问题标签 [starcluster]

我正在使用 OpenMPI、starcluster 和 Amazon EC2，同时浏览http://mpitutorial.com/tutorials/上的教程。我设置了一个master和2个节点；节点 001 和节点 002。但是，每当我MPI_Init从 Comm 调用并检索有关 World Size 的信息时，我都会不断收到 1 的“World Size”，即使我确实使用了 2 个处理器。这些正在使用 MPICH 库中的函数。

示例输出显示了服务器名称、排名和世界大小：

这里显然有 2 个处理器，两者都在使用，但我仍然不断获得 Rank 和 World Size 的这些值。有没有办法可以研究调试这里发生的事情？

我正在使用 Amazon EC2 节点并在 C 中运行 MPI 并行程序。我正在使用 starcluster 来管理实例。该程序使用mpicc. 然后可执行文件位于所有节点共享的已安装空间上。但是，当我使用 运行可执行文件时mpirun，有时会加载旧版本的可执行文件。

例如，如果我有一个主节点和 9 个节点，并打印“版本 1.0”，我将得到 10 个“版本 1.0”的字符串输出。如果我更新代码以打印“1.1 版”，并在主机上编译，然后立即运行，我将得到 1 行“1.1 版”和 9 行“1.0 版”......除非我再等一分钟或运行两个，然后我得到所有十行“版本 1.1”。

为什么其他节点更新其可执行文件会有这样的延迟？MPIcc 有问题吗？我安装共享空间的方式？

我有如下所示的StarCluster配置文件：

我用以下方式启动集群没有问题：

但是当我将其更改为：

我收到此错误：

正确的方法是什么？

在标准单实例下，我将使用Goofy（或替代）使用以下命令安装S3-Buckets3fs

我怎样才能在StarCluster下做到这一点？它是否允许安装 S3？还是仅适用于 EBS？

如何修改StarCluster配置或代码以包含IAM 角色？

所以当我这样做时：

IAM 角色可以在 EC2 实例（主节点和节点）中自动激活。我确实试图环顾四周，但无济于事。

StarCluster 是一个众所周知的 Amazon EC2 工具包。但是，它是基于 Python 2 开发的，如果过时的话。而且它与 Python 3.x 不兼容。

所以我想知道StarCluster 有什么替代品吗？我在stackoverflow中搜索过，但没有找到答案。有人知道吗？我期待您的建议！谢谢！

在python3的环境下使用2to3.py让Starcluster工作可以吗？

我使用 starcluster 启动了几个 EC2 实例，并在每个节点上运行相同的管道。

1. 我使用 qsub 提交作业而不指定节点。为什么starcluster /SGE将作业分配给已经被占用的节点而不是空节点？
2. 这些节点可以互相借用线程和 RAM 吗？

有人可以分享一些关于这些的想法吗？

我是 Starcluster 软件的新手，目前正在尝试在 3 节点集群中编译我的第一个复杂程序。

我按照集群创建的说明，将文件放在 sgeadmin 文件夹中并尝试编译。弹出以下错误：

这似乎是 mpi.h 中的一个问题，但 starcluster 应该为您安装它...我试图只找到解决方案，但没有成功找到答案...有人遇到过这个错误吗？

提前致谢，

贝尔纳多

编辑 MyApp.cpp 前 8 行

（mpi.h 是第 9 行）

MyAp.hpp 前 15 行

SAXpopulation.hpp 前 18 行

（最后一行是 19）

尝试为 StarCluster 中的所有节点创建 EBS 共享卷时，StarCluster createvolume 命令会启动 AWS EC2 实例作为卷创建者。但是，用于此的默认实例类型是 t1.micro，它在 AWS 可用区（在我的例子中是 us-east-1f）中不再可用。是否可以指定要使用的不同默认实例类型？t2.small，例如？