问题标签 [libspatialindex]

在使用空间库成功构建 R* 树后，将记录一一插入 250 万次，我试图通过批量加载创建 R* 树。我实现了 DBStream 类以迭代地将数据提供给 BulkLoader。本质上，它调用以下方法并为 Bulkloader 准备一个 Data（代码中的 d 变量）对象：

我初始化 DBStream 对象并通过以下方式调用批量加载：

批量加载调用我的 next() 和 hasNext() 函数，检索我的数据，对其进行排序，然后在构建阶段分割故障。有什么线索吗？是的，错误是：

我通过以下方式在空间索引库的帮助下创建了一个主内存 R* 索引（DBStream 实现了 bulkLoading 的接口）

我的数据是只读的，也就是说，我只想构建树一次，保存它，并在每次使用我的程序时从持久存储重新加载。显然，我可以自己保存和加载 memStorage，但是如何从中重新创建 RTree？

我正在使用空间索引（http://libspatialindex.github.com/）库批量加载 R 树：

以下是有关已构建树的信息的输出：

现在我正在尝试加载我保存在磁盘中的内容：

并且树只有一个节点（树的输出是：）

我做错了什么？为什么我不从磁盘加载整个树？

我正在使用“libspatialindex”库来创建 R-tree 索引。我的数据是二维的，具有以下值：

数据描述如下：

我正在尝试将上述数据批量加载到 R-Tree 中。为此，我使用来自 libspatialindex 的以下测试代码。但是，我不知道作为对象传递给 * MyDataStream stream(argv[1]);的输入数据文件的格式应该是什么。*

我正在使用的测试代码是：

我正在使用 libspatialindex ( http://libspatialindex.github.io/ ) 库来构建 r-tree：我正在使用以下代码批量加载 r-tree 中的 (latitude,longitude)。我需要批量加载给定地点的（id、纬度、经度）。以下代码执行批量加载。但我不知道为什么它不接受输入文件——没有关于 libspatial 索引的文档，因此我很困惑。

对于输入，我使用以下文件：

但我收到以下错误：

有人可以帮我看看我哪里出错了！！

我有一堆点，我需要对它们进行最近邻搜索，所以我使用的是 libSpatialIndex。代码非常简单，库为我提供了将数据存储在磁盘上的选项，但我无法加载它。

编码：

程序在此之后立即结束。确实在内存中创建了两个文件，“indexTest.dat”8.8MB 和“indexTest.idx”0kB 但是如果我在初始化后立即进行查询或检查索引中的元素数量，它会失败并且只有一个节点树。

我已经看过这些问题：（ 重新）使用空间索引库加载 R 树

C++ 空间索引库：从磁盘加载/存储主内存 RTree

但是我没有成功，因为我使用的是索引，当我直接使用 RTree 时，数据插入速度要慢 1000 倍。

为了使用 Python 高效地分析空间数据，我使用了 rtree 空间索引库，依赖于 libspatialindex C 库。

我能够使用!pip install rtree.

正如预期的那样，这还不够，因为需要先安装 libspatialindex，import rtree结果如下所示：

OSError: Could not find libspatialindex_c library file

我不确定是否以及如何在 Google Collaboratory 中安装外部库。按照https://github.com/libspatialindex/libspatialindex/wiki/1.-Getting-Started我设法运行!curl -L http://download.osgeo.org/libspatialindex/spatialindex-src-1.8.5.tar.gz | tar xz但我没有配置权限： !spatialindex-src-1.8.5/configure

/bin/sh: 1: spatialindex-src-1.8.5/configure: Permission denied

系统：Mac OSX

我是 Python 的新用户，目前正在探索 GIS。尝试使用 geopandas 读取形状文件，但我得到：OSError：找不到 libspatialindex_c 库文件

正常使用 Python 3.7，但由于 geopandas 在这方面存在依赖性问题，因此按照此处的建议在 Python2 上运行。

我在这里所做的是使用mac终端，使用python2创建新环境并在那里安装geopandas并尝试读取形状文件。

conda create -n mytest python=2.7 geopandas -c conda-forge

源激活 mytest

导入地理熊猫

geopandas.read_file('Random_points_twitter.shp')

0 0 5.27735 50.25398 0

1 1 3.29896 51.32356 1

2 2 3.29896 51.32356 2

我可以在终端中成功阅读此内容。但是在浏览器中，它返回一个错误。

我所做的是首先在我的新环境上安装 jupyter 并在浏览器上运行笔记本（代码如下）

(mytest) conda install jupyter

(mytest) jupyter-notebook

在带有新笔记本的浏览器上，尝试导入和读取形状文件（类似于我在终端中所做的），但它给了我这个错误：

#

() ----> 1 导入 geopandas 中的 OSError Traceback (最近一次调用最后一次)

/Users/rldy/anaconda/lib/python2.7/site-packages/geopandas/ init .py in () ----> 1 from geopandas.geoseries 从 geopandas.geodataframe 导入 GeoSeries 2 从 geopandas.io 导入 GeoDataFrame 3 4 .file 从 geopandas.io.sql 导入 read_file 5 导入 read_postgis

/Users/rldy/anaconda/lib/python2.7/site-packages/geopandas/geoseries.py in () 10 11 from geopandas.plotting import plot_series ---> 12 from geopandas.base import GeoPandasBase, _series_unary_op, _CoordinateIndexer 13 14

/Users/rldy/anaconda/lib/python2.7/site-packages/geopandas/base.py in () 12 13 try: ---> 14 from rtree.core import RTreeError 15 HAS_SINDEX = True 16 except ImportError:

/Users/rldy/anaconda/lib/python2.7/site-packages/rtree/ init .py in () ----> 1 from .index import Rtree 2 3 from .core import rt 4 5 version = '0.8. 3'

/Users/rldy/anaconda/lib/python2.7/site-packages/rtree/index.py in () 3 import pprint 4 ----> 5 from . 导入核心 6 导入 ctypes 7 尝试：

/Users/rldy/anaconda/lib/python2.7/site-packages/rtree/core.py in () 123 124 如果 lib_name 为 None：--> 125 raise OSError("Could not find libspatialindex_c library file") 126 127 rt = ctypes.CDLL(lib_name)

OSError: 找不到 libspatialindex_c 库文件

#

我的 conda 列表（如下）已经安装了 libspatial，但是当使用浏览器在 Jupyter Notebook 上运行时给我这个错误。有任何想法吗？

我正在 Heroku 上部署一个 GIS 应用程序。我在我的电脑上开发了它，当我部署它时，rtree 不见了。我无法通过 pip 安装它，因为 pip 安装是错误的，正如 rtree 开发人员自己所说的那样。我怎样才能将这种依赖关系融入heroku？

我正在尝试理解libspatialindex源代码。作为 C++ 的新手，我很难理解宏的概念。该库的 C API 包装器sidx_api.cc直接和间接地包括许多头文件，其中两个似乎定义了相同的宏，涉及与动态库的接口，没有“undef”：

工具.h

sidx_export.h

我相信重新定义没有“undef”的宏是有问题的，例如，如这里和这里所讨论的。我在这里错过了什么吗？谢谢。