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python - RDKit：尝试循环枚举时出现“TypeError：‘Mol’对象不可迭代”
我正在尝试使用 RDKit 枚举大型化合物库并将结果输出为 CSV 文件中的单列 SMILES 字符串。我能够成功使用以下代码：
但是，内存使用率非常高。为了减少内存使用量，我尝试执行迭代枚举，在“reactants_1”时取一个分子，将其与“reactants_2”中的所有分子反应，将生成的化合物写入 CSV 文件，然后迭代：
但是，在这种情况下，“prods2 = [Chem.MolToSmiles(x[0]) for x in list(prods)]”这一行出现以下错误：“TypeError: 'Mol' object is not iterable”。在第一个实例中，我能够毫无问题地迭代“Mol”对象。关于如何解决这个问题的任何想法，或者在枚举大型复合集时有任何其他方法可以显着降低 RAM 使用率？