bash - 神经影像学：AFNI bash

Question

这是我收到的错误我是新手，我想在 shell 中运行以下脚本，但出现错误，COLUMN.nii文件是一个漂亮的文件，其中包含一组值从 1 到 10 的掩码和我想在for循环中使用这个 AFNI 命令将这些掩码分成单独的漂亮文件。

欢迎任何建议，谢谢K。

for i in {1..10};
    do
    3dcalc -a COLUMNS.nii -expr ‘equals(a, "${i}”)’ -prefix col_"${i}”.nii;
    done

Answer 1

看来您可能已经使用文字处理程序（例如 Microsoft Word）编辑了代码，该程序不会将“正常”的单引号和双引号字符放入文件中。

在你的程序中

3dcalc -a COLUMNS.nii -expr ‘equals(a, "${i}”)’ -prefix col_"${i}”.nii;

有那些“卷曲”的单引号和双引号字符。将此更改为

3dcalc -a COLUMNS.nii -expr 'equals(a, "${i}")' -prefix col_"${i}".nii;

在编辑代码时，我建议您使用特定于编程的编辑器——那里有很多——而不是文字处理程序。