这是我之前的问题的后续。这一次,如果床文件中的两个条目重叠,我想将其中一个保留在输出中(随机选择)。最好,我寻找对先前答案(bedtools 包)的修改。对于输入:
1 183113 183114 chr1:183113-183240 0 +
1 187286 187287 chr1:187128-187287 0 -
1 187576 187587 chr1:187375-187577 0 -
1 187580 187590 chr1:187379-187577 0 -
我希望得到如下输出:
1 183113 183114 chr1:183113-183240 0 +
1 187286 187287 chr1:187128-187287 0 -
1 187576 187587 chr1:187375-187577 0 -