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我正在尝试使用包 paleotree 来构建 LTT 图,但是当我尝试输入我的树时出现以下错误。
a=read.tree(file.choose()) # to choose newick/nexus file multiDiv(a)
multiDiv(a) 中的错误:未知类型的数据
古工具是否只接受“multiphylo”类的对象?我将输入树转换为多门类,但它仍然给出相同的错误。任何人都可以建议如何去做吗?
我是 package 的作者paleotree。我认为这里发生的事情是您将一棵树传递给multiDiv,该树用于分析对象列表,每个对象都转换为多样性曲线。你可能想要phyloDiv()。如果不了解您的数据,我无法确定。
paleotree
multiDiv
phyloDiv()