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每个人都迁移到 MPI（消息传递接口）还是 PVM 仍然广泛用于超级计算机和 HPC？

在使用 PVM 3.4.5-12（使用 apt-get 时的 PVM 包）的 Ubuntu 9.10 上，添加主机后程序终止。

当前配置仅 $PVM_RSH = bin/usr/ssh
我可以在没有密码的情况下完美地 ssh 进入从站，并在其上运行命令。

有任何想法吗？
提前致谢！

以下是示例日志：

笔记本电脑日志

[t80040000] 02/11 10:23:32 笔记本电脑 (127.0.1.1:xxxxx) LINUX 3.4.5
[t80040000] 02/11 10:23:32 准备就绪 Thu Feb 11 10:23:32 2010
[t80040000] 02/11 10:23:32 netoutput() 发送到：errno=22
[t80040000] 02/11 10:23:32 em=0x2c24f0
[t80040000] 02/11 10:23:32 [49/à][6e/à][76 /à][61/à][6c/à][69/à][64/à][20/à][61/à][72/à]
[t80040000] 02/11 10:23:32 净输出() sendto: 无效参数
[t80040000] 02/11 10:23:32 pvmbailout(0)

领结日志

[t80080000] 02/11 10:23:25 bowtie-slave (xxx.xxxxx:xxxxx) LINUX64 3.4.5
[t80080000] 02/11 10:23:25 准备好 Thu Feb 11 10:23:25 2010
[t80080000] 02 /11 10:28:26 work() 运行 = 启动，等待主服务器超时
[t80080000] 02/11 10:28:26 pvmbaiout(0)

有人知道哪个资源管理器适合 PVM 吗？或者我不应该使用 PVM 而是依赖 MPI（或它的任何版本，例如 MPICH-2 [还有其他更好的吗？]）。使用 PVM 的主要原因是因为我之前开始这个项目的人假设使用 PVM。然而，既然这个项目是我的（他没有做过任何依赖 PVM 的重要工作），这可以很容易地更改，最好是易于安装的东西，因为安装和设置 PVM 是一个很大的麻烦。

我倾向于 SunGridEngine，因为我是如何拥有专用硬件的，并且在阅读了另一篇关于哪些更适合专用硬件的帖子后，SGE 似乎是赢家。但是我不确定它使用 PVM 的性能。想知道是否有人对 PVM 和 SGE 有任何经验？

如果人们使用 SGE，您使用什么来从计算机到计算机（或虚拟机到虚拟机）进行通信

哦，如果这很重要，我将运行 Perl 应用程序/行。

有什么建议或想法吗？

提前感谢所有评论，

• 秋格

我正在尝试使用 PVM 并行化算法以进行大学作业。我已经对算法进行了排序，但并行化几乎只能起作用 - 该过程会无缘无故地间​​歇性地卡住。我看不到任何模式，使用相同参数的运行可能会工作 10 次，然后就会卡在下一次努力中......

没有任何pvm功能（在主进程或任何子进程中）返回任何错误代码，子进程似乎成功完成，没有错误到达控制台。看起来主人并没有收到孩子们的每一次交流——但只是偶尔跑步。

不过，奇怪的是，我不认为它只是跳过了一条消息——我还没有从一个孩子那里丢失一个结果，然后成功地发送了一个完整的信号（也就是说，我还没有运行到达完成和返回一个意外的结果） - 就好像孩子刚刚断开连接，并且来自某个点的所有消息都停止到达。

批量处理结果并发送更少但更大的消息似乎可以提高可靠性，至少感觉它不那么频繁 - 我没有确切的数字来支持这一点......

