问题标签 [fenics]

我在 Ubuntu 18.04 上使用 Conda 安装了 Fenics，并在运行他们的ft06_elasticity.py示例时收到以下错误。

我试图在文档中找到解决方案或解决方法，但我什至无法在任何地方找到 nabla_div() 函数描述。

Fenics文档说明如下：

nabla_grad

梯度和散度算子现在有一个前缀 nabla_。这在当前问题中严格来说不是必需的，但如果您将 ∇ 解释为 PDE 表示法中的向量，则通常推荐用于由连续介质力学产生的向量 PDE；请参阅变分公式部分中有关 nabla_grad 的框。

我正在尝试安装一个名为fenicsGoogle Colab 的包。

我都试过了：

和

然后一个简单的import fenics加注ModuleNotFoundError。重新启动运行时并不能解决问题。有什么线索吗？

我有一个 gmsh 的地理文件并将其网格化。然后我想在选定曲面的节点处提取法线向量。这怎么可能？

下面是我的 gmsh 地理文件。

我正在尝试访问保存热方程解的 VTK 文件，但我不知道它在 Colab 中的保存位置。

我试过了;

和

但仍然出现错误。在笔记本中创建的文件存储在哪里？

我正在尝试使用 Fenics 在 python 中构建有限元分析模拟，所有这些我都相当陌生。我有一些张量设置，如下所示：

这反过来又给了我一个错误：

鉴于 as_tensor 的可用文档非常有限，现在有人知道这个错误指的是什么以及如何修复它吗？

我的完整代码如下所示：

看起来fenics 库只能通过 Docker 安装在 Windows 中。我以前从未使用过 Docker，而且我真的很不舒服，因为我偏离了使用 anaconda 的习惯。特别是，我真的很喜欢能够将我的工作分离到项目特定的环境中，在这些环境中我安装必要的包和依赖项，并根据需要完成的工作切换环境。

我也很想使用 fenics，因为它似乎是一个很好的平台来解决 PDE 的数值问题，但我不希望 Docker 接管我的系统。我想将 fenics 限制在我的 anaconda 环境之一，并将其​​与其他 python 库（例如pyvista,fipy和pygmsh根据需要）混合使用。

有没有我可以达成的妥协？是否可以只为选定的 anaconda 环境安装 docker，同时保持其他环境相同？

我读过 docker 并不是真正意义上的一种打包程序以交付给最终用户的方式，但这似乎做了很多。我想运行的各种软件只有两种选择：从源代码构建或 docker。我podman的电脑上有（redhat 7.7），但我的电脑上没有 root 访问权限，而且似乎无法运行任何podman. 这是否可以由我的管理员轻松设置（我需要引导他完成此操作）以便我可以运行这些包？

例如，我下载FENICS，运行安装脚本，然后fenicsproject run我得到一个密码提示：Authentication is required to run programs as a non-logged-in user.或者，我运行命令（在下载页面上提供）

并获得相同的密码提示，但关闭它后我也收到错误消息user namespaces are not enabled in /proc/sys/user/max_user_namespaces。

我在 mac trough Docker 上使用 FEniCS，但在使用 mac 上安装的 Paraview 版本可视化分析结果时遇到问题。这些是我遵循的步骤： 我使用 FEniCS 获得了我的问题的解决方案；然后使用 FEniCS 从 Docker 生成的 .vtu 文件发送到桌面

随后，我打开 ParaView（我直接安装在我的 Mac 上而不是 Docker 上）并打开文件nameoffile.vtu. 我按下Apply，然后出现错误：

ERROR: In /Users/kitware/dashboards/buildbot-slave/a64f5607/build/superbuild/paraview/src/VTK/IO/XML/vtkXMLUnstructuredDataReader.cxx, line 649 vtkXMLUnstructuredGridReader (0x7fc30ff7c440): Error reading cell offsets: Unsupported array type: vtkUnsignedIntArray

谁能解释这个错误是什么意思？

当我尝试在 Linux 机器上使用 Paraview 打开文件时，它工作得很好，没有错误。我是否缺少一些兼容性包？

我正在尝试按照此处的指南将 Python 嵌入到 C++ 中：

https://docs.python.org/3.7/extending/embedding.html

这对于较旧的系统范围的 Python 2.7 安装非常有效。我现在正在尝试使用安装了我想使用的库的特定 Anaconda 环境来做同样的事情。

我的 hello world 示例是

试图通过编译这个

（注 1：包含部分有效，其他标志建议链接标志，请参阅上面链接中的 1.6。）（注 2：我想最后通过 mpic++ 编译，但尝试先进行此操作。）

这给出了输出：

任何帮助/见解表示赞赏。

我目前正在尝试在 jupyter 笔记本中使用 Fenics 解决复数值 PDE，但是当我尝试在 Fenics 中使用复数时遇到了麻烦。

以下是我如何定义变分问题：

我收到以下错误消息：

有人可以帮我吗？顺便说一句，Fenics 可能不是解决复值 PDE 的最佳工具，我想阅读您对此类问题的建议。