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如何在XTK中渲染 Allen Brain Atlas（ API 文档）？我应该使用什么格式？

我正在尝试使用 XTK 直接在客户端上渲染从网络服务器发送的 vtk 对象，而不将它们存储到磁盘上。根据XTK 文档，我只需将 vtk 文件作为字符串传递到 X.Mesh.filedata 中，但是当我尝试这样做时它不会显示任何内容。

我想做这样的事情：

当我从文件加载文件时，一切正常，使用 filedata 设置它不会。我的错误在哪里？

我正在尝试在 2D 渲染模型中显示一些带有 XTK 的本地 DICOM / .dcm 文件，这些文件是来自癌症成像档案上托管的 RIDER 数据集的 LUNG CT 图像，并且控制台没有抛出错误，但图像被输出为空白的。js中的文件和文件的相对链接是正确的，但仍然没有输出。

我还进行了“开发人员提醒”构建：https ://github.com/xtk/X/wiki/X:DevelopersHeadsUp ，并尝试使用夜间构建：https ://github.com/xtk/get /blob/gh-pages/xtk_nightly.js。

我还验证了使用 OsiriX 未压缩 DICOM 文件...

If I have two 3D volumes rendered, how would I link the two volumes so that interaction with one will result in the same reaction in the other?

我被要求提供来自新型扫描仪原型的数据的 3D 可视化。

数据将作为体素立方体提供给我。每个体素将是一个数据结构，其确切内容尚未确定。

看起来xtk可能是解决这个问题的一个很好的基础，但由于我在这个领域完全是菜鸟，所以我有一些非常基本的问题......

1) 我很难找到 xtk 支持的各种文件格式的简单解释——哪些（如果有的话）代表体素的立方体？

2）对于那些，文件格式是否还指定每个体素的数据结构？您将如何处理呈现具有任意数据结构的文件？（即，例如，如果每个体素在该位置包含“foo”的数值测量 - 你将如何让 xtk 呈现可视化）

为菜鸟问题道歉 - 任何正确方向的指示都会非常感激。

我有一个 tensor_fa nifti 图像，其值 [0,1] 的数据类型为 FLOAT32。最初尝试使用 xtk 边缘库加载本地脚本。这显示了一个空白画布。我还尝试增加范围（乘以 100 到范围 [0,100]）并将这个相乘的图像更改为 INT32。在 slicedrop 中尝试时，原始图像“加载”，但任何阈值尝试都会引发“将文件放置在任何地方”消息。乘以 100 的图像也是如此。INT32 图像允许阈值化，但仍不显示图像。我已经在 fslview 和 mricron（nifti 查看器）中验证了所有三个图像。

此外，我尝试将音量最小/最大设置为 0/1，将阈值下限/上限设置为 0/1。

基本 nifti 标头信息：

图像是：

http://wagners.homeip.net/work/wrtensor_fa_orig.nii.gz（原图）

http://wagners.homeip.net/work/wrtensor_fa.mul100.nii.gz（乘以 100）

作为 int 的图像被命名为 wrtensor_fa.nii.gz。Stackoverflow 不会让我发布第三个链接。

任何建议表示赞赏。

进一步跟进：

看来数据并不是真正的 [0,1]。它包含 NaN。当我将 NaN 转换为真值（例如 -1）时，可以显示图像。但是，我需要使用未修改的图像。有人会认为 volume.lowerThreshold 和 upperThreshold 可以解决问题。

进一步跟进#2：

我一直在摸索 Chrome 的 javascript 工具。在我正在使用的页面上，三个图像中的第一个（INT16）我可以做一个volume.filedata 并接收一个ArrayBuffer。第二个和第三个（均为 FLOAT32）返回 NULL。

我正在使用 Xtk 制作一个小部件来测量体积中的距离。在场景中有四个对象：一个体积、两个球体和一个立方体。立方体放置在原点，球体沿 X 轴和 Y 轴平移 30 个单位，每个方向相反，如下所示：

https://docs.google.com/file/d/0B2oRl7iWfVvTaXAyckNTOC04RlE/edit?usp=sharing

立方体和球体放置在正确的位置，但是当体积包含在场景中时会出现问题，改变坐标系并平移原点：

https://docs.google.com/file/d/0B2oRl7iWfVvTR3BJdk13Zm9BdTQ/edit?usp=sharing

resetBoundingBox()函数在之后被调用，render()但没有区别。即使我尝试先添加对象，然后将体积添加到渲染器，但没有结果。

球体也可以被拖动，并且这个特性也受到坐标系变化的影响，因为在球体开始移动的那一刻，这是相对于鼠标位置的平移。

为什么要翻译原文？似乎音量会通过无效化来影响场景 resetBoundingBox()。

Every example I have seen only renders in greyscale.

Is there a way to map scalar volumes in voxels to colours? ( similar to vtkColorTransferFunction in VTK for example?)

If there is no support for this out of the box, how difficult would it be for us to add that capability?

我在场景中有一些对象，我想知道如何在一些旋转后获取对象的世界坐标。

例如，我使用了这个：X.matrix.multiplyByVector(X.cube.transform.matrix, 0, 0, 0);在渲染过程的一开始就获取世界坐标。坐标是(201.5, -54.5, 102.5)

然后我进行一些旋转，然后再次应用公式，它显示的坐标与以前相同，即使对象（本例中为立方体）位于场景中的另一个位置。

我们正在尝试将标量值与从文件读取的 VTK 网格中的单元/点相关联。我们知道可以使用 FreeSurfer 不同的曲率文件 - CRV（如示例 12 - http://lessons.goxtk.com/12/所示）

我们的问题是如何从 vtk 文件（块 PointData 和 CellData）中设置标量值？如果这是不可能的，有没有办法直接将标量数组设置为 X.mesh（任何示例）？

感谢和抱歉英语不好:-)

保罗