问题标签 [pygraphviz]

我正在为 Python 使用graphviz库。

当我从终端运行脚本时，会创建图表，但是当我使用posix_spawn从C程序启动脚本时，我收到错误消息说

“ValueError：在路径中找不到程序点”（我尝试了所有选项：'neato'、'dot'、'twopi'、'circo'、'fdp'、'nop'）。

我的 Python 脚本使用#!/usr/local/bin/python位置。我尝试明确使用此路径并尝试了相同的顺序：

它奏效了

我不知道为什么在使用 posix_spawn 调用脚本后，graphviz 库无法再找到路径。

编辑：

将点路径添加到：bash_profile、bash_rc 和 etc/paths 后，当我尝试从 Python 脚本和 C 程序打印路径时，我得到 /usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin，而我的 echot $ PATH 有很多行。

还尝试从 Python 附加 PATHsys.path.append('/opt/local/bin/dot')

PS 我使用 Webots 作为我的 IDE

我在图中有以下简单节点：

产生这个输出：

如何使边框对齐，以使嵌套表格之间的任何地方都不会出现双边框？我设法摆弄 CELLSPADING=-1 但我不认为这是要走的路吗？我不能使用 COLSPAN 选项，因为输入和输出端口的大小是可变的，这就是为什么我用一个用于输入和输出单元格的嵌套表来解决这个问题。

当我这样做时：

G.draw('file.png')

我有以下错误：

格式：“png”无法识别。使用以下之一： canon cmap cmapx cmapx_np dot eps fig gv imap imap_np ismap pic plain plain-ext pov ps ps2 svg svgz tk vml vmlz xdot xdot1.2 xdot1.4

我试着跑

这似乎并没有改变任何东西。

要安装（或重新安装）Graphviz，我确实使用了：

conda install -c https://conda.binstar.org/mutirri graphviz

点 -v 的输出

不起作用的示例：

如果我用 svg 替换 png，则该示例有效。

我尝试使用 pygraphviz 打印图表。我运行以下代码并收到以下错误。代码：

错误：

我安装了 pydot、matplotlib、pygraphviz、numpy、python-devel、cairocffi。

如果有人知道问题出在哪里，谢谢

我正在尝试在 python 的 networkx 中的 graphviz 布局中绘制一个 100 节点多图 G，所以到目前为止我进行了两次试验：

试用 1 nx.draw_graphviz函数如下nx.draw_graphviz(G)，但对于图中的所有节点，我得到以下错误重复：

错误：节点 1，位置 [0.127506302389087, 0.3262608552621944]，预计两个双打

然后试图找出一个解决方案，我使用试用 2 A=nx.to_agraph(G)来获取 pygraphviz 图表，但是当我尝试绘制时，nx.draw_graphviz(A)我得到以下错误：

AttributeError：“AGraph”对象没有属性“number_of_selfloops”

nx.graphviz_layout但它返回一个由节点键入的位置字典，我不知道如何使用它来绘制 graphviz 布局。

注意我导入了 graphviz、pygraphviz 和 pydot 模块，但我不知道哪些是真正需要的，但它仍然不起作用。

在graphviz布局中绘制networkx图是否缺少一些东西？

完整的错误跟踪

试验 1

试验 2

我已经试过了

我也尝试过这个答案，但仍然无法正常工作

Python 看不到 pygraphviz

我在安装 PyGraphviz 时遇到问题。我在 Mac OS X 中使用 Anaconda。

错误消息指出了一些原因，但我已经检查过它安装在 anaconda 目录中。

根据错误消息，如何更改 setup.py 中的 include_dirs 和 library_dirs 变量？

这是我遇到的错误消息

我正在尝试使用 python 中的 networkx 库打印二叉树。

但是，我无法保护左右孩子。有没有办法告诉图表先打印左孩子，然后是右孩子？

</p>

编辑 1：在使用 pygraphwiz 时，它至少会产生一个有向图。所以，我对根节点有更好的了解。

下面是我正在使用的代码：

但是，这仍然远非结构化格式。我将发布我接下来发现的内容。新图如下所示（至少我们知道根）：

编辑 2：对于那些遇到安装问题的人，请参阅这篇文章。 答案- 如果您想在 Windows 64 位上安装 pygraphviz，它非常有用。

生产

这是由于结肠。

so.dot：

请注意，它会剥离冒号及其后面的所有内容。

如果我手动将其更改为

没关系。其实有没有节点没关系，只要有边就行。

如果我删除 and 之间的空格:，t则只生成 A 和 B 。

我尝试过以各种方式逃避冒号，但这似乎不起作用。显然，我每次都可以手动删除节点，但脚本解决方案会更好。（而不是通过 .dot 文件的第二个脚本）

有人有想法吗？

如何在 Graphviz dot 中生成如下图所示的 UML 类模板节点？