问题标签 [kernel-density]

我对 R 真的很陌生，并且在浏览 SO 和其他 R 资源的两个晚上一直在努力解决这个问题......我有一个数据集，其中有两个矩阵，一个用于股市观察（股票收益）和一个用于权重（指数市值的一部分）。在这两种情况下，列是该股票代码的数据，行是该月的数据。

我希望使用 density() 在第二步中使用 Kullback Leibler 散度来比较行（每月收益）。我的问题是我无法找出一种语法来移动使用的权重行 w[i,]（因为我一直在使用 apply() / lapply()，这可能是问题所在）然后存储 density() 输出矩阵整齐地列在一个列表中。我的结果只是最终成为第一个重量行而不是整体。

我也尝试过使用：

由于某种原因没有输出密度（）的概率/ y值输出......

我将不胜感激任何帮助！

我需要使用 R 绘制二维密度图filled.contour。我有两个数据集并将它们绘制成两个fill.contour. 我在这里没有 10 名声望，也无法在这里发布我的数据。我在这里发布我的代码，希望它可以帮助找出问题。

问题是我发现在这两个图中，相同密度的颜色不一样。例如，在第一个图中，密度 0.06 是黄色，但在第二个图中，密度 0.06 是蓝色。我在这两个图中使用相同的色标。为了使这两个图具有可比性，我想在这两个图中以相同的密度使用相同的颜色。

任何人都可以告诉我，我应该如何更改我的设置以使其正确？

我有一个数据框，想根据两列做一个叠加密度图。我希望颜色是透明的。我已经使用填充选项完成了这项工作，并且基本上将填充指定为一个因子列。默认情况下，当您有一个因子列时，所有填充都是透明的。

但是在这种没有因素的情况下，我们如何用透明填充它。

我尝试添加geom_density(alpha=0.4)，但没有任何好处。

这是我在 R 社区的第一篇文章，如果它很愚蠢，请原谅我。我想在 ggplot2 中使用函数 geom_density2d 和 stat_density2d 来绘制内核密度估计，但问题是它们无法处理加权数据。据我了解，这两个函数调用包 MASS 中的函数 kde2d 来进行内核密度估计。并且 kde2d 不将数据权重作为参数。

现在，我找到了这个 kde2d 的修改版本http://www.inside-r.org/node/226757，它以权重为参数，基于 kde2d 的源代码。这个函数的代码：

我想让函数 geom_density2d 和 stat_density2d 调用 kd2d.weighted 而不是 kde2d，从而使它们接受加权数据。

我从未更改现有 R 包中的任何功能，所以我的问题是最简单的方法是什么？

我的数据中有一个极端值。如何仅显示数据“重要”部分的密度图。我只想显示 x 轴，比如说 -5 到 +5%。

与 y 轴上的箱线图相同

我知道

但在这里我希望 y 轴的范围更小。这怎么可能？

谢谢！

我现在正在使用 scikit learn 和 python 几天，尤其是 KernelDensity。拟合模型后，我想评估新点的概率。方法 score() 是为此而设计的，但显然不起作用，因为当我将数组作为条目 1 数字是输出时。我使用 score_samples() 但它很慢。

我认为这个分数不起作用，但我没有改进它的技能。如果您有任何想法，请告诉我

我正在寻找创建多个密度图，以制作“动画热图”。

由于动画的每一帧都应该具有可比性，因此我希望每个图形上的密度 - > 颜色映射对于所有图形都相同，即使每个图形的数​​据范围都发生变化。

这是我用于每个单独图表的代码：

想象一下，我使用相同的代码，但“this_df”在每一帧上都发生了变化。所以在一张图中，密度范围可能从 0 到 4e-4。另一方面，密度范围从 0 到 4e-2。

默认情况下，ggplot 将为每个计算一个不同的密度 -> 颜色映射。但这意味着这两个图表——动画的两帧——并没有真正的可比性。如果这是直方图或密度图，我只需调用 coord_cartesian 并更改 x 和 y 限制。但是对于密度图，我不知道如何更改比例。

我能找到的最接近的是：

用 alpha 通道覆盖两个 ggplot2 stat_density2d 图

但是我没有将两个密度图放在同一张图上的选项，因为我希望它们是不同的框架。

任何帮助将不胜感激！

编辑：

这是一个可重现的示例：

我正在尝试使用以下函数绘制密度。然而它并没有达到我想要的外观......我想知道是否有办法让情节的左右边缘平滑到基线（这样它就不再有方形边缘了左右。）

我试图在“R”中运行此代码以绘制密度函数内核平滑，然后将该图保存为“eps”文件：

问题是，当我以 eps 格式保存绘图时，它只以一种颜色（黄色）显示绘图，而不是显示不同密度的多种颜色（黄色、橙色、红色......）......（绘图在 R 中很好，但是当我将其保存为 eps 时，颜色会改变）你知道这段代码有什么问题吗，或者你能介绍一下其他可以将我在 R 中生成的绘图保存为 pdf 或 eps 的函数吗? （因为它是一个交互式 RGL 图，我不能使用 pdf() 函数。我也尝试了 rgl.snapshot，但每次它崩溃并且似乎不起作用......以下是我的数据的一部分：（x，y，z点的位置）

我一直在使用“ks”包和“rgl”包来生成 3D 内核密度估计和这些的 3D 图。第一部分效果很好（下面的简短示例）。我无法弄清楚的是，是否可以首先提取用于构建内核的给定 xyz 位置的内核值。换句话说，提取 3D 图中点的值，类似于用于 'raster' 包中的 2D 表面的提取命令。有没有人有做这样的事情的经验可以为我指明正确的方向？非常感谢。-DJ