PVM 会丢失通过其及其朋友发送的消息是正常的、普遍的还是预期pvm_send的？请注意，如果所有进程都在单个主机或多个主机上运行，​​则会发生错误。

难道我做错了什么？我可以做些什么来帮助防止这种情况发生吗？

更新

我在一个非常简单的测试用例中重现了该错误，代码如下，它只产生四个孩子，每个孩子发送一个数字，每个孩子将收到的数字乘以 5 并将其发回。它几乎一直有效，但有时我们只打印出三个数字而冻结 - 缺少一个孩子的结果（并且说孩子会完成）。

掌握：

孩子：

我可以告诉你，这是我很长时间以来见过的最疯狂的事情。

我在 CentOS 5.4 上运行了这个（部分）sh 脚本：

这给出了以下输出：

如您所见，GOLD_DIR变量已设置（脚本找到它，如后缀“ <--”的输出所示）！GOLD_DIR如果我取消注释脚本代码（第一个片段）中变量的导出，一切正常。

编辑：GOLD_DIR在/etc/profile（使用export GOLD_DIR=/share/apps/GOLD_Suite/GOLD）中导出

任何想法为什么？

注意 1：我不知道这是否重要，但这是 PVM 上的生成脚本。

注意2：脚本是用sh编写的，#!/bin/sh但我使用的是bash ...

Edit3：我让它工作，但我不知道为什么！- 好的，我所做的就是将主机名（用sudo hostname abc）重命名为我 ssh 进入的机器的名称（例如 abc）。之前 PVM 是列出机器的全名abc.mycompany.local。请注意，两者abc.mycompany.local和abc是同一台机器。

基本上我想实现这样的目标：

在带有 pthreads 库的 C 语言的 MPI 中。
我已经在 PVM 中做到了，这里是源代码：
master.c：http :
//pastebin.com/wwEie7gn，slave.c：http ://pastebin.com/gfeCkcss 。
我试图做的事情：
prog.c : http://pastebin.com/tCVKN3fe
不知何故接收器线程没有收到任何东西。我不知道问题是什么。我希望有人能告诉我正确的方法。
我正在运行没有线程支持的 MPI 编译。

我正在使用 Ubuntu v11.04。如何设置 PVM 的环境变量？

在手册中，它写道，“最简单的方法是在 .cshrc 文件中设置这些变量”，但我找不到任何 .cshrc 文件。我找到 cshrc.stub。

如果有人曾经使用过 PVM？

我正在将一个项目从 PVM 迁移到 MPI。我想问一下这里是否有人这样做过，是否有任何关于 PVM 和 MPI 中函数之间对应关系的教程或手册。

我尝试构建PVM代码。为此，需要一个没有密码的 ssh 连接。我搜索了很多，我找到了一个教程，我实现了相同的，但它没有用。

我的工作：-

1. 主人是jhamb。

2. 奴隶是天真的。

3. 首先，我使用命令在 master(jhamb) 上生成 ssh 密钥

   ssh-keygen -t rsa

4. 然后我使用命令将 id_rsa.pub 文件复制到 slave(naveen) 机器中

   scp /home/jhamb/.ssh/id_rsa.pub naveen@10.40.54.92:/home/naveen/.ssh/authorized_keys

5. 然后我从主人登录到奴隶。，通过使用

   ssh naveen@10.40.54.92

6. 但它总是要求输入密码。

帮我解决这个问题，然后只有我可以为 PVM 进一步配置。

寻找您的善意回应。

我试图在主机中添加从机。但是当它添加时，它会要求输入密码。我不明白。

大师= jhamb

奴隶= naveen, raja, gaurav

请解决以下错误。寻找您的善意回应。

控制台快照：-

当我尝试添加任何主机时，它会显示这些行

vim /etc/hosts 显示：-

已编辑

我在这里写，关于我的工作，我到目前为止所做的事情

1. 下载 pvm3 tar 文件。
2. 设置所有变量以运行 PVM。
3. 导出 PVM_RSH=/ur/bin/ssh
4. 在主从之间建立无密码连接。
5. 在单机上运行简单的代码，它可以工作。
6. 当我尝试在主服务器上添加从服务器时，通过使用命令 add naveen.my.domain 它说相同，如上图所示。

我认为现在信息已经足够了。

编辑编号 2

当我跑步时ssh -v naveen@10.40.54.92，它说，