问题标签 [rpostgresql]

我正在使用我postgresql的一些分析，到目前为止，我在 R 中使用了该RPostgreSQL库。

经过最近的检查，我发现

• 虽然仍在 CRAN 上，但作为 google.code 更改的一部分，源正在被驱逐。上次更新时间为 2014 年（但 CRAN 版本已有 3 年历史）。
• 我找不到“官方”源库将在哪里的指示（另一方面，在 github 上有各种版本，但很难理解哪个是“官方”源库）。
• 在浏览时，我发现了RPostgresHadley Wickham 的一个包（不少于！）。它被描述为更快，RPostgreSQL另一方面它似乎并不成熟。令人欣慰的是，最新的更新已在 2015 年 2 月完成。

我对“GitHub rpostgresql tomoaki”的谷歌研究没有帮助：有很多人将谷歌代码的源代码复制到 GitHub 上，我找不到 Tomoaki 的页面。

有谁知道：

• RPostgreSQL还在积极维护吗？
• 官方资源将位于何处？

RPostgres另外，和之间有什么区别RPostgreSQL？

我想将完整的数据框导出到已经在数据库（postgresql）中创建并包含类似数据的表中。

我发现了一些关于 dbwrite 表的解释问题（....overwrite = TRUE），我不想覆盖表中已经存在的数据。我只想用来自 r 控制台的数据框更新我的表。

有人可以让我知道我该怎么做..

像这样的东西

我的数据库中有两个表。两个表中的列及其数据类型如下所示。假设两个表都存储了 3 台机器的数据。每台机器都有两个 s_id，通过使用它们，我将选择特定机器的所需数据。

每台机器的 s_id 是

通过使用以下脚本，我将获得所需的结果。

库（RPostgreSQL）

因为我不是编程背景，所以我对每台机器都使用上述完整的查询语句

在我的情况下，是否可以使用循环而不是对每台机器使用查询。这样在一个查询中我将获得所有机器数据。

有人可以用我的例子告诉我如何做这些。实际上，我需要运行 6 个单独的脚本，并且在每个脚本中我需要三台不同机器的数据。

我正在运行一个需要 SSL 的 Postgres-9.4 服务器。当我使用 pgadmin 或 windows odbc 连接从笔记本电脑连接到 Postgres 服务器时，它使用 SSL。但是，当我尝试使用 SSL 与 R 连接时，它失败了。

如果我将 pg_hba.conf 设置为允许非 ssl 连接，那么这将起作用。当我将其设置为仅允许 SSL 连接时，这将失败。不幸的是dbConnect没有verbose选择，所以我什么都没有could not connect postgres@192.168.1.179 on dbname "postgres"

我发现这个问题似乎表明我在做正确的事情，但是不行。

编辑：

我做了更多的挖掘，发现这个讨论表明由于各种库/dll问题，这在windows上不起作用。那个讨论在这一点上已经有几年了，所以也许它已经解决了。我可以确认从 linux 执行上述操作确实有效。

我是通过 R 连接到 Redshift 的新手，我已经阅读了其他问题，但是当我尝试创建表时仍然出现错误。我已经成功建立了连接，并且我认为成功建立了表：

但是，当我尝试检查表是否存在以及字段是否存在时，我收到以下消息：

我很困惑，因为我认为该表已成功创建，但在数据库本身中也找不到它。当我尝试发送它并再次创建它时，我得到以下信息：

有什么我想念的吗？

请帮忙！谢谢

[原帖]

我见过几个类似的 SO 问题，但我认为它们中的任何一个都与操作系统无关。

长话短说，这是我在尝试建立与 Redshift 的 ssl 连接时看到的。

我尝试了以下方法，但都没有奏效。

1. 使用 R 通过 SSL 连接到 Redshift
2. 将文件从 PostgreSQL 导入到 R
3. 使用 R 通过 SSL 连接到 Postgres
4. https://groups.google.com/forum/#!topic/rpostgresql-dev/ELnVUJqjDbk

