问题标签 [rstudio-server]

操作系统：RHEL 6.5 x64
Rstudio-server 版本 0.98.1062
R 版本 3.1.1 (2014-07-10)
knitr 版本 1.6

尝试编织 Rmarkdown 文件时，我在编译的 pandoc 阶段失败：

尝试了（9 小时）完整的手动 LiveTeX 安装，只是为了确定，现在已经安装了 luatex，但仍然没有找到 ifluatex.sty。如何告诉 RStudioServer/knitr/pandoc 该文件的安装目录在哪里？

I am able to set up a Dockerfile with default ENV variables that I can then configure when running my docker container, e.g. in a Dockerfile I have the lines:

Great. When I launch an interactive session:

I can then issue the command git config --list and see that git is configured to use the values I provided on the command line instead of the defaults.

However, my Dockerfile is also configured to run an RStudio server that I can then log into in the browser when running the image in Daemon mode:

I go to localhost:8787 and log in to RStudio which all works as expected, start a new "Project" with git enabled, but then RStudio cannot find my git name & email. I can open the shell from the RStudio menu and run git config --list or echo $USERNAME and I just get a blank value. Why does this work for /bin/bash but not from RStudio and how do I fix it?

我在 Ubuntu 12.04 上使用 RStudio 服务器（版本 0.98.994）。

我们小组一起在外部共享驱动器上工作，并希望打开同一个项目。

当我打开其他同事创建的项目文件时，出现权限被拒绝的错误（抱歉，我已经手动更改了权限，因此无法显示错误消息）。

检查文件权限后，我发现 *.Rproj 和 .Rhistory 的默认权限是“-rw-r--rx”，“.Rproj.user”的默认权限是“drwxr-sr-x”。所以没有组的写权限。

在外部共享驱动器中（不确定系统，应该是Linux），默认权限是组的rw。

如何更改 *.Rproj、.Rhistory 和 .Rprojt.user 的默认权限？

感谢您的任何建议。如果我的问题不清楚，请告诉我。

编辑：

我从命令行在外部共享驱动器中创建了新文件和文件夹。正如我所料，默认权限是文件的 -rw-rw-r-- 和文件夹的 drwxrwsr-x 。似乎 RStudio 服务器使用自己的默认权限创建了这些新文件。

当 RStudio 服务器创建它们时，我可以更改这些文件 *.Rproj、.Rhistory 和 .Rprojt.user 的默认权限吗？即向组添加写权限。

我正在尝试使用闪亮的服务器使用 RStudio 创建一个 RMarkdown 文档。如果输出是 pdf，它可以正常工作，但如果我想要它作为 html，我会在进程结束时收到以下错误（在 RMarkdown 控制台中，我可以看到它达到 100%）。

错误：html_dependency 中指定的无法识别的字段：附件

我不知道为什么会发生这个错误。谁能帮我这个？

谢谢

我正在使用ubuntu 12.4 serverrstudio r 3.1.1。成功安装 rJava。但无法加载 rjava 库。我正在使用“rstudio”作为用户。

但我可以在提到的位置看到文件。

当我在 Rstudio 做的时候......

当我这样做时，sudo R CMD javareconf我得到了关注

任何人都可以请帮助解决这个问题。

谢谢，阿米特

我目前在Linux redhat. RStudio-server 的一个不错的功能是我可以从服务器导出到我的Windows桌面。有谁知道导出下拉菜单背后的代码？

导出功能可以通过Files选项卡找到： (More >> Export...)

我想使用代码来自动导出对象。我想我应该能够使用该system功能执行此导出，但我遇到了麻烦。

谢谢你的帮助。

我知道我可以在远程计算机上使用 RStudio 服务器，并通过客户端计算机上的 Web 浏览器连接到该服务器。

但是，我宁愿不使用我的网络浏览器。是否可以设置 RStudio Desktop 以连接到 RStudio Server？

非常感谢

我正在构建最新的 github 版本的 rstudio-server 以在 OSX Yosemite 上运行，但在安装时无法找到 macports R 库。

我遇到了“找不到最低 R 版本 (2.11.1)”。运行时出错，
cmake -DRSTUDIO_TARGET=Server -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release ..
但当我也通过时-DRSTUDIOVERIFYR_VERSION=0，我配置成功并在构建失败之前将其设置为大约 44%：

我能够Rinternals.h在/opt/local/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.1/PrivateHeaders/Rinternals.h（编辑：也在 /opt/local/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.1/Resources/include/Rinternals.h）中找到，但是如何将构建配置指向这个位置？

编辑：此外，我遇到了另一个问题，即构建在大约 70% 处失败并出现错误
/opt/local/lib/libR.dylib/Resources/R: not a directory
make[2]: *** [src/cpp/r/R/packages/library/manipulate/DESCRIPTION] Error 126 经过进一步调查，/opt/local/lib/libR.dylib/Resources/R不存在，因为/opt/local/lib/libR.dylib实际上是一个文件。

我是 Shiny 的新手，但对 R 并不陌生。由于工作原因，我现在正在 RStudio 服务器中进行 R 开发。它在 Google Compute Engine 上运行，如果这有什么不同的话。RStudio 服务器运行良好，但 Shiny 有问题。

安装闪亮之后，我运行了示例命令：

runExample("01_hello")

起初，这带来了 Hello Shiny！应用程序，但一切都是灰色的。我重新启动了 RStudio，清理了工作区，然后再次运行了命令。现在弹出一个窗口，但它立即消失。我尝试重新启动 RStudio 服务器，并在不同的浏览器中运行，但行为仍在继续。

我已经尝试快速单击“在浏览器中打开”按钮，这让我在浏览器中获得了一个灰色的选项卡，就像我重新启动之前一样。

有什么建议么？谢谢你。

编辑：

当我启动示例时，RStudio 控制台会给出：

然后就坐在那里，直到我按 esc。

IE 控制台没有给出任何错误（尽管我也不确定我是否正确使用它——不是网络人，抱歉）。

Chrome 控制台确实给出了一个错误：

'webkitRequestAnimationFrame' 是特定于供应商的。请改用标准的“requestAnimationFrame”。

其中有一个指向 VM320:6635 的链接，内容如下：

function _b(b,c){var d=b;var e=Gni(function(){var a=wj();d.Df(a)});return $wnd.webkitRequestAnimationFrame(e,c)}

我正在使用 RStudio 服务器和降雪。我的并行代码总是给我这些信息：

在我的并行函数（nvtPar）中，我从硬盘驱动器读取了一些文件并将文件写入硬盘驱动器。所有文件都在子文件夹中。

该服务器构建在具有 16 个内核的 VMware 虚拟服务器上。我的工作目录是 nfs 服务器并安装为我的主目录。

我的 RStudio 服务器是 0.98.994 版。

这是我的会话信息：

感谢您的任何建议。如果我的问题不清楚，请告诉我。

编辑：作为@roman-luštrik 的建议，我添加了我的最小示例来重现我的问题（抱歉，我无法发布我的整个脚本，但这个示例会产生相同的错误消息）。

经过挖掘，似乎这个错误与并行计算中的file.remove有关。如果我评论这一行，所有错误都会消失：

顺便说一句：我在工作目录中使用 svn 进行版本控制。