问题标签 [r-mice]

我想在我的包中包含mice::mice 函数来对我的数据执行插补。

我使用 Roxygen 列出进口

这个函数在我测试代码时工作正常，但是当我构建包并尝试使用它时，我收到以下错误

我试图将错误中提到的所有功能添加到导入中，但它对结果没有任何影响。

我错过了什么？我从来没有发现过这样的问题。

我正在尝试使用 R 中的 MICE 包来估算数据。我可以包含我的数据，但我认为这不是这里的问题。

当我尝试运行“完成”功能时：

我得到：

有任何想法吗？它为什么要寻找路径？我的第一篇 StackFlow 帖子，如果我需要包含更多信息，请告诉我。

这里的一个例子

在这一点上，一切都符合教程。然后我运行：

我收到错误消息：

` list.files（目录）中的错误：无效的“路径”参数

所以我使用mice包来估算丢失的数据。我是插补的新手，所以我已经到了一定程度，但遇到了陡峭的学习曲线。举个玩具例子：

如您所见，我主要使用默认设置对 df1 进行了 10 次估算——我很乐意在回归模型、汇总结果等中使用此结果。但是在我的现实生活数据中，我有来自不同国家的调查数据。因此，缺失的程度因国家而异，特定变量的值也不同——即年龄、教育水平等。因此，我想估算缺失，允许按国家/地区进行聚类。所以我将创建一个没有缺失的分组变量（当然在这个玩具示例中，与其他变量的相关性缺失，但在我的真实数据中它们存在）

那么我如何判断mice()这个变量与其他变量不同 - 即它是多级数据集中的一个级别？

我不确定这背后的原因是什么。

我有一个包含 107 个变量的数据集（混合了数字和因子数据类型），其中一些包含缺失值。我用老鼠来估算数据。

MICE 估算了大多数变量的数据。然而，一些变量根本没有被估算。

很奇怪，虽然有些变量被成功地估算了，但有些却没有。我还尝试仅在未成功估算的变量上运行 MICE，这一次成功了。

这背后的原因是什么？它与我的数据集中的变量数量有什么关系吗？我该如何解决这个问题，或者我需要为每个变量单独运行鼠标？

非常感谢，

编辑我现在给出代码来复制我的意思。

我正在使用mice 包来插入一些缺失值。我在很多情况下都成功地使用了鼠标，没有任何问题。但是我现在面临一个前所未有的问题，即在第一次迭代后出现以下错误：

我试图查看文档，但找不到任何有用的东西。我在互联网上查找了错误并找到了这个https://stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2015-December/434914.html但我无法找到所描述问题的答案。

遗憾的是，我无法提供数据的工作示例，因为 my_data 包含我不拥有的私有数据，因此无法公开。my_data 是一个 dplyr 数据帧，但是看起来使用 dplyr 或“基础”数据帧没有区别。

谁能解释一下发生了什么以及（可能）如何解决它？谢谢你。

编辑：添加了更多关于回溯的信息：

我正在尝试通过使用 R 中的 miceadds 包从 SPSS 创建的多重插补数据库中汇集结果（我对 R 很陌生，如果术语有点偏离，我很抱歉）。当我尝试使用 as.mids2 代码将数据库更改为 mids 对象时，我收到以下错误消息：

有人知道这意味着什么吗？数据库是 28 个变量，有 2378 个 obs，所以不大。

这是我正在使用的脚本：

任何帮助将不胜感激。

处理大量变量并paste0()使用传递给函数的变量通过构造公式 (via) 处理它们。我偶然发现了一个我无法弄清楚的问题/错误。用一个玩具例子最容易解释：

我该如何解决这个问题？为什么找不到BMI？

我有大量(4M x 17)缺失值的数据。两列是分类的，其余的都是数字的。我想使用 MICE 包进行缺失值插补。这是我尝试过的：

在整个数据集上运行插补计算成本很高，所以我只在前 10 万个观测值上运行它。然后我尝试使用输出来估算整个数据。

我的方法有什么问题吗？如果是，我应该怎么做才能使它正确？如果不是，那么为什么我会收到此错误？

我正在尝试分析一些数据作为我论文的一部分，但开发代码被证明是不可能的（对我来说）

我正在使用更大数据的子集来开发我的代码。（不知道如何链接数据框）

本质上，X,Y值来自 24 孔板。记录周期结束后，该grp值将增加 N+1（只是巧合，grp/well以相同的值结束）。

在每个记录周期之后，记录会中断，一旦完成，记录将恢复。我目前正在尝试分析我设置为的数据中的缺失值NA。为了找到缺失的值，我使用了 MICE 包，使用了这段代码（如下）。我希望wellMICE 包单独分析每个组，而不是一次性分析所有X坐标Y。

两件事 - 首先，for 循环非常慢，我不确定提高脚本速度的方法。我最初的想法是在我的 df 中创建一个新列，每次df$well值更改时都会填充 N+1 ，因为这将包含df$well& df$grp，但我一直无法想出一个函数来生成它。生成新列后，我可以使用一个 for 循环，而不是上面的两个 - 我认为这会提高速度吗？其次，上面的脚本不断地重写“temp_df”，而我要求它添加到它——我尝试使用搜索结果中建议的“rbind”和“apply”，但无济于事。

如果这看起来相对简单，或者已经在其他地方得到了回答，我们深表歉意。正如我所说，我对 R 和一般的计算语言相对较新。

我正在使用miceR 中的包来对一些缺失的数据进行乘法估算。我需要能够指定传递给with(df, glm(y ~ x))函数内部构造的公式。这种with()结构是包用于在每个估算数据集中mice分别拟合回归模型的格式。

但是，我无法弄清楚阻止我成功将公式作为参数传递的范围问题。这是一个可重现的示例：

另请参阅此处以了解在 R 帮助上提出的相同问题，尽管它没有收到答案。