问题标签 [drc]
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r - coeftest() 给出了 drc 类对象的错误
我正在尝试重现一个补充示例 2 Continuous response: a dose-response curve from the drc package。
尝试运行时
coeftest(ryegrass.LL.4, vcov = sandwich)
,出现以下错误:
我试图用谷歌搜索错误但没有成功并使用vcov.
代替vcov
(因为 vcov. 在 R 中自动建议,但文章使用 vcov)但仍然得到相同的错误。
任何想法如何解决这个问题?
会话信息:
r - (在 R 中)如何将来自 dr4pl 模型的剂量反应 IC50 值合并到 ggplot2 曲线中?
我在这个网站上得到了帮助,将dr4pl
('''''''的替代品drc
)4参数逻辑剂量反应模型与ggplot结合起来。它工作得非常好,但我希望将每条曲线的 IC50 合并到图中,并输出一个包含这些值的表格。示例数据:
上面将生成一个包含三条曲线的图,每条曲线都有一个拟合的 4pl 模型。我需要 IC50 出现在情节中,或者在其他地方的桌子上,这样我就可以自己把它放到情节中。
提前感谢任何帮助。
2021 年 6 月编辑:
新数据集以帮助调试提供的脚本:
r - 使用drc包,我如何获得40种curveid药物中大于参考药物值的EC50?
我的数据包含关于 40 种药物的剂量反应曲线。通过使用drc包,我可以确认每种药物的EC50值,并且需要提取EC50值大于参考药物的药物。在示例中,只有 4 种药物,因此我可以轻松区分哪些药物具有最佳值。然而,40多种药品,没有分拣是不可能的。
如何提取 summary() 的系数并对其进行处理以轻松区分?我这样做分别适合所有药物的 40 drm() 函数。但我认为有一个更合理的过程。
这是我的示例代码
r - 为什么我的数据在“dr4pl”剂量反应曲线中生成“参数长度为零”?
我正在绘制 4 个参数逻辑曲线。这是一个包含大量曲线的巨大数据集,我的一个输出失败了,因为模型拟合不适用于某些数据。一些数据未能产生曲线并给出
Warning message: Computation failed in 'stat_smooth()': argument is of length zero
这是曲线模型的代码
数据集 1 工作正常(即使曲线很糟糕):
然而数据集 2 产生错误并且没有拟合曲线:
绘图代码:
非常感激任何的帮助!!!
r - 使用 drc 包绘制剂量反应曲线时出错
我正在尝试使用 drc 包拟合四参数逻辑模型来绘制剂量反应曲线。代码如下所示。尝试拟合以下模型时出现错误,请指导我解决问题,谢谢!
optim 中的错误(startVec,opfct,hessian = TRUE,method = optMethod,control = list(maxit = maxIt,:由 optim 提供的非有限值 drmOpt 中的错误(opfct,opdfct1,startVecSc,optMethod,约束,warnVal,:收敛失败的