问题标签 [r-qgraph]

我最近一直在使用LavaanR 中的包进行结构方程建模，并在生成路径图时使用该semPlot包，这似乎是从.qgraph

我发现它qgraph支持将图像（例如 jpeg 和 png）绘制为节点。

我的问题是是否有可能，如果可以，如何为路径图中的每个节点绘制不同的图像。我希望能够使用我研究项目的图片来填写路径图上的清单变量。谢谢！

我想在网络上查看我的数据中的关系，并使用了qgraph包来执行此操作，使用了我的数据combine.data。我作为输入传递的数据的相关性有很多 NA 值。我用来获取网络图的命令是

gr是组列表，nm是包含节点标签/标签的向量。该命令运行良好，但带有警告

网络有很多空边（非有限权重），我想删除具有非有限权重的节点。我试图设置最小和最大参数，但它仍然会出现那些冗余节点。任何有关如何实现这一目标的建议将不胜感激。

我遇到了 qgraph 包，我很感激我这样做了，因为我得到了许多美丽且内容丰富的情节。我目前正在使用一个更大的数据库，该数据库包含 2 个时间点在 15 种细菌中测量的 755 种代谢物，并且我无法在此处附上一个巨大的图，因为我没有 10 个声誉点。

我想看看代谢物之间是如何相互关联的，但我只想看到显着的相关性。因此，我使用了 Sacha Epskam 在他的网站上提供的代码：

正如我所提到的，有很多相关性，我想删除一些节点。我知道 qgraph 不允许您删除节点，因此我想知道是否有任何方法可以改善绘图的可视化。我将非常感谢任何建议！再次感谢您的时间和考虑！

最好的祝愿，

艾玛

我正在使用 R 来绘制网络图。交互矩阵看起来

相同交互矩阵的 Id 的元数据

1-是否可以使用 qgraph() 定义颜色？

2-当有两种以上的颜色和重复使用 efelse 时，是否可以使用 igraph.plot 定义颜色？

我有一个示例矩阵，如下所示：

我希望将行名分组，例如 BB100 和 BB104 将在“SLE”中，BB110 BB112 将在“RA”中，但不向矩阵添加列，因为我希望将矩阵放入 qgraph 函数中。理想情况下，“SLE”、“RA”等组将位于允许我运行的向量中

我希望这可以让我用所识别的组来可视化相关矩阵。

我是 R 新手，很抱歉，如果这个问题已经得到解答，但我整天都在努力寻找答案，但我似乎找不到答案 提前致谢

如何使用qgraphR 中的 -package 绘制非常小/接近零的值？

我正在跟进一个没有答案的老问题（https://stackoverflow.com/questions/31653029/r-thresholding-networks-with-inputted-p-values-in-q-graph）。我正在尝试评估变量之间的关系。为此，我使用了相关网络图。一旦我这样做了，我想实现一个显着性阈值组件。例如，我只想显示 p 值 <0.05 的结果。关于如何实现我的代码的任何想法？

数据集：https ://www.dropbox.com/s/xntc3i4eqmlcnsj/d100_partition_all3.csv?dl=0

我的代码：

输出：

此外，我还有一小段代码可以将 R2 值转换为 p.values：

代码：

干杯

为了便于阅读，我正在尝试在我的 qgraph 中的实际边缘之外插入边缘标签。我特别不喜欢在标签下方包含一个白色背景的选项，它会搞砸边缘。根据手册，可以仅沿线调整边缘标签位置，而不能在侧面调整。以前有人为此挣扎过吗？有没有可能绕过这个问题？干杯

我正在使用qgraph包来绘制相关网络，它显示正值和负值。由于日记的限制，我需要一个灰度图，因此可以轻松设置节点的颜色，但我在处理边缘时遇到了困难。我想为正 ( "solid") 和负 ( "dashed") 相关设置不同的线型，因此我们不需要节点和边的格雷码。'qgraph'中的参数lty只允许整个情节使用一种类型的线，我怎样才能让它工作？

这是一个暂定的解决方案

提前非常感谢！

我是第一次发帖，但我是这个网站的长期学习者。这是我的问题的答案第一次无法从以前的帖子中进行逆向工程，所以我希望有人可以帮助我解决它。

我正在尝试将爬山搜索算法（hc来自bnlearnR 中的包）的结果绘制在相关矩阵上作为 Reingold-Tilford 树图运行。

说我跑：

我得到了定向关系的 Fruchterman-Reingold 布局没有问题。

但是无论我如何格式化 hc.obj 中的信息，我都无法让树形布局工作。例如，使用“layout = tree”运行上面的代码会出现错误：“l[, 1] 中的错误：维数不正确”。

这是一个可重现的示例：

同样，如果我尝试通过 igraph 运行：

我收到错误“layout_as_tree(hc.obj) 中的错误：不是图形对象”