据。我知道如何处理单个蛋白质，但不知道如何处理多个蛋白质系统。对于单一蛋白质，我可以这样做：
数据文件可在此处公开获得。可以使用 来检查拓扑文件中的残基序列grep "^ *1[A-Z]" -B1 lp400final.gro | grep -v "^ *1[A-Z]"，输出：
第一个蛋白质的序列长度为 38 个残基，它有自己的副本，然后是第二个蛋白质，依此类推。现在我想在每个时间范围内获得每种蛋白质的 COM 并将其构建成一个时间序列。除了蛋白质拓扑文件还包含 DPPC 粒子。Could someone help me how to do this?谢谢！
为了确保输出轨迹正确，它看起来像这样在此处输入链接描述