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在我的 R Markdown 文档中，有时我只想生成一个报告而不显示实际代码（特别是当我将它发送给我的老板时）。如何隐藏 R 代码并仅显示图形和结果？

例如：

这显示了命令和情节。如何从我的 HTML 报告中删除命令？

我在 RStudio 中将 R 脚本 (.R) 转换为RMarkdown文件 (.rmd)，然后按“knit html”会生成两个输出文件（即 .html 和 .md 文件）。我面临2个问题：

该html文件显示ggplot图表的标题被切掉了。我已将原来的宽度 11 更改为新的宽度 15：

我将如何解决这个问题？以及如何将 .md 文件转换为 PDF 文件？

我正在尝试为 R Markdown 文件编写 Jekyll 转换器。我创建RMarkdownConverter.rb并将它放在我的_plugins目录中。我已经验证了其他插件正在工作，但这个不是。我也没有看到任何错误消息，包括我自己输入的错误消息。这似乎没有被使用。然而，Jekyll 正在为我的文件生成一个 HTML 文件，.Rmd但只是将 R 卡盘作为代码卡盘处理。任何帮助或想法将不胜感激。

RMarkdownConverter.rb文件：

我的第一篇 R Markdown 帖子的内容：

我正在编写一个 Rmd 文件，由 knitr 处理成 HTML。它包含一些生成图形的 R 块，这些图形存储为 HTML 中的数据 URI。

1）如何为这样的图像添加标题？我想要一个标题，上面写着“图 3：等等等等”，其中“3”是自动生成的。

2) 我以后如何引用此图像，即“如图 3 所示，等等等等”。

我正在使用带有 R Markdown 和 knitr 的 xtable 来生成我用 \input{} 调用的 .tex 文件。效果很好，但我还没有想出如何创建像这里显示的那样的多列。有谁知道如何做到这一点？

到目前为止，我正在使用：

我想在每个“平均值”和“标准差”（“治疗”和“控制”）上有一个不同的分组标题。

或者，有没有更好的方法来使用 R Markdown/knitr 自动生成表格？我不想手动编辑表格，因为报告需要自动生成。

更新： @agstudy：我是乳胶新手，但我认为这是我希望使用 xtable（或类似 xtable）自动生成的输出：

更新 2： @Jonathan：我读了几遍才明白你的建议。我接受了你的建议，它奏效了。

在我现在使用的 R 降价块中：

然后在正文中，我使用：

我会看看是否有人对本机 xtable（或其他包）解决方案有任何其他建议。否则，我会接受你的回答。谢谢！

我正在使用 RStudio、R Markdown、Latex 和 Pandoc 来清理数据、构造变量、运行分析并报告结果。我对可重复研究的概念不熟悉，但我被迷住了。很有意义。

动态表格和数字没有问题。然而，动态文本难倒我。我可以插入内联代码来说明所有统计数据中有 95% 是错误的，但我不确定如何以可重现的方式改变我的语言。

例如，如果我有一个对象 x=0.66，我想写“三分之二的牙医使用 Crest”怎么办？我可以查看 x 的当前值 0.66，然后在文本中键入“2 out of 3”，但这是不可重现的。假设我得到新数据并重新运行分析，x 变为 0.52。我的文字会过时。当然，我可以动态报告 52% 的牙医更喜欢 Crest，但是当所有内容都以百分比报告时，报告就会变得陈旧。

我的想法是，当我想改变写作时，我可以创建可以在文本中调用的函数。例如，“out.of”函数可以处理 if else 语句来生成文本：

我还可以创建一个分数函数，它可以对十分之一、五分之二、三分之一做类似的事情......

我相信其他人已经解决了这个问题。有什么线索吗？想法？

I am trying to generate the following plot as an html document, using Rmarkdown, in Rstudio:

But I get the following error:

However, the plot generates perfectly in the Rstudio 'Plots' display. Is there something that can be done so that Rmarkdown can find the function and display the output? Thank you

我有一个 Rmd 文件，它使用工作目录中保存的一些 Rdata 并显示它们，非常简单。我什至有缓存 = FALSE。当我单击 kintHTML 按钮时，我得到了 html 页面。当我转到 Rstudio 控制台并输入 knit('TestReport.Rmd') 时，我收到错误消息

评估错误（代码，envir = env，new_device = FALSE，stop_on_error = opts_knit$get（“stop_on_error”））：未使用的参数（new_device = FALSE，stop_on_error = opts_knit$get（“stop_on_error”））

有什么问题？我也安装了评估包。

可能重复：
Sweave，包括源 R-Function 文件

我正在使用 knitr 进行报告。我将所有分析代码作为函数编写在一个单独的 R 文件中。然后我使用这些函数在 R Markdown 文件中编写了分析命令。最终生成的 HTML 文件看起来不错。我想在 R Markdown 文档中添加最后一个部分，我可以在其中列出原始 R 文件中的所有函数。我做了以下事情：

生成的 HTML 文件中的输出如下：

这看起来不漂亮。我想正确格式化 knitr 中的 R 文件列表。我总是可以复制和粘贴，但我正在寻找更优雅的解决方案。谢谢！

我正在使用 Rstudio 用 Rmarkdown 语言编写报告，然后使用 pandoc 将md文件（不是Rmd文件）转换为doc格式。doc每个图形在输出文件中都有一个标题： “plot of chunk unnamed-chunk-xxx”。我当然可以在md文件中修改这个caption，但是不知道是不是可以直接在Rmd文件中修改。