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我最近尝试用它breseq来分析一些细菌测序数据。但是，在将原始数据与参考基因组对齐breseq时，我遇到了一个致命错误。bowtie2

这是我得到的错误的关键部分：
+++ NOW PROCESSING Read alignment to reference genome [system] bowtie2-build -q test_breseq/data/reference.fasta test_breseq/02_reference_alignment/reference [system] bowtie2 -t -p 4 --local -L 31 --ma 1 --mp 3 --np 0 --rdg 2,3 --rfg 2,3 --ignore-quals -k 2000 -i S,1,0.25 --score-min L,0,0.9 --reorder -x test_breseq/02_reference_alignment/reference -U test_breseq/01_sequence_conversion/MRSA_10C.1.converted.fastq -S test_breseq/02_reference_alignment/MRSA_10C.1.stage1.sam --un test_breseq/02_reference_alignment/MRSA_10C.1.stage1.unmatched.fastq Error: the match penalty is greater than 0 (1) but the --score-min function can be less than or equal to zero. Either let the match penalty be 0 or make --score-min always positive. Error: Encountered internal Bowtie 2 exception (#1) Command: /usr/bin/bowtie2-align-s --wrapper basic-0 -t -p 4 --local -L 31 --ma 1 --mp 3 --np 0 --rdg 2,3 --rfg 2,3 --ignore-quals -k 2000 -i S,1,0.25 --score-min L,0,0.9 --reorder -x test_breseq/02_reference_alignment/reference --passthrough -U test_breseq/01_sequence_conversion/MRSA_10C.1.converted.fastq (ERR): bowtie2-align exited with value 1 !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!> FATAL ERROR <!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! Error running command: [system] bowtie2 -t -p 4 --local -L 31 --ma 1 --mp 3 --np 0 --rdg 2,3 --rfg 2,3 --ignore-quals -k 2000 -i S,1,0.25 --score-min L,0,0.9 --reorder -x test_breseq/02_reference_alignment/reference -U test_breseq/01_sequence_conversion/MRSA_10C.1.converted.fastq -S test_breseq/02_reference_alignment/MRSA_10C.1.stage1.sam --un test_breseq/02_reference_alignment/MRSA_10C.1.stage1.unmatched.fastq Result code: 256 FILE: libbreseq/common.h LINE: 1384 !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!

运行前的所有步骤bowtie2（samtools，转换 FASTQ）正常工作。根据错误，这是因为 score-min 函数，它的最小分数为 0 ( --score-min L,0,0.9)。当我将函数更改为（0 替换为 0.1）时，bowtie2单独工作的命令。--score-min L,0.1,0.9但看起来这部分breseq本身是编码的（不是吗？）。

关于我的问题的更多细节：
- 运行命令breseq是：breseq -o OUTPUT_DIR -j 4 -r REFERENCE.fastq RAWDATA.1.FASTQ.GZ RAWDATA.2.FASTQ.GZ
- 原始数据类型：MiSeq (150x2)
-bowtie2版本：2.3.0
-breseq版本：0.29.0
- 操作系统：Linux 16.04 LTS
- 测试也有类似的错误。

这是一个错误还是我只是使用不正确？我将不胜感激任何意见或建议。

在 c# 中，我想声明一个带有动态数组的函数，该数组接收任何类型的数据原始类型，例如（字符串、整数、双精度、日期时间 ....），但这种类型不是 Object，只是基本类型。有办法做到这一点吗？

我在我的 Shopify 网站中使用 Blockshop 主题。我有不同的产品会有颜色变体。当我单击集合页面时，我想将该产品的所有颜色变体显示为单独的产品。请帮忙

我有以下几行代码。

例如，我还有 1600 个组的名称

（组名中没有模式）

我想使用“df”在 R 中生成 1,600 组代码。例如，

我发现了其他几个处理变体的问题，但似乎没有一个能解决我的问题。

我有非常简单的 for 循环进行比较。目的是在不匹配的情况下将 Excel 单元格着色为红色。结果是 99% 准确的，但我注意到一些看似随机的错误。例如，包含数字 104875 的单元格不是红色的，这表示比较列中应该有匹配的单元格。但是没有。似乎它们都应该是错误的或都是正确的。其他一些关于变体的线程提到比较必须是相同的类型，否则你会得到奇怪的错误。就我而言，它们属于同一类型（都是整数），所以这不是问题。

我是 VBA 的新手，仍然试图了解它是如何工作的。

这是代码的相关部分：

编辑：原来我的代码工作正常。问题只是其中一张床单上的一些单元格被隐藏了，我没有意识到这一点。~facepalm~这就是我在excel中没有经验所得到的

我想增加超过 100 个变体的数量，有没有办法超过这个变体数量，而 Shopify 默认提供 100 个变体

我认为这是对该主题提出的其他问题的一种变体。

我有两种产品口味。我在不同的环境中部署我的应用程序，每个环境都与不同的 Firebase 项目通信。因此，对于每种风味，我都需要能够针对特定环境（开发、测试、生产等）

google-services.json有没有一种方法，我可以在不引入新产品风味的情况下制作风味的构建变体来选择适当的文件？也许我以错误的方式处理这个问题......

我正在 Delphi 中开发一个自动化服务器，并且有几个属性需要返回字符串数组。规范要求（带有 3 种语言的示例）：

我尝试了很多方法来做到这一点，包括 SafeArrays 和 Variants 作为 RIDL 类型。我最近的尝试（所以我至少有一个例子）是：

在这种情况下，客户端应用程序抱怨错误：

“无法将 'System.String[*]' 类型的对象转换为 'System.String[]' 类型。”

提前致谢！

我正在尝试通过 Python Shopify API 添加新产品。我知道如何添加标题和正文以及图片，但我在添加价格时遇到问题，我需要'requires_shipping'：False。我在任何地方都找不到如何实现这一点。

这就是我到目前为止所拥有的。

在 WooCommerce 上，如果我们有给定衬衫的多种颜色，并且想要显示不同的产品名称、产品描述、产品数量、产品价格以及每种颜色的产品图片集（即 5 张红色衬衫的图片产品页面，不是一红一绿一蓝），有办法吗？大概应该将产品创建为两个单独的产品，并有一种方法将它们相互链接，以便颜色选项显示在不同的页面上，但是当点击颜色选项时，用户会被路由到一个新页面。

有这个插件吗？