问题标签 [rocks]

我习惯了 Torque，所以我希望一些 Sun SGE 大师可以提供帮助。我不知道为什么我的工作会在 3 小时后终止。在新安装的 ROCKS 6.2 上，作业被提交到没有竞争的空队列。少于 3 小时的工作没有任何问题。

这是服务器配置（我认为）

队列配置

这是一个正在进行的工作状态示例。

我需要编写一个使用库的许多功能（特别是Parasail）的 C MPI 代码，但是我的集群有三个不同的处理器，一个带有 Intel Xeon 的前端，16 个带有 Intel i3 的节点和 8 个带有 Intel Pentium 的节点- D. 我应该如何编译这个库并编写 c 代码以在我的所有 24 个节点中运行？

我使用 OpenMPI 和 Rocks 发行版。

提前致谢。

我的任务是维护一个 Rocks（基于 Centos 6.2）集群，其中头节点配置有一个到公共网络的静态 IP，并充当内部专用网络上计算节点的 NAT 路由器。这些节点通过标准以太网和 QDR Infiniband 连接到头节点。

最近，计算节点无法访问外部数据源以开始计算，因为当它们使用 wget 拉取公开可用的数据集时，DNS 查找失败。所有计算节点都在其 /etc/resolv.conf 中配置了头节点的 IP，我检查了头节点上的 iptables 防火墙，没有任何变化。SSH 在所有节点和头节点之间工作。当我使用某些数据源的IP地址进行手动传输时，数据再次流动，但某些应用程序无法使用IP来抓取数据。我已经尝试重新启动命名和 iptables 防火墙，但到目前为止还没有修复它。系统日志（dmesg、/var/log/messages）没有显示突然的故障或错误消息，我最近没有进行任何配置更改，直到大约 2 晚前，几个月来一切都运行良好。头节点可以很好地访问和解析名称，只有 NAT 头节点后面的计算节点不工作。

我仍然不熟悉 Rocks 的所有工作原理，并且不确定是否有一些特殊的 Rocks 命令我忽略了以使其再次工作。为了使 DNS 解析再次正常工作，我可能缺少什么？

提前致谢！

更新：DNS 在计算节点和头节点之间在内部工作（例如，compute-10-10 从所有其他节点解析为该节点的 IP 地址），因此头节点可以正常用作集群 DNS。对于所有计算节点，对本地区域之外的域的请求仍然失败（例如 nslookup google.com 失败）。

为了解决对我的一个程序的一些依赖，我必须在我的 centos 6.6 系统上安装 texinfo

结果是

我不知道如何解决这个问题。到目前为止，我已经下载了那个二进制 rpm。

谁能指出我正确的方向？

I am trying to make a hpc with rocks CentOS 7. After installing rocks, I have to connect the compute node to master node.

In terminal I have typed out insert-ethers to do the pxe(Preboot Execution Environment). After that I start my compute node with boot option as network pxe . After that it starts but shows this error:enter image description here

I have also tried that I have removed the node by rock remove compute-0-0 and rocks sync config but it's not working.

How can I fix it?

我目前正在使用 ifort（英特尔 Fortran 编译器）。但是，在 AMD 集群（具有 AMD 处理器）中，似乎无法安装 Intel parallel studio。因此我决定使用 gfortran（GNU Fortran 编译器）而不是 ifort。在 ifort 中，我的编译器标志是 ftn -heap-arrays -mcmodel=large -g -c 我想知道 GNU 编译器中类似的优化标志。我的 GCC 版本是 centos 6.6 中的 4.4.7，rocks 集群版本是 6.2。