问题标签 [rcpparmadillo]

我想使用 arma::mat 作为我的矩阵列表。

将 R 矩阵转换为 arma::mat 与 const 配合得很好。

但是当我使用带有矩阵的列表作为参数时，它需要很长时间。

我在让 Travis-CI 使用 R-oldrel (3.5.3) 在 Ubuntu 16.04 上安装 RcppArmadillo 时遇到了一些问题，尽管它适用于 R-release (3.6.1) 和 R-devel。我收到以下错误：

这是完整错误日志的链接：https ://travis-ci.org/jmgirard/circumplex/jobs/574588838

万一我搞砸了 travis 配置，这是我的 yml 文件：

这只是 R-oldrel 的问题，我需要等待它逐步淘汰，还是可以通过以某种方式更改配置来避免错误？提前感谢，如果这是一个愚蠢的问题和/或已在其他地方得到回答（我看了但找不到），我深表歉意。

我在尝试RcppArmadillo在 R 中安装时遇到此错误，并且让我发疯，我无法找到如何处理它：

关于如何解决它的任何见解/建议？

我正在使用 Armadillo 库在 C++ 中预置数据。程序最终产品是一个立方体，它是一个用无符号整数填充的立方体。运行后，我想将 ucube 加载到 R 以执行一些最终的统计测试。为此，我制作了一个 C++ 函数来加载 ucube 返回一个数组。

但它不起作用！
我收到以下警告：“警告：Cube::load()：B.bin 中的标头不正确”并且程序返回一个 0x0x0 数组。

为了找出原因，我做了一个玩具 C++ 程序，它运行良好。它能够毫无问题地加载多维数据集。

但我不知道为什么，在 R 中执行相同的步骤不起作用。为了说明，请将玩具程序运行为 ./a.out A.bin B.bin。它将产生Cube<double>A.bin 和Cube<uword>B.bin，我将在后面提到。

问题
如果我使用 Rcpp::sourceCpp 获取以下 C++ 代码并尝试Cube<double>使用它读取 A.bin read_cube("A.bin")，但如果我对Cube<uword>B.bin执行相同操作read_ucube("B.bin")则不会（我收到警告）。

当然，我可以在结束 C++ 程序之前Cube<uword>将 a 转换为 a Cube<double>，但我想知道为什么会发生这种情况以及是否可以Cube<uword>在 RcppArmadillo 中加载 a。因为这应该是可能的，对吧？

我试图从稀疏矩阵的非零条目创建一个向量，并认为“vectorise”函数可以解决问题。

Armadillo 文档表明“vectorise”函数从 9.400 版开始支持稀疏矩阵格式，但是当我尝试编译下面的代码时出现错误：

错误：从 'arma::enable_if2, arma::spop_vectorise_col> >::result {aka const arma::SpOp, arma::spop_vectorise_col>}' 转换为非标量类型 'arma::vec {aka arma::Col }' 请求 arma::vec B = arma::vectorise(A);

我的犰狳安装来自 RcppArmadillo R 包，我的版本为 0.9.700.2.0。

是我的问题，还是这是一个错误？

我正在尝试从通过元素“&”连接的其他两个逻辑向量中获取逻辑向量：

当我尝试编译时它返回以下错误

我不知道发生了什么。我猜犰狳做事不同。但是我找不到任何资源来帮助我解决问题。任何帮助，将不胜感激！非常感谢！

我试图构建一个包含 RcppArmadillo 代码的包，但总是遇到编译错误。为了简单起见，我开始时没有添加自己的代码。我第一次尝试

我运行“R CMD 检查测试”，没有返回错误。然后我对 RcppArmadillo 命令做了同样的事情，如下所示：

当我从命令行运行“R CMD check test1”时，我收到如下错误消息：

我进一步检查了 00install.out 文件，它说

有人对“错误：不支持的选项'-fopenmp'make”有任何想法吗？如何解决？

提前致谢！

更新：我按照网站上的说明进行了以下操作： 1. 更新 xcode 2. brew install llvm 3. 从 cran 下载 gcc 和 clang 8 并安装 4. 创建 ~/R 目录并创建文件 Makevars，如下所示：

5. 我创建了 test1 包（同样没有添加我的 R 代码或 RcppArmadillo 代码）。运行 R CMD 检查 test1。Clang 错误消失了，但我得到了新的错误：

对新错误有任何帮助吗？它是什么？谢谢！

我打算用从一系列步骤派生的值填充一个稀疏矩阵，以提高效率，OpenMP 用于加速这些进程，我发现它在使用 1 个线程时工作正常，但在多线程时遇到了段错误，我准备了一个简单的演示代码来重现错误，真诚地希望有人能帮我一个忙。

我按照R Compiler Tools for Rcpp on macOS (for R 3.6.x)中的步骤进行操作，但是当我尝试安装RcppArmadillo. 我没有安装 Xcode.app，而是更喜欢使用命令行工具。

这里发布的答案没有帮助:(

我很好奇如何将其转换为 Rcpp 格式？由于内存问题，R 的 as.matrix 方法不起作用

该函数来自此链接：Running cor() (or any variant) over a sparse matrix in R

附加信息：我能够使用 rcpp 创建一个 500kx500k 的稀疏矩阵，但我需要关联由于内存大小而无法使用 R 的稀疏矩阵，cor()这就是为什么我问我是否可以将上述函数转换为 Rcpp 模式得到稀疏矩阵的相关性

谢谢