gtsummary - 是否可以将 tbl_regression 函数与具有随机效应的 lmer 函数一起使用？

Question

我研究添加了杀菌剂的一些分子（“环”）的抗真菌活性，我想评估这些环的影响及其浓度比。CMI 是一个定量变量，所有其他变量都是因素。

我有这个脚本：

mod=lmer(CMI ~ cyclo*ratio + (1|fungicide) + (1|strains), data)

我想知道我是否可以将tbl_regression()( library(gtsummary)) 与我的lmer()?

如果是，我必须为指数项指定什么？如果我写exponentiate=FALSE，我得到的值与经典中的估计值相同summary(mod)。

谢谢您的帮助

斯蒂菲

Answer 1

tbl_regression()混合效应模型的默认行为是仅打印固定效应。要查看完整输出，包括随机分量，您需要使用参数覆盖用于整理模型结果的默认函数tidy_fun=。

library(gtsummary)

lme4::lmer(age ~ marker + (1|grade), trial) %>%
  tbl_regression(
    # set the tidying function to broom.mixed::tidy to show random effects
    tidy_fun = broom.mixed::tidy,
  )

如果您愿意，可以使用该label=参数更新为随机组件显示的标签。

默认值为exponentiate = FALSE，因此您无需在tbl_regression()调用中指定。

有关该tidy_fun=参数的更多详细信息，您可以查看此帮助文件：http ://www.danieldsjoberg.com/gtsummary/reference/vetted_models.html

希望这可以帮助！快乐编码！