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我无法在显微镜图像中分离细胞。当我应用分水岭变换时，我最终将细胞切割成许多块，而不仅仅是在边界/最小值处分离它们。

我正在使用来自http://physics.georgetown.edu/matlab/code.html的 bpass 过滤器。

任何想法将不胜感激！你可以看到我的细胞在最终的面具中分裂得太多了。

这是我试图分水岭的那种形象。这是一个 16 位的图像，所以看起来全是黑色的。

启动荧光图像

最终图像蒙版：

我在这里手动分离了单元格：

我正在尝试分离连接的对象。似乎 Python 和分水岭算法（scipy 实现）非常适合处理这个问题。

这是我的图像和自动生成的分水岭种子点（阈值化和距离变换图像的局部最大值）：

到目前为止，一切都很好; 每个对象都有一个种子。

但是，当我运行分水岭时，事情就崩溃了：

中上层簇和中心簇都分离得很差。在顶部集群中，一个物体淹没在另外两个周围。在中心集群中，虽然它可能太小而无法在这里看到，但中心种子只能泛滥到几个像素。

我有两个问题：

1. 分水岭算法是这样分离对象的好选择吗？
2. 如果是这样，我是否需要进行某种预处理以使图像更适合分水岭分割？

我正在尝试在 java 中使用标记实现分水岭算法，在这里找到了一个示例，代码是 c++，我尝试将它转换为 java 代码但失败了。有没有人以前做过？请帮忙！我坚持使用这个函数 ( )，因为在java doccv2.connectedComponents()中找不到它。

我正在为 OpenCV 中的分水岭编写代码。

但我希望分水岭边界是 4 点连接而不是 8 点。

目前这是界面：

有人对此有任何解决方案吗？

此外，是否有任何简单的方法可以在 opencv 中执行形态分水岭以进行自动过度分割，当前的方法需要用户输入？

Mathworks.com 上的二维分水岭示例可总结如下：

我不太明白为什么D(~bw) = -Inf;这里有必要强制不属于对象的像素处于-Inf（最初为零）。

我尝试在没有该语句的情况下运行程序，结果令人困惑。为什么有必要将这些像素强制为 -Inf 以使分水岭获得正确的结果？

正如弗雷德里克所指出的，我曾经surf在这里绘制表面，在运行之前D(~bw) = -Inf;，结果是：

运行之后，结果是：

我按照Mathworks.com 中的2-D Watershed 示例来分离连接的对象，如下图所示：

代码总结为：

结果是：

中心的粒子已被分成两部分。有什么方法可以避免这里的过度分割？

谢谢，lennon310，chessboard对我的大多数图像都适用，但仍然有一些情况不适用。例如，下面的二进制图像：

使用棋盘将导致：

由于我有数百张图像，似乎很难找到一种适用于所有图像的参数组合。我想知道我是否需要结合使用棋盘、城市街区等获得的良好结果......

我正在使用精明的边缘检测和寻找轮廓功能（都是 OpenCV）来为分水岭变换创建标记。一切正常，但我对结果不是 100% 满意。原因是缺少一些边缘，因此丢失了重要信息。更详细地说，我得到了一堆窗口（前视图），它们是矩形，在分水岭变换之后，我最终得到了这样的结果：

但我宁愿有漂亮的矩形，它们是完整的，不是向一侧开放的。在保持不规则形状的同时（房子前面的灌木丛，汽车..）有什么想法可以解决这个问题吗？我想过用网格覆盖整个图像，但我不能让它工作。

非常感谢。

这是我的代码：

根据要求，这是原始图像、我想要获取的图像和我的输出：

我想要这样的分割（虽然过度分割并没有什么坏处，我只需要确保，我得到了所有的细节）：

虽然我得到这样 的东西：（请忽略颜色，它们对于这个问题并不重要，只是我整个程序的结果）。这只是一个例子，如果你愿意，我可以向你展示更多，也请看一下 etrims 数据集，我所有的图片都来自那里。

我有一个血液图像，我在上面应用了分水岭..它的工作原理并确定了细胞，但我不知道如何将每个细胞放在单独的图像中..我正在使用 emgu.cv 我可以得到一些帮助

在这里，我使用分水岭方法分割图片，然后将标记放在原始图像上

我将 OpenCV 分水岭与我的图像一起使用：

但这给了我唯一的面具。我还尝试将标记创建为两个点 - 结果只有一个蒙版。使用 OpenCV 是否可以像http://biodynamics.ucsd.edu/ir/中那样使用轮廓分离单元格（对象） ？如果没有，是否可以使用以下值创建结果掩码：1 表示第一个对象，2 - 表示第二个对象，.. 99 表示 99？

在 Matlab 中，我们可以对距离变换进行分水岭变换来分离两个接触的物体：

上面的第一张图片是我们希望分离的带有触摸对象的图片。第二个图像是它的距离变换。

因此，如果调用黑白图像img，在 Matlab 中我们可以这样做：

现在用 openCV 做同样的事情：OpenCV 有一个基于标记的分水岭分割功能。似乎要执行使用 openCV 分离两个触摸对象的相同任务，需要为对象和背景提供标记。

在下图中，您可以看到markers执行分水岭后的图像。原来的黑白 img以红色叠加在上面。问题是结果markers图像中的对象边界与原始图像不同。如何确保对象边界保持不变？