问题标签 [gtsummary]

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gtsummary - 是否可以将 tbl_regression 函数与具有随机效应的 lmer 函数一起使用?

我研究添加了杀菌剂的一些分子(“环”)的抗真菌活性,我想评估这些环的影响及其浓度比。CMI 是一个定量变量,所有其他变量都是因素。

我有这个脚本:

我想知道我是否可以将tbl_regression()( library(gtsummary)) 与我的lmer()?

如果是,我必须为指数项指定什么?如果我写exponentiate=FALSE,我得到的值与经典中的估计值相同summary(mod)

谢谢您的帮助

斯蒂菲

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r - R/gtsummary:排除一些 p 值并更改脚注

有谁知道是否可以从汇总表(tbl_summary()with add_p())中排除一些 p 值?

另外,我们可以更改有关所用测试的脚注吗?

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ms-word - 使用 gtsummary 和 flextable 在 rmarkdown 中生成表

大多数合作者更喜欢 word 格式的表格。随着 rmarkdown、knitr、gtsummary 和 flextable 的出现,这终于成熟了,但我无法在不求助于手动设置缩进的情况下生成下面的最终表格。我认为下面的表格在行之间留下了太多的空气,但我无法弄清楚如何以编程方式将行间距设置得更紧(尝试了 autofit、height、height_all、hrule 而没有获得所需的输出)。相反,我使用 word 中的紧凑样式来生成下面的 tbl 2。但是,我必须手动插入 cyl 类别的缩进。有人知道如何以编程方式完成吗?


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gtsummary - 如何使用 R 包“gtsummary”在汇总表中生成 t 值、F 值或卡方?

我正在使用优秀的 R 包“gtsummary”创建汇总表,它确实对我有效和准确地生成汇总表有很大帮助。但我想知道是否可以像 p 值一样自动生成一些统计数据,例如 t 值、F 值和卡方?

这是使用“gtsummary”生成的汇总表

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gtsummary - 为什么函数“round”不适用于 p 值的数字?以及如何使用“gtsummary”调整汇总表中的百分比数字?

当我为 add_p() 创建一个“自定义 pvalue 函数”时,我尝试调整 p 值的数字,但发现函数“round”不起作用。(参见代码“result$p <- round(result$p, 3)”)

此外,我发现我无法更改汇总表中计数百分比的数字。

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r - 如何修改 gtsummary 包中的表头?

非常简单的问题,但我找不到直接的方法。我想tbl_summary在第一列中将对象的默认文本更改为“变量”而不是“特征”。例子:

查看文档,看起来这些信息存储在 a 中.$table_header object,我可以直接修改它,但我想知道是否有一种简单的方法来更改标题名称。该函数modify_header()看起来很有希望,但它似乎无法更改列的名称。

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gtsummary - 如何修改“gtsummary”中“all_categorical()”定义的默认变量类型?什么时候需要序数变量的平均值?

默认情况下,变量“Var2”已设置为分类变量,而有时需要平均值(sd)。所以我对如何修改它很感兴趣。

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r - 从 gtsummary 包中的 tbl_summary 对象获取 LaTex 输出的最佳方法

我正在尝试准备好文档发布,并在 LaTeX 中做所有事情。但是,我刚刚注意到gtsummary它的表格还不支持 LaTeX 输出。我想知道将 HTML 表格转换为 LaTeX 的最佳方法是什么?

一个想法是到像https://tableconvert.com/这样的网站并从 HTML 转换。

两个问题:

  1. 我如何从gt对象中实际输出原始 HTML 代码来执行此操作?R 自动格式化 tbl_summary 对象,我没有看到任何用于获取原始 html 的辅助函数。

  2. 对于需要在 LaTex 中提交的出版物,是否有更好的方法将表格转换为 LaTeX?

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gtsummary - 在 GT 回归中设置指定的因子水平作为参考?

我正在使用 gtsummary 包从逻辑回归生成表。

例如,我想使用试验数据中的阶段级别“T3”作为参考级别,而不是默认的“T1”。我怎样才能在这个示例代码中做到这一点?

我的目标是对单变量和多变量逻辑回归都这样做,所以我假设答案适用于这两种情况。

真诚的,耐莉

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r - 如何使用 R 包“gtsummary”在汇总表中生成效果大小 [90%CI]?

我正在使用 R 包“gtsummary”创建汇总表。这实际上非常好。add_stat 函数为您提供了很大的自由来包含附加组件。例如,在我所在的地区,我们想用置信区间 (ES [90% CI]) 告知效应大小。所以,我想帮助包括 CI 范围。我实现的代码可以正常工作,但没有数字控制,也没有 CI 范围。