问题标签 [r-qgraph]

我在 R 中使用 qgraph。它会自动缩短节点标签，这非常有用。但是我如何要求它使用完整的标签？

这是一个例子。

我想要一个显示几个节点的图表，节点之间的方向箭头代表一种关系，其厚度与它们的连接强度有关。

在 R 中，这非常简单

产生：

但是在 Python 中，我找不到一个明确的例子。NetworkX 和 igraph 似乎暗示这是可能的，但我无法弄清楚。

我正在使用 R 中的 qgraph 包从邻接矩阵创建网络。我希望将节点绘制成同心圆，一个节点从中间开始，然后在不同的圆上绘制节点。

我收到了这段代码来创建这些圆圈并计算节点的坐标：

此代码适用于两个圆圈，中间有 1 个节点，下一个圆圈有 4 个节点，但第三个圆圈（应该还有两个节点）绘制在第二个圆圈上。对于这个圈子，我使用了以下代码：

有谁知道为什么会这样？是否有另一种方法来计算同心圆上节点的坐标？

谢谢！

我目前正在 R 中绘制一个 qgraph（弹簧），但我想知道是否可以改变图中节点的大小？

我正在尝试修改qgraph()r 包 qgraph 中的函数，以对图形参数进行一些重大更改。但在尝试进行这些修改之前，我访问了函数的源代码并将其作为新函数（即qgraph2()）重新加载并在 big5 示例数据上运行它。我收到的错误读取could not find function "getArgs"，我怀疑 getArgs 是一个隐藏函数。但是，我在 qgraph 环境或 r 全局环境中找不到 getArgs() ，并且在任何 r 文档中都找不到它的任何记录（?getArgs,??getArgs)，所以我不知道从哪里调用它或如何找到该信息。此外，我怀疑 qgraph() 函数中潜伏着更多隐藏函数。所以我的问题是双重的：首先，我怎样才能找到隐藏 getArgs() 的位置并相应地访问它，其次，有没有办法让我修改后的函数 qgraph2 访问所有这些隐藏的对象而无需单独调用它们。谢谢你。

我想在 R 中制作以下图片。我画了它，但我想根据它们的值加权边缘大小，使用这两种不同的颜色（红色和蓝色）和两种不同的边缘类型（虚线和非虚线） . 我该怎么做呢？

网络绘图

这是数据框的代码

我正在使用qgraph（我比 igraph 更喜欢它）进行网络可视化。尝试仅绘制重要边缘时，我发现了两个问题：使用推荐的参数选择方式，graph="sig"我收到以下错误消息：

qgraph 中的错误（gm_cor，graph = “sig”，layout = “spring”，diag = FALSE，：“graph”参数必须是“default”、“cor”、“pcor”、“association”、“concentration”之一, 'glasso' 或 'factorial' ...

到目前为止，我刚刚使用了"OmitInsig = T"似乎工作正常的解决方法（alpha = 0.05），但现在我将一些更简单的图表与我使用生成的实际 p 值矩阵进行了比较

并看到 qplot 绘制了一些根据 cor.mtest 不显着的边缘。

以前有没有人遇到过类似的问题，您是如何解决的？

编辑：添加示例：

)

当您查看图片时（对不起，只是一些丑陋的图片），您可以看到在 corrplot 中只有 6 个相关性具有统计显着性，并且都是正相关性。它与 qgraph 图不匹配。

1) 绘制所有相关性的图表：

2) 省略 insig

3) 关联图

示例数据集：

我正在使用 R 中的 igraph 创建一个由大约 600 个节点包围的单个“中心”节点的网络可视化。

节点重叠，然后我可以使用这个问题的答案（使用 qgraph）来解决。

但是，此解决方案似乎仅适用于大小相同的节点。在我的网络中，节点大小是可变的。有没有办法通过在确定节点之间的距离时考虑节点大小来避免重叠？

下面的示例代码：

这是结果：

但是现在当我更改节点大小时：

...节点重叠：

感谢您在这里的任何帮助！

* 编辑 - 添加示例数据集：前 50 个节点 *

节点数据：

链接数据：

我正在尝试使用qgraph(). 到目前为止，我尝试过：

l是 100 个权重矩阵的列表。

在 for 循环之外创建绘图没有问题。

for 循环也适用于 with plot()，而不是qgraph()。

或者我使用：

使用qgraph.animate()创建 100 个图。有没有办法拯救他们？这也将具有能够使用约束参数的好处。

中心性数据打印良好，但中心性绘图命令仅生成强度图。没有接近或中介的情节——我如何获得后两者？

我正在使用 RStudio 和提供的数据浏览 Costatini 等人 (2015) 教程：https ://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092656614000701

在 RStudio 工作的 R & qgraph 新手。

中心性 <- centrality_auto(network) 中心性

nc <- centrality$node.centrality nc

ebc <- centrality$edge.betweenness.centrality ebc

中心图（网络）