问题标签 [scipy-spatial]

我是个numpy婴儿，正在考虑使用numpy.vectorise()来计算距离矩阵。我认为其中一个关键部分是signature参数，但是当我运行下面的代码时，我得到一个错误：

输出 + 错误：

我想要什么，方括号表示 numpy 数组而不是列表，基于上面评论中讨论的数组输出类型：

有人可以建议签名参数是如何工作的，以及这是否会导致我的麻烦？我怀疑这是由于我签名中的 (n, m) 因为它是唯一的多维事物，因此问题:(

干杯! 蒂姆

我正在比较使用pdist和 DIY Jaccard 距离矩阵函数处理数据集时得到的 Jaccard 距离矩阵。我在输出距离矩阵中得到不同的结果，我不确定为什么。

我认为原因之一是：

• 我的杰卡德距离计算的实现是错误的
• scipy.spatial.distance.pdist(metric = 'jaccard')并scipy.spatial.distance.jaccard以不同的方式计算杰卡德距离（似乎不太可能，因为它们都在scipy.spatial.distance）
• squareform正在对我的数据做某事，可能是标准化

squareform 的文档让我有点不知所措，所以某种形式的规范化可能是正在发生的事情。但是，方形距离矩阵在单元格之间没有相同的相对距离幅度，这令人困惑（例如，我的 DIY 距离矩阵中的第 0 行是0, 0.571429, 1，并且pdist是0, 1, 1- 中间值是 的两倍pdist）。

谁能解释为什么我在用相同的度量分析时得到不同的距离矩阵？

我的代码：

输入数组：

dist_diy：

dist_pdist：

我正在使用 scipy.spatial 转换库。

当我以 xyz 方式为角度 [45, 45,45 ] 组合旋转矩阵时，为什么当我选择“zyx”时逆 [-45,-45,-45] 是正确的。以及为什么当我选择“xyz”时它是错误的。我做错什么了吗？或者我对基质的组成和分解的理解是错误的？

我想限制无限的 Voronoi 区域出现在舞台上。所以对于示例： 我希望区域不是无限的。

我试图理解scipy.spartial.Voronoi 文档很多天。我设法将点与区域联系起来，但区域与顶点（我的代码）联系起来。我还修改了 voronoi_plot_2d函数来获得有限的山脊：

但我不知道如何将具有有限顶点的脊与区域连接起来。有人可以帮忙吗？

我试图在一组 x,y 坐标对上执行 KD-tree 以对它们进行空间索引。我发现 scipy.spatial.kdtree 可以快速执行此操作。但是我似乎无法管理绘制 kdtree 的超矩形（我使用 matplotlib）。

有谁知道如何获取算法生成的超矩形？

我正在尝试scipy.special.rel_entr在GitHub Repo中查找函数的代码源，但找不到rel_entr函数定义。

我还尝试查看此代码：https ://github.com/scipy/scipy/pull/6522/files#diff-0