问题标签 [atlas]

我正在编译 numpy 并得到一个错误，所以我认为我需要包含外部库。atlas 安装在 /usr/lib64/atlas 中。由于我无权访问 root，因此我的主目录中安装了所有内容，包括 python 2.6.7。

我假设我更改了 site.cfg 文件，但我只需要将 /usr/lib64/atlas 添加到库目录中。

他们也有 ptcblas 和 ptf77blas 这些在 numpy 中是否支持？

Theano 安装文档指出，如果“BLAS 库可作为动态加载库使用”，theano将默认使用 numpy 中的 BLAS 库。这似乎不适用于我的机器，请参阅错误消息。

• 我如何确定 numpy BLAS 库是否可以动态加载？
• 如果 numpy BLAS 库不可动态加载，我该如何重新编译它们？

请注明，如果您需要更多信息！

错误信息

We did not found a dynamic library into the library_dir of the library we use for blas. If you use ATLAS, make sure to compile it with dynamics library. /usr/bin/ld: cannot find -lblas

附录

除了其他东西之外，theano 库还需要 numpy 和 BLAS库。sudo apt-get install python-numpy python-scipy如果你在 Ubuntu 下安装 numpy，我想它会附带 BLAS 。

这是文件列表/usr/lib64/python2.6/dist-packages/scipy/lib/blas

这是的输出distutils.__config__.show()如下

我使用 Boost::ublas 编写了一个程序，该程序使用了广泛的稀疏矩阵向量乘法。我对它的速度一点也不满意，我想试试 ATLAS。是否有明确的程序来转换代码？为了讨论，我在下面附上了一个非常简单的代码。

我有一个函数指针数组，我用它来调用适当的cblas_xgemm（例如，cblas_dgemm或cblas_sgemm等，来自 ATLAS/CBLAS）。

cblas_dgemm当我告诉它通过函数指针使用时，这很好用；dgemm 使用适当的参数调用并返回正确的结果。

但是，当我cblas_sgemm通过函数指针调用时，我得到以下输出：

我写了一个简短的测试程序来演示这个问题。cblas_sgemm没有函数指针的调用工作正常。

请特别注意以下 gcc 警告（另请参阅上面链接的要点，它具有完整的 gcc 输出）：

如果我在函数指针数组定义中注释掉该cblas_sgemm行，我不会收到这样的警告，即使对于该cblas_dgemm行也是如此。但这没有任何意义，因为这两个函数都应该具有相同的返回类型！

以下是来自的适当行cblas.h：

那么给了什么？它是否以某种方式xgemm从一个标头获取功能之一，而从另一个标头获取另一个功能？还是我在处理一些奇怪的函数指针问题？

我在 GLKit 中有一个跟随用户手指的纹理。我计算弧度以在两点之间使用 arctan 绘制角度。

这里的部分技巧是保持物体居中而不是手指。所以我引入了锚点的概念，以便可以相对于它们的原点或中心绘制事物。我的目标是将精灵移动到位然后旋转。我的渲染器中有以下代码。

另一个注意事项是我的精灵在纹理别名上。如果我拿出我的旋转我的精灵正确地绘制在我的手指下方。我的项目矩阵是 GLKMatrix4MakeOrtho(0, CGRectGetWidth(self.frame), CGRectGetHeight(self.frame), 0, 1, -1); 所以它匹配 UIkit 和它嵌入的视图。

有时我会回去看这个视频。然后我哭了一点，因为 280 North 被摩托罗拉吞并了，直到今天，没有人真正知道他们到底发生了什么。

我知道 SproutCore 有一个叫做“温室”的东西，据称它做了类似的事情。但是，随着 SproutCore 的首席开发人员被 Facebook 聘用，并且 SproutCore 本身变成了 Ember.js，我真的不确定 Greenhouse 是否还活着。

那么 - 是否有任何工具可以从 Atlas 停止的地方开始？

我有一个使用 condor 作为集群中间件的 HPC 集群，所有机器上的操作系统都是 CentOS，我安装了 MPICH2。如何对系统进行基准测试以获得最大 Gflops？我安装了 linpack 和 atlas 库，但没有找到如何在 condor 中使用它们的信息。

