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我想从 Python 程序中访问 R。我知道 Rpy2、pyrserve 和 PypeR。

这三个选项的优点或缺点是什么？

我想我在 pyRserve 中发现了一个错误，但不知道在哪里报告。

当我使用 pyRserve 时，我可以按预期的方式得到一个 R 矩阵：

但是，当我尝试对使用 data.matrix 转换的东西做同样的事情时，我得到了这个：

它使尺寸正确，但按列而不是按行填充它们。

有人知道怎么修这个东西吗？或者至少如何向开发人员报告？

谢谢; 凯尔

我对 R 很陌生，并且非常习惯于 python。我不太习惯编写 R 代码。我正在寻找 R 的 python 接口，它可以让我以pythonic 方式使用 R 包。

我做了谷歌研究，发现很少有可以做到这一点的软件包：

• Rpy2
• 派珀
• pyRserve

但不确定哪个更好？哪个贡献者更多，使用更积极？

请注意，我的主要要求是访问 R 包的 pythonic 方式。

在 python 中创建了一个大数据框（几百万行，几千列）。此数据帧将使用 PyRserve 传递给 R。这必须很快——最多几秒钟。

pandas 中有一个 to_json 函数。对于如此大的对象来说，往返 json 对话是唯一的方法吗？这么大的物体可以吗？

我总是可以将它写入磁盘并读取它（使用 fread 快速，这就是我所做的），但是最好的方法是什么？

我在 pyRserve 包的 Windows 7 上进行了 easy_install，但运行时import pyRserve出现以下导入错误。

我正在使用 Python 2.7.5。

有什么建议么？

我正在使用 pyrserve 从 python 调用 R 脚本文件。我有 rserve 正在运行。在 R 脚本中的任意点，pyrserve 给出错误并退出：

我设置rserv.conf了以下内容：

有人知道为什么会这样吗？这看起来像是一些缓冲区问题，因为 R 脚本自己运行。

我在 R 中安装了 RServe，在 Python 中安装了 pyRserve。两者都工作得很好。我遵循了文档https://pythonhosted.org/pyRserve/manual.html，一切运行良好。但是，当我尝试运行与 sapply 相关的示例时，出现以下错误：

我尝试使用 conn.ref.abs，但仍然出现相同的错误。您知道这是否是规范的更改，还是有其他方法可以做到这一点？

谢谢！

当从 python 与 Rserve 会话交互时，pyRserve 模块非常方便。

您可以通过在其名称前加上“conn.r”或“conn.ref”等表达式来访问 R 对象

但是如果函数名中有一个点，这将不起作用，

我想出的唯一解决方案是将整个 R 表达式包装在一个字符串中并使用 eval 函数运行它：

有没有更有效的方法呢？

注意：我意识到在另一个 SO 线程中，类似的问题已被问及 rpy2 模块（另一个 python R 绑定）的答案。

我正在编写一个小型 Flask 应用程序，并使用 pyRserve 将其连接到 Rserve。我希望每个会话都启动然后维护自己的 Rserve 连接。

像这样的东西：

不起作用，因为连接对象不是 JSON 可序列化的。另一方面，是这样的：

不起作用，因为它不会在请求之间持续存在。更困难的是，pyRserve 似乎没有为连接提供任何标识符，因此我无法在会话中存储连接 ID 并在每次请求之前使用它来检索正确的连接。

有没有办法实现每个会话都有一个唯一的连接？

我需要使用 Python 执行各种任务：敏感性分析、优化和模拟启动。然而，模拟结果的第一次后处理依赖于 R 和存储在 Rdata 中的庞大数据库（8 Gb，一些数据表代表高达 3 Gb）。所以我需要迭代 R 脚本的调用而不迭代数据加载（这需要几分钟）。我首先尝试使用 pyRserve，但我面临的内存限制似乎比原始 R 更具限制性。

和：

我收到以下错误：

所以：

1/ 有没有办法为 Rserve 分配更多内存（通常是在原始 R 中分配的数量，即我的配置为 16 Gb）？

2/ 是否有替代 Rserve 以一劳永逸地加载 Rdata 然后在同一工作区中运行 R 脚本？