问题标签 [asbio]

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r - 用于计算部分决定系数的R包?

有人知道用于在多元回归中计算部分 R^2 的 R 包吗?我已经尝试了 asbio 包中的命令 partial.R2,但即使使用提供的文档中的示例,它也会给出错误消息。

非常感谢。

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r - 如何通过循环比较R中所有可能的对象组合

假设我有二进制向量并且需要将它们与Kappa函数进行类似的比较。

在此处输入图像描述

如何循环Kappa函数以获取所有可能的比较表?

我想得到这样的东西:

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r - 将表中的结果写入R中的一行

我做了一个 Kappa 统计量 {Asbio}。

所以结果是:

我想要的是将此结果保存到表中:

所以“整理”我的结果并将它们放在一个表格行中(带有列名)。我想让 Kappa 重复 100 次。也许我的问题是微不足道的,但我真的找不到答案......在此先感谢

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r - dplyr,dunn 测试,dim(robj) <- c(dX, dY) 中的错误:dims [product 0] 与对象的长度不匹配

我正在尝试将由变量值过滤的数据集从 R 中的“asbio”包传递给 pairw.kw 函数。

此代码有效。然而,

给我错误信息

dim(robj) <- c(dX, dY) 中的错误:dims [product 0] 与对象 [1] 的长度不匹配

除了假设被比较的两个向量在应用过滤器后变得不同长度之外,我无法理解是什么原因造成的。

除了将数据显式设置为新数据框并使用它之外,还有其他方法可以解决此问题吗?我知道这会起作用,但想知道是否存在更优雅的解决方案。

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r - 循环一个函数,该函数返回由另一个变量分组的数据框中的变量列表

作为示例数据集

我试图pairw.kwasbio包中使用按变量分组后计算邓恩测试 P 值。

返回一个有效的结果。

如何修改此代码(或其他方式)以循环其他数字变量(我的实际数据集中有 23 个)?

编辑:我使用以下代码根据下面@jay.sf 的出色答案来解决我的问题。

这将转换我唯一需要的摘要对象,res并将其转换为易于使用的数据框。

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r - Tidyverse 分组解决方案,并循环通过数据帧执行 dunn.test

我在下面有一个示例数据框。

我想先分组treated,然后遍历数据中的所有数字变量以使用作为解释变量执行 dunn 测试(pairw.kw来自asbio包) ,提取数据框对象并将列和子列表中的列绑定到一个新的数据框对象。speciessummaryyesno

我已经在这里这里使用部分“整洁”的方法获得了部分解决方案,效果很好。我只是在寻找更优雅的 tidyverse 解决方案,以帮助我学习成为更好的 R 用户。

任何帮助表示赞赏。

编辑:这是我从部分“整洁”解决方案中的代码获得的输出。

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r - 函数 tukey.add.test (asbio) 与其他包

通常我使用 asbio 包中的 tukey.add.test 来检查 ANOVA RCBD 中的处理和块之间的交互,该包现在已存档,因此我不能再使用此功能或包中的任何内容。

你们知道检查这种交互的另一个功能吗?有什么建议吗?

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asbio - Asbio 包中的芯片图

我正在为我的数据制作卡图,并且在自定义图时遇到问题:例如,我无法更改输出 chi 和 lambda 限制或更改置信区间。例如,当使用普通绘图函数时,您可以编写:

plots(x,y,xlim=c(a,b)),其中 a 和 b 是您想要的输出限制。我附上了一个用伪随机数据生成的卡图示例。基本上,我希望能够将 chi 和 lambda 限制从默认值 (-1,1,-1,1) 减少到其他值。

这是我使用的代码:

请帮助chiplots imgae