当我与 mpi 并行运行代码时,我的代码在运行时遇到了这个非常奇怪的问题:
*** glibc detected *** ./QuadTreeConstruction: munmap_chunk(): invalid pointer: 0x0000000001fbf180 ***
======= Backtrace: =========
/lib/libc.so.6(+0x776d6)[0x7f38763156d6]
./QuadTreeConstruction(_ZN9__gnu_cxx13new_allocatorImE10deallocateEPmm+0x20)[0x423f04]
./QuadTreeConstruction(_ZNSt13_Bvector_baseISaIbEE13_M_deallocateEv+0x50)[0x423e72]
./QuadTreeConstruction(_ZNSt13_Bvector_baseISaIbEED2Ev+0x1b)[0x423c79]
./QuadTreeConstruction(_ZNSt6vectorIbSaIbEED1Ev+0x18)[0x4237d2]
./QuadTreeConstruction(_Z22findLocalandGhostCellsRK8QuadTreeRK6ArrayVIiES5_iRS3_S6_+0x849)[0x41dbbd]
./QuadTreeConstruction(main+0xa32)[0x41ca49]
/lib/libc.so.6(__libc_start_main+0xfe)[0x7f38762bcd8e]
./QuadTreeConstruction[0x41b029]
我的代码是 valgrind 清理了 mpi 库内部的一些错误(我使用 OpenMpi,我以前见过很多次,但它们从来都不是问题;请参阅http://www.open-mpi.org/faq /?category=debugging#valgrind_clean)。当我串行运行时,我没有任何问题。
我已经能够SIGABORT
使用 gdb 将问题追溯到系统调用,这是代码中断时的堆栈:
0 raise raise.c 64 0x7f4bd8655ba5
1 abort abort.c 92 0x7f4bd86596b0
2 __libc_message libc_fatal.c 189 0x7f4bd868f65b
3 malloc_printerr malloc.c 6283 0x7f4bd86996d6
4 __gnu_cxx::new_allocator<unsigned long>::deallocate new_allocator.h 95 0x423f04
5 std::_Bvector_base<std::allocator<bool> >::_M_deallocate stl_bvector.h 444 0x423e72
6 std::_Bvector_base<std::allocator<bool> >::~_Bvector_base stl_bvector.h 430 0x423c79
7 std::vector<bool, std::allocator<bool> >::~vector stl_bvector.h 547 0x4237d2
8 findLocalandGhostCells mpi_partition.cpp 249 0x41dbbd
9 main mpi_partition.cpp 111 0x41ca49
这听起来像是内存损坏,但我完全不知道是什么原因造成的。基本上,代码在一个看起来像这样的函数内部中断:
void findLocalandGhostCells(){
std::vector<bool> foo(fooSize,false);
// do stuff with foo; nothing crazy -- I promise
return;
}
有人知道我现在应该做什么吗?:(