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我正在寻找一种方法将我的数据分成组，每个组由我定义的相同窗口大小组成。

例如，如果我想要一个 20 的窗口大小，那么组将是：1-20、11-30、21-40。
只要组的大小不超过 20，它可以继续添加到同一个组.

我尝试使用 split 功能，但无法使用它实现这种方式。有没有解决的办法？

我在尝试通过降序来按元素排序列表时遇到困难......

我有一个 ByPos_Mindex 对象或来自 1000 个 IRange 对象 (CG_seqP) 的列表

长度（这些 IRange 中的 1000 个）

然后我将其更改为仅包含起始整数的列表（我想要的）

（其中 1000 个）

当我尝试使用排序元素列表时会出现问题

我得到一个我认为是行号的列表，所以如果第一个 IRAnge 对象是 27，我会得到这个......

所以减少已经奏效，但不适用于我的实际元素列表>？

任何建议，提前谢谢。

我正在尝试根据现有行的重叠时间段创建新行。例如，我想把这个：

变成这样：

我一直在研究 IRange，因为似乎 disjoin() 可能是一个可能的解决方案，但我看不到任何继承/合并“Prod”数据的方法。

我也一直在尝试使用 dplyr 中的领先/滞后和聚集/合并周期来勾勒出一些东西，但也值得注意的是，我可能有超过 2 个“Prod”重叠的实例，然后逻辑就得到了凌乱。

有没有合理的方法来做到这一点？任何帮助是极大的赞赏！

我有以下df

我已经按 ID 添加了每组（a、b、c、d）的间隔。首先，我已将开始日期和结束日期转换为润滑间隔。如果没有重叠，我想绘制间隔并计算每组结束与下一组开始之间的时间差（以天为单位）。我尝试使用 IRanges 包并将日期转换为整数（如此处使用的（链接）），但对我不起作用。

我的原始 df 出现此错误：

有人有使用其他软件包的另一种解决方案吗？

我将从一个示例开始，然后描述我尝试使用的逻辑。

我有两个IRanges跨越相同总范围的普通对象，但可能在不同数量的范围内这样做。每个IRanges人都有一个mcol，但那mcol是不同的IRanges。

您可以看到这两个IRanges范围都从 1 到 167，但a只有一个范围和b三个范围。我想将它们结合起来得到这样的输出：

输出disjoin与输入类似，但它保留mcols，甚至扩展它们，以使输出范围与mcol导致它的输入范围具有相同的值。

这是我昨天提出的一个问题的后续，现在扩展到包括 2 个以上的输入。我能够在 SO 上找到两个 相关的答案，但没有一个提供足够的信息让我以高效的方式解决这个问题。

我想将 IRanges 列表组合成一个 IRanges。这是一个示例输入：

为了便于复制，dput此列表位于我的帖子末尾。

我想要的输出是：

您可以看到输出有点像输入的分离，但是 mcols 传播通过，因此每个输出行都有输入行的 mcols “引起”它。

这是我的解决方案，它有效，但速度很慢。

这是示例输入的 dput：

正如我所料，我很难计算间隔的重叠。这是一个 R data.table，其间隔由开始到结束定义：

以下是我如何考虑这些间隔的重叠，从 0 到 20：

所以，我想通过算法输出这个。就像是：

但是，我无法foverlaps()在 R data.table 或IRanges.

为了计算某个时间间隔内的重叠，这些似乎都不相关。

调查IRanges也不能完全给出预期的重叠间隔计数：

如何计算重叠间隔？

在 GenomicRanges 中，一个有趣的问题是基因岛的识别。

我试图找到相邻范围不超过一定距离的最大范围子集。为了解决这个问题，我尝试根据各个范围之间的差异来分配组。

我在 IRanges 包中搜索了合适的方法，但到目前为止我还没有成功。

根据分配的组，可以找到最大的组。你知道任何更好的解决方案，避免 for 循环吗？

我有一些数据结构有点像这样：

我最终通过以下步骤将其用作 IRange 对象：

现在我希望能够将 x03 作为列存储在 data.frame 中，其中包含一些相关信息，例如：

这毫不奇怪地告诉我我有不同数量的行，但是，我觉得我已经看到导入到 R 中的 JSON 模仿了我想要的那种结构，其中一个参差不齐的列表位于 data.frame 的列中。这是可能的操作吗？

我有两个床文件作为 R 中的数据框，我想将所有重叠区域相互映射（类似于最接近的床工具能够做的事情）。

床A：

床B：

卧床：

现在，我发现了这个非常相似的问题，建议使用 iRanges。使用建议的方式似乎可行，但我不知道如何将输出转换为像“BedOut”这样的数据框。