我正在尝试优化具有多个输入变量(24 到 30 之间)的目标函数。这些变量是三个不同统计变量的样本,目标函数值是t检验概率值。误差函数表示期望和实际 t 检验概率之间的误差(差的平方和)。对于所有三个 t 检验,我只能接受误差小于 1e-8 的解决方案。
我正在使用scipy.optimize.fmin
,效果很好。目标函数为零的解决方案有很多。
问题是我需要找到一个解决方案,其中变量在 0 到 10.0 之间,并且是整数或不超过一位小数部分。有效值的示例是0 10 3 5.5 6.8
。无效值的示例:-3 2.23 30
或0.16666667
。
我碰巧知道至少有一种解决方案,因为目标值来自实际测量数据。原始数据丢失了,我的任务是找到它们。但我不知道怎么做。使用试验/错误不是一种选择,因为每个变量大约有 100 个可能的值,并且考虑到变量的数量,可能的情况数将是 100**30,这太多了。使用 fmin 很棒,但是它不适用于谨慎的值。
有没有办法解决这个问题?如果我需要运行一个程序数小时才能找到解决方案,这不是问题。但是我需要在几天内找到大约 10 个目标值的解决方案,而且我没有新的想法。
这是一个示例 MWE:
import math
import numpy
import scipy.optimize
import scipy.stats
import sys
def log(s):
sys.stdout.write(str(s))
sys.stdout.flush()
# List of target T values: TAB, TCA, TCB
TARGETS = numpy.array([
[0.05456834, 0.01510358, 0.15223353 ], # task 1 to solve
[0.15891875, 0.0083665, 0.00040262 ], # task 2 to solve
])
MAX_ERR = 1e-10 # Maximum error in T values
NMIN,NMAX = 8,10 # Number of samples for T probes. Inclusive.
def fsq(x, t, n):
"""Returns the differences between the target and the actual values."""
a,b,c = x[0:n],x[n:2*n],x[2*n:3*n]
results = numpy.array([
scipy.stats.ttest_rel(a,b)[1], # ab
scipy.stats.ttest_rel(c,a)[1], # ca
scipy.stats.ttest_rel(c,b)[1] # cb
])
# Sum of squares of diffs
return (results - t)
def f(x, t, n):
"""This is the target function that needs to be minimized."""
return (fsq(x,t,n)**2).sum()
def main():
for tidx,t in enumerate(TARGETS):
print "============================================="
print "Target %d/%d"%(tidx+1,len(TARGETS))
for n in range(NMIN,NMAX+1):
log(" => n=%s "%n)
successful = False
tries = 0
factor = 0.1
while not successful:
x0 = numpy.random.random(3*n) * factor
x = scipy.optimize.fmin(f,x0, [t,n], xtol=MAX_ERR, ftol=MAX_ERR )
diffs = fsq(x,t,n)
successful = (numpy.abs(diffs)<MAX_ERR).all()
if successful:
log(" OK, error=[%s,%s,%s]\n"%(diffs[0],diffs[1],diffs[2]))
print " SOLUTION FOUND "
print x
else:
tries += 1
log(" FAILED, tries=%d\n"%tries)
print diffs
factor += 0.1
if tries>5:
print "!!!!!!!!!!!! GIVING UP !!!!!!!!!!!"
break
if __name__ == "__main__":
main()