我在 AWS 中有一个 EC2 节点（Ubuntu），在办公室有另一个 Mac Pro，所以我尝试使用相同的代码从两者连接。

Linux 系统可以复制和粘贴完全相同的代码。这是Sys.info()Linux服务器上的：

但是，Mac Pro 失败并显示完全相同的错误消息。这是 Mac Sys.info()（与我的 Mac 笔记本电脑相同）：

我想知道导致此错误消息的 Mac 和 Linux 配置有什么不同？

[2016/02/10 更新]

我试图卸载 R 和所有相关文件，然后从自制软件重新安装 R：

相同的错误信息：

仅供参考，我可以使用相同的代码连接到其他非 SSL Redshift 集群，因此它可能与 Mac 上的 openssl 相关。

[2016/02/11 更新]

来自@MasashiMiyazaki 评论的更多信息：

我已经psql通过 CLI 进行连接，它工作正常。另外，我也可以使用 Python 模块成功连接psycopg2。但是，我必须禁用这条线.bash_profile才能让它们工作：

我在一个 12 节点的 redshift 集群中有 40 亿行数据。我成功地使用 Rpostgreqsql 包连接到它并使用 dplyr 进行基本的数据整理。

但是，我想做一些数据整形，我通常会使用 reshape2 (dcast) 或 tidyr (spread) 来做。我发现这两个包都没有在我的数据库对象上执行。我可以运行“收集”，但这会出现问题，因为该数据框太大而无法放入内存（因此我想在数据库中运行）。我的总体目标是使用 dcast/spread 使数据更宽，同时在过程中创建 0/1 标志。这就像我机器上的小数据样本的魅力，但在 DB 上不是很好。

下面是我正在工作的代码。连接到数据库并使用 dplyr 进行基本过滤。当我尝试使用 tidyr/reshape2 时，R 会抛出“类型无法识别”的语法错误

我正在从数据库（test1）中读取一个大数据文件。我无法在 R 中直接读取和处理的数百万行。

我想根据“horodatage”列从这个大文件创建子文件。我在下面给出了一个示例来从大文件中提取一个文件，但现在我想不仅在这两个日期之间对所有文件执行此操作。

拆分必须从“23/03/2005 11:00”这个日期开始，一直到大文件的末尾（大约在“31/12/2005 23:59”左右（来自数据库的test1）和持续时间一个子文件必须是 30 分钟（换句话说：每个子文件正好 36000 行）。

然后，每个子文件都必须以（A200503231100.dat、A200503231130.dat、A200503231200.dat、A200503231230.dat 等）的名称保存

horodatage 列的格式已经是

我开始的代码是：

如果您对这个大文件的循环有任何见解，那将非常有帮助。

我有一个shiny应用程序RPostgreSQL用于连接到数据库并临时查询数据。

此代码在应用程序初始化时运行，但一段时间后，连接被服务器终止：

如果我只是打电话：

再次，它创建了第二个连接：（我不希望这样）

（最终，已达到最大连接数，您无法创建另一个：https ://groups.google.com/forum/#!topic/shiny-discuss/0VjQc2a6z3M ）

我想创建一个连接到我的 PostgreSQL 数据库的函数（如果它还没有），并保持连接打开（通过 SELECT'ing 1）如果它有：

编辑 2016/03/12：不知道为什么，但我上面写的函数似乎不能正常工作......

当我调用它时，我得到：

特别是，这部分dbGetQuery(.sql$cxn, "SELECT 1")返回：

这个class输出是NULL（而不是错误？）。

任何想法我做错了什么？谢谢！

我已经使用 RPostgarSQL 包连接到我公司的 PostgreSQL 数据库。我想使用 dbListTable() 函数列出与某些命名模式匹配的表。在本机 PostgreSQL 环境中，我可以只使用 psql 命令

查找表。如何使用 RPostgreSQL::dbListTable() 做同样的事情？