我收到了一个令牌，可以通过 API 在 R 中访问 IUCN 红名单门户。从InsideR，我读到以下内容：

“iucn_summary 使用新的 Redlist API 来搜索 IUCN ID，因此我们在内部使用 rl_search 函数。此函数需要 API 密钥。在http://apiv3.iucnredlist.org/api/v3/token获取密钥，并且将它传递给 key 参数，或存储在 .Renviron 文件中，如 IUCN_REDLIST_KEY=yourkey 或 .Rprofile 文件中，如 options(iucn_redlist_key="yourkey")。我们强烈建议您不要在函数调用中传递密钥，而是存储它在这两个文件之一中。此密钥还将设置您使用 rredlist 包。

如何将我的密钥存储在.Rprofile?

我目前正在尝试在 R 上安装软件包。在启动时，我收到正常的 R 消息

“错误：找不到对象'getw'”

当我使用该install.packages功能时，我在安装结束时收到相同的错误，我尝试安装的每个软件包都有一个错误。

但是，当我启动 R 时，R --no-init-file我可以正常安装包。

我一直在研究 Rprofile 和 R 的其他初始化设置。我还完成了 R 的全新安装，但消息仍然出现。

有谁知道如何消除此错误？此外，这台机器运行的是 Ubuntu 14.04 Trust Tahr。

我曾经有一个dbConnect声明，如.Firstmy.Rprofile和dbDisconnect声明.Last。我不再需要这些，所以我从 中删除了它们.Rprofile，但是当我退出时，R 挂起，因为该dbDisconnect语句。我可以退出q(runLast=F)。

我在我的根目录中放了一个空.Rprofile，但我仍然得到这个错误。我有默认的Rprofile.site。

这是什么原因造成的？有解决办法吗？FWIW，我在带有 R 3.3.1 的 Windows 8.1 上。

我.Rprofile的现在是空白的。但它曾经包含以下内容。

我发现每次加载 RStudio 时都必须单击工具 -> 更新包，这很烦人。例如，我可以使用update.packages(c("ggplot2")).RProfile 更新我的包，但问题是它不会查找其他包（依赖项）。例如，我每次启动 RStudio 时都必须更新“seriation”和“digest”包，而这些包不是我在启动时加载的。有没有人有代码在启动时自动检查和更新所有包？如果是这样，你能在这里分享吗？我广泛搜索了这个主题并通过 SO 搜索，似乎流行的观点是使用 RStudio 的菜单。这是我指的线程：如何在 R 中更新 R2jags？

我能想到的一种方法是在 .RProfile 中：

然后调用这个函数：https ://gist.github.com/stevenworthington/3178163

但是，我不太确定这是否是最佳方法。

另一个链接的线程是：Load package at start-up

我创建了上面的线程。我会很感激任何想法。

我有一个从https://www.r-bloggers.com/fun-with-rprofile-and-customizing-r-startup/复制的 .Rprofile但是，当我加载我的 R 会话时，env$它们中的函数不会'不工作，功能不env完美，这里是一个例子：

加载 R 后，我可以输入sshhh并显示该功能，但如果我输入unfactor它会显示object not found

有什么帮助吗？我应该把所有功能都放在我的工作区吗？？？

假设我想编写一个简单的重命名函数，该函数将通过.Rprofile. 函数很简单，可以类比：

.Rprofile

可用的函数.Rprofile格式为：

在哪里。env通过 连接attach(.env)。

问题

如何通过 访问函数的父环境parent.env()？即如果rename函数在另一个函数中被调用，我想在全局环境中重命名对象。

我正在使用 devtools 构建 R 包。我已经构建了一个包含一些我想包含的功能的包。我想在启动时加载包及其文档。我的包文件位于以下位置：

我的 .Rprofile 文件如下所示：

但是，当我打开 R 时，会加载包中的函数，但不会加载文档。

如果我自己启动后运行相同的代码行，即：

然后一切正常，包装正确记录。因此，这似乎是一个相当奇怪的错误！

（作为部分修复，我可以运行

并将其视为普通的 r 包，一切正常，但这需要时间，因为我打算大量更新包并且不想每次都运行它，尤其是 devtools 选项应该可以工作。）

正如问题所说，我希望我在 R 中的默认编辑器（例如，当我执行 fix(fn_name) 时）成为 emacs 的非窗口模式，而不是窗口模式。有没有办法做到这一点？

考虑以下两行：

如果我从已经建立的交互式 R 会话中执行此代码，它工作正常。

但是，如果我将相同的两行放入我的.Rprofile并开始一个新的交互式 R 会话，则该modules::import行将失败并显示

如果我然后尝试以下修复/破解

...然后该modules::import行仍然失败，但具有以下内容

因此，修补缺失名称的想法似乎将是一场无法维持的噩梦……

关键问题是这样的：交互式搜索会话开始后的搜索路径似乎与.Rprofile脚本看到的不同。

Q1：有没有一种方法可以告诉 R 使搜索路径>与交互式会话中出现第一个提示时完全一样？

Q2：或者，有没有办法.Rprofile安排一些代码在会话的默认搜索路径到位后运行？

注意：解决方案如下：

...每次修改（第三方）modules软件包时都有可能中断。

有什么想法，我怎样才能找到我的 Rscript 的版本？问题是，一旦我在 mac 终端中运行 R，版本为 3.2.2，但通过 Rscript 运行，版本更改为 3.0.2。我想知道如何更新我的 Rscript 版本！