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我正在使用Trilinos构建基于分布式线性代数的应用程序，主要问题是内存消耗远高于预期。

我已经构建了一个简单的测试用例，用于构建一个 Epetra::VbrMatrix，其中包含 150 万个双精度数，这些双精度数组合为 500 万个 3 个双精度数块，大约为 115MB。

在 2 个处理器上构建矩阵后，每个处理器一半数据，我在每个处理器上消耗 500MB 的内存，大约是数据的 7.5 倍，这对我来说看起来不合理，矩阵应该只有一些整数数组来定位非零块.

我在 trilinos-users 邮件列表上询问，他们说内存使用率看起来太高了，但希望在这里能得到更多帮助。

我在使用 Ubuntu + gcc 4.4.5 + Trilinos 10.0 的笔记本电脑和使用 PGI 编译器和 Trilinos 10.4.0 的集群上进行了测试，结果大致相同。

我的测试代码在 gist https://gist.github.com/848310上，我还在笔记本电脑上使用 2 个 MPI 进程在测试的不同阶段编写了内存消耗。

如果有人有任何真正有用的建议。此外，如果您甚至可以构建、运行和报告内存消耗，那就太好了。

我正在尝试在 Mac OS X 10.6.8 上构建Trilinos库，基本上遵循此页面上的说明和Trilinos 随附的CMake 快速入门文档。

为了使用 CMake 构建它，说明建议设置一个目录，例如 /usr/local/trilinos，在其中创建一个 ./do-configure 脚本并运行它。我的脚本是：

运行此脚本会启动配置，直到出现错误。详细输出可以在这里找到：http: //pastebin.com/abrEghD7

我认为消息的相关部分是：

但是，我无法解释为什么该脚本会指责 Fortran 和 C++ 编译器。我已经用“Hello World”测试了 Fortran 编译器，并将 OS X 的 C++ 编译器用于整个项目。据我所知，两个编译器都能正常工作。

谁能猜出可能出了什么问题？

编辑：似乎这是一些兼容性问题，而不是个别编译器的问题。

我刚刚安装了 trilinos 11.0.3，现在我正在尝试使用 cmake 编译我的第一个应用程序。

我要编译的文件在这里 http://code.google.com/p/trilinos/wiki/EpetraSimpleVector

cmake尽管对于每个 trilinos 软件包，我都收到以下警告（以防万一），但第一个命令似乎有效：

除此之外，似乎 trilinos 的位置包含和库已正确找到

但是，该make命令会生成类似错误的列表，例如：

知道这里发生了什么吗？

（我将源文件命名为 teuchos_test.cpp 因为首先我尝试从 teuchos 包中编译一些代码，但是我收到了与上面类似的错误）

谢谢

乔戈斯

我可以访问trilinos已经静态构建的集群。

是否可以建立pytrilinos自己链接到这些库？还是唯一的方法是trilinos从源代码构建所有内容？

谢谢！

我已经用 pytrilinos 编译了 trilinos，但 python 不导入 PyTrilinos。

这就是我所做的，我配置要安装的软件包

然后我用make安装

但是当我尝试使用 PyTrilinos 时，python 说没有模块

我正在使用 Trilinos 包，特别是 Trilinos 的 Epetra 部分。我正在使用 Epetra_CRSMatrices 进行计算，但我找不到这些矩阵的任何数学函数。特别是我需要计算 Epetra_CRSMatrix 的转置和逆，以计算两个 Epetra_CRSMatrices 的乘积，以及 Epetra_CRSMatrix 与 Epetra_Vector 的乘积。这些操作是否存在任何标准功能？我检查了上述类的功能，但一无所获。

我正在尝试使用 Trilino 包编译一个简单的测试程序，但是出了点问题。据我所知，Trilino 的安装进展顺利，但链接肯定有问题。下面是我的makefile：

这是程序：

然而，当运行 make 它只是返回：

对于 main 中的每一段代码，即使它没有抱怨包含的内容，它似乎也找不到 Epetra 包。有谁知道可能是什么问题？我对 C++/C 相当陌生，处理 Trilino 包相当复杂，因此非常感谢任何提示。

多年来，我一直是 Trilinos LOCA (c++) 中伪弧长延续、非线性求解器的用户，但我最近遇到了 python 包 petsc4py。这大大简化了我的编程，速度略有下降。

petsc4py 唯一缺少的类是伪弧长延续求解器。PETSC 有一个伪时间步进求解器，但这并不像转折点分解算法那么有用。

Trilinos LOCA 有一个 PETSC 包装器，但我一直在寻找一个解决方案，其中问题是在 python（来自 petsc4py）而不是 c 或 c++ 中指定的。

因此，我正在寻找一个用 petsc4py 编写的类，或者可以从 petsc4py 调用，实现伪弧长延续。

非常感谢你。

我想编写一个使用 Trilinos 的简单程序。在配置脚本出现许多问题后，我设法编写了它，因此它可以毫无问题地启动。问题是，当我尝试编译我自己的代码（Makefile 和我的测试程序都根据原始示例重写）时，它会抛出错误：

所以我试图启动我的 Makefileenv -i make来为“参数”腾出足够的空间。它有效，但现在它引发了另一个错误：

我的尝试：

我试图找到任何解决这个问题的方法，但到目前为止我还没有找到任何有效的方法。

我检查了我的 GCC 和 G++ 是否是相同的版本，它们是：

然后我尝试重新安装 G++：

尽管如此，还是没有成功。

最后，我检查了我的g++命令是否指向正确的目的地：

/usr/bin/g++是文件的链接g++-4.9，它是启动编译器的正确文件。

所以，我不知道我应该知道什么才能正确编译它。你？

我的文件

.do-configure（用于配置 Trilinos 的文件）

生成文件

.CPP 文件

我需要编译使用 Trilinos 的代码。问题是，每次我收到此错误时：

我不知道，我怎样才能正确编译我的代码——我的 Makefile 是从一个样本重写的，在他们说的原始文档中，我们应该只使用 GNU Make。但我已经在使用它了:-)

所以，我需要编译我的代码，我使用 Epetra 包，我需要它能够使用 MPI。

我试图通过使用来解决这个env -i问题，但它只会引起另一个问题，我在这里问过这个问题。

我的文件

.do-configure（用于配置 Trilinos 的文件）

生成文件

.CPP 文件