问题标签 [itk]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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python - 如何使用python将itk图像文件转换为vtk?

我正在尝试通过 itk 读取一个 nrrd 文件并通过 vtk 显示它。但是我在将itk转换为vtk时遇到了一些麻烦。

我收到了消息

我正在使用itk3.20,python2.7。我该如何解决?

问候。

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c++ - 切换到 ITK 4 后出现 Qt 错误

我们有一个使用 ITK 3.10.1 和 Qt 4.5 的 Windows7 VS2008 C++ 应用程序。我们运行 CMake 2.6-patch 4 来生成 ITK 和我们的应用程序 C++ 项目,一切运行正常。现在我切换到 ITK 4.1.0,为此我必须将 CMake 从 2.6 升级到 2.8,并使用这个 CMake 生成 ITK 4.5 和我们的应用程序。现在 ITK 编译正常,但应用程序没有。错误对话框显示“没有为平台 Win32 分配给此项目的 Qt 版本。请使用‘更改 Qt 版本’功能并为此平台选择有效的 Qt 版本。”。平台是 Win32,现在仍然是;电脑也是一样的,我没碰Qt。显然我没有做应该做的事或不应该做的事。

任何帮助将不胜感激。

问候。

麦克风

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itk - 当我有一条骨架线和每个像素半径时,如何使用 ITK 扩展到正常容器?

我对血管进行了细化手术,现在我正在尝试重建它。

当我有每个像素的骨架线和半径值时,如何将它们扩展到 ITK 中的正常血管?

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rotation - 禁用 Z 轴旋转

我正在开发一个使用 VTK、ITK 和 QT 注册和显示 3D DICOM 图像的应用程序。

我在注册部分遇到了一些问题。

为此,我使用了 ScaleVersor3DTransform、VersorTransformOptimizer、NormalizedCorrelationImageToImageMetric 和 LinearInterpolateImageFunction。

问题是我需要锁定或禁用 Z 轴上的旋转。唯一可以旋转的轴是 X 和 Y。

我尝试从变换中获取 GetNumberOfParameters() 并将其所有值设置为 1.0(尽管我认为 Z 旋转是数组上的第三个位置),但这似乎不起作用。

我有哪些选择?

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itk - 关于术语“图像标签文件”(ITK)的不确定性

我最近一直在使用 ITK,但我并不是很熟练,所以如果我的问题看起来很幼稚,我深表歉意!这是问题:我已经在我的机器(Win 7 x64)上成功构建了几个 ITK 示例,然后尝试运行一个示例来测试结果,因为我对分水岭分割感兴趣我尝试了它(WS3D),但是除了必须定义的输入和输出图像文件外,还需要定义一个名为:LabelImageFile 的附加参数,就像这样:

WS3D 输入图像文件标签图像文件输出图像文件

不幸的是,我不知道什么是 LabelImageFile,我怎样才能获得特定图像的标签图像?如果有人能帮助我,我将非常感激,非常感谢,Shawn

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c++ - Segfault after the return 0;

I would like to use ITK for a simple color-ratio program, but I get a segfault after the return 0; of the main function. here is my code.

It compiles and links without any error messages but I have a segfault during execution. By executing the program line by line using gdb, I pinpionted the segfault to the last line of the program: after return 0;

Here is the backtrace

and when checking with valgrind:

Even with 36000 useless try/catch statments, I still get that same segmentation fault after the main.

Can anyone please help me?

Thank you in advance

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image - 3d 区域增长分割

我正在尝试使用 itk 和 vtk 对 3d 数据中的纤维对象进行分割。区域增长是否适用于此任务。
我的主要问题是路口。如果两根纤维相互接触(仅轻微接触),RG 无法将它们分开。
这个问题有什么有用的预处理方法吗?
或者可能有不同的分割技术?

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c# - 使用 SimpleITK for C# 读取 RAW 图像文件

如何使用 SimpleITK for C# 读取 RAW 文件?

我在 Windows(64 位)上使用 SimpleITK C# 版本 0.5.1

我的代码是:

例如,它适用于 .png 或分析图像,但不适用于 RAW 图像。

我收到以下错误:

我了解 ImageFileReader 无法识别文件类型。由于标准 ITK 模板是隐藏的,有没有办法在 SimpleITK 中传递图像类型和图像参数?

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c# - 使用 SimpleITK 0.5.1 C# Windows 打开 MINC 2.0 图像时出错

我正在尝试使用 SimpleITK 0.5.1 C# 版本加载 MINC 2.0 图像

我收到以下错误:

我的代码如下:

你有什么建议会导致这样的错误吗?我应该安装一些额外的库吗?

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windows - CMake 内部错误 (TEST_BIG_ENDIAN)

我在 Windows 7 64 位上使用 CMake(尽管我正在编译 32 位)。

我正在尝试安装vxl库,当我(从界面)运行 CMake 时,出现以下错误:

我将 VS 2008 的默认编译器用于 32 位。它看起来像一个内部 CMake 错误,我在互联网上找不到任何有用的东西。问题是当我尝试重新配置-已经安装的-ITK 库时,我得到了同样的错误

注意:当我第一次尝试配置 CMake 时,我得到了无数类型的错误:

创建 CMakeCache 并设置 cmake 变量后,它们不会再次出现。在第二个“配置”中尝试只出现第一个错误。

我真的不知道如何继续,有人可以帮忙吗?先感谢您。