当我用犰狳 makefile 编译 example2.cpp 并运行它时，我收到一条错误消息

我该如何解决？当我尝试使用解决方案时，我遇到了类似的错误。我的设置的详细信息是：

• Ubuntu Lucid Lynx 10.04
• 犰狳版本：2.4.2（Loco Lounge Lizard）
• 阿特拉斯 3.9.51
• 提升 1.48.0
• g++ (Ubuntu 4.4.3-4ubuntu5.1) 4.4.3

Atlas 是在犰狳之前安装的，犰狳安装是用 Cmake 配置的。我远非 cmake 专家，但我认为当我用它生成 makefile 时它应该找到 ATLAS。犰狳文档似乎说，如果我使用 cmake 安装，我不需要手动启用 ATLAS。我试图通过插入手动破解 example2.cpp

在标题之前，但它只会产生一堆关于 Cblas 上缺少的东西的错误。也许缺少允许 cmake 找到 ATLAS 的步骤。感觉我错过了一些简单但关键的东西。任何帮助将不胜感激。

附加细节：

编辑：无论出于何种原因，我无法再添加评论，所以我在下面发布了对@Appleman1234 答案的回复。

我从源代码编译了犰狳和 ATLAS。我认为 ATLAS 已捆绑并优化了 LAPACK 和 BLAS。当我编译它时，我将一个位置传递给 lapack tar

我还在 atlas lib 目录中看到以下文件：

这似乎表明系统上安装了 blas、cblas 和 lapack。但是，犰狳中的CMakeCache.txt似乎表明cmake没有找到BLAS、CBLAS、CLAPACK如下

CMakeCache.txt 中没有 ATLAS 的概念，所以我认为它也没有找到。也许我错了，但似乎我需要以某种方式将 cmake 指向 ATLAS，我只是不知道如何。假设 ATLAS 有 BLAS、LAPACK 和 CBLAS，我也可能会出错。我以为我将它们编译为 ATLAS 的一部分，但我可能错了。将不胜感激您的意见。

问题的解决方案：

德克的建议几乎奏效了。正如我在对他的帖子的回复中提到的那样，问题是 cmake 犹豫不决。我误诊为cmake找不到clapack的问题。事实上，在更仔细地查看了 cmake 输出之后，我意识到当它决定将其用作编译器 /usr/bin/c++ 时，它存在找不到好的编译器或者更确切地说是拖拖拉拉的问题。所以我做了 CXX=g++ 然后再次 cmake 效果很好。在那之后，犰狳编译得很好。

我安装了带有 atlas-sse3 软件包的 Fedora 16，并由 numpy 和 scipy 使用。所有 3 个软件包都来自发行版的存储库。我的问题是，如果我下载 Atlas 库的源 rpm 并编译它以更好地适应我的硬件，我是否还需要针对新安装的 Atlas 版本编译 numpy 和 scipy？

我“双启动”Ubuntu 11.04、Ubuntu 12.04 和 Windows XP SP3 均已更新至最新版本。PC 是相当旧的 Intel Celeron D CPU 3.06GHz 和 2GB RAM

在 Ubuntu 11.04 中，我使用 ATLAS 编译了 Numpy（ATLAS 从源代码编译）
在 Ubuntu 12.04 中，我使用最新可用的 MKL、icc、ifort 构建了 Numpy
在 Windows XP 中，我使用 MKL 构建了 Numpy（来自 Christoph Gohlke 提供的 Python 包）
更多详细信息在这里：http ://pastebin.com/raw.php?i=wxuFbyVg

我试过很简单：
%timeit np.dot(np.ones((1000,1000)), np.ones((1000,1000)))

并得到了这个结果：

我认为上面是一个不好的例子，我搜索了许多可用比较中的一个，即第一个谷歌点击：http ://dpinte.wordpress.com/2010/01/15/numpy-performance-improvement-with-the-mkl/

我测试了相同的功能：

所以 ATLAS 编译的 Numpy 出于某种原因有最好的结果。
有谁知道可能是什么问题？