python - 在 Windows 上安装 scikit-bio 时遇到问题

Question

当尝试使用 Python 2.78 和 Visual C++ 2008 Express Edition 在 Windows XP 上通过 pip 安装 scikit-bio 工具包时，该过程被 VC 发出以下消息中断：

cl : Command line error D8021 : invalid numeric argument '/Wno-error=declaration
-after-statement' 

关于这个错误，微软开发者网络网站只是说：

invalid numeric argument 'number'

A number greater than 65,534 was specified as a numeric argument.

我（还）没有尝试在 Linux（Ubuntu 12.04 Precise）下安装 scikit-bio，但我的印象是它可以正常工作（就像 Linux 一样）。

有没有人在Windows（XP、7、8）下成功安装过scikit-bio？有什么提示吗？

提前致谢！

Answer 1

我已经在 Windows 10 机器上安装了 Anaconda 的 Python (3.5)。如您所知，该平台没有官方版本的 scikit-bio，但您可以使用以下解决方法安装它：

1. 从Scikit-bio Github 存储库下载最新的源代码。
2. 使用7-zip之类的工具，将其解压缩到您的主目录。

3. 打开命令行客户端并切换到源目录

   cd %HOMEPATH%\scikit-bio-master
   

4. 使用Notepad++编辑文件setup.py

   "C:\Program Files (x86)\Notepad++\notepad++" setup.py
   

5. 查找定义ssw_extra_compile_args变量的行并更改它。您可以注释以前的​​版本并在新行中重新定义变量：

   #ssw_extra_compile_args = ['-Wno-error=declaration-after-statement']
   ssw_extra_compile_args = []
   

6. 保存更改，关闭编辑器并使用以下命令运行安装：

   python setup.py install
   

7. 希望您不会收到任何错误消息。打开 Anaconda 的 Python 会话（使用命令python）并测试 Scikit-Bio 是否使用print(skbio.art).

顺便说一句，我之前安装了启用 C++ SDK 功能的 Visual Studio 2015 社区版，以满足包 (Scikit-Bio) 安装的编译器要求。

Answer 2

目前，scikit-bio 还没有正式支持 windows。我们肯定有兴趣了解人们在 Windows 上安装、测试和使用 scikit-bio 的努力，但我们没有在这方面具有专业知识的开发人员。

这与biocore/skbio#941相关。