1

当我与 mpi 并行运行代码时,我的代码在运行时遇到了这个非常奇怪的问题:

*** glibc detected *** ./QuadTreeConstruction: munmap_chunk(): invalid pointer: 0x0000000001fbf180 ***
======= Backtrace: =========
/lib/libc.so.6(+0x776d6)[0x7f38763156d6]
./QuadTreeConstruction(_ZN9__gnu_cxx13new_allocatorImE10deallocateEPmm+0x20)[0x423f04]
./QuadTreeConstruction(_ZNSt13_Bvector_baseISaIbEE13_M_deallocateEv+0x50)[0x423e72]
./QuadTreeConstruction(_ZNSt13_Bvector_baseISaIbEED2Ev+0x1b)[0x423c79]
./QuadTreeConstruction(_ZNSt6vectorIbSaIbEED1Ev+0x18)[0x4237d2]
./QuadTreeConstruction(_Z22findLocalandGhostCellsRK8QuadTreeRK6ArrayVIiES5_iRS3_S6_+0x849)[0x41dbbd]
./QuadTreeConstruction(main+0xa32)[0x41ca49]
/lib/libc.so.6(__libc_start_main+0xfe)[0x7f38762bcd8e]
./QuadTreeConstruction[0x41b029]

我的代码是 valgrind 清理了 mpi 库内部的一些错误(我使用 OpenMpi,我以前见过很多次,但它们从来都不是问题;请参阅http://www.open-mpi.org/faq /?category=debugging#valgrind_clean)。当我串行运行时,我没有任何问题。

我已经能够SIGABORT使用 gdb 将问题追溯到系统调用,这是代码中断时的堆栈:

0   raise   raise.c 64  0x7f4bd8655ba5  
1   abort   abort.c 92  0x7f4bd86596b0  
2   __libc_message  libc_fatal.c    189 0x7f4bd868f65b  
3   malloc_printerr malloc.c    6283    0x7f4bd86996d6  
4   __gnu_cxx::new_allocator<unsigned long>::deallocate new_allocator.h 95  0x423f04    
5   std::_Bvector_base<std::allocator<bool> >::_M_deallocate    stl_bvector.h   444 0x423e72    
6   std::_Bvector_base<std::allocator<bool> >::~_Bvector_base   stl_bvector.h   430 0x423c79    
7   std::vector<bool, std::allocator<bool> >::~vector   stl_bvector.h   547 0x4237d2    
8   findLocalandGhostCells  mpi_partition.cpp   249 0x41dbbd    
9   main    mpi_partition.cpp   111 0x41ca49    

这听起来像是内存损坏,但我完全不知道是什么原因造成的。基本上,代码在一个看起来像这样的函数内部中断:

void findLocalandGhostCells(){
    std::vector<bool> foo(fooSize,false);

    // do stuff with foo; nothing crazy -- I promise

    return;
}

有人知道我现在应该做什么吗?:(

4

1 回答 1

1

如果您非常确定向量操作本身是正确且不疯狂的,请尝试逐步跟踪向量的成员。您的其他一些操作可能会损坏您的向量内存块。例如,一个侵入vector内存的memcpy。

于 2012-08-16T05:49:26.993 回答