pandas - 在多列上运行 Kruskal-Wallis/ANOVA

Question

我正在尝试在数据框中做 kruskal-wallis。在行中——我有 4 组数据（4 种疾病诊断），每组有 6 名患者。在列中——我有大约 7000 个基因。

我正在尝试在每个基因的 4 组中执行 kruskal-wallis/ANOVA。

我可以通过这段代码来做到这一点- stats.kruskal(*[group["gene_1"].values for name, group in df.groupby("disease_diagnosis")])

这给出了基因 1 的 p 值

我试图通过我尝试了这段代码的 7000 个基因（在列中）来完成这项工作。

for key, value in df.iteritems():
       kw_table = stats.kruskal(*[value.values for name, group in 
df.groupby("disease_diagnosis")])
print(kw_table) 

这在我尝试过的其他方法中不起作用。将有助于获得一些指导..谢谢