问题标签 [pvclust]
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r - 如何从 boot.hclust 对象(pvclust)中提取节点位置?
我知道我可以从 pvclust 的最终对象中获取 au/bp 编号,但我无法弄清楚哪些样本或边缘与它相关联。我想要做的是将 au 值分配给样本。谢谢!
r - pvclust 编辑树状图
我正在运行一些集群分析,我正在使用 pvclust,如下所示:
我想编辑图表并删除红色、绿色数字和灰色数字。我还想根据特定列在 x 轴上着色标签mtcars$cyl
r - pvclust 可以组合的不是变量,而是 obs。在 R 中
让我们以它为例
我们看到 pvclust 结合了变量。是否可以在集群中结合观察
IE。我想要输出(带有集群变量)
如何将集群与观测值联系起来
r - pvrect() 水平树状图中的矩形 (R)
我正在尝试在水平树状图中围绕集群绘制矩形。只要我只手动砍树,这很好用,例如
但是,我还想突出显示 发现显着的集群pvlust()
,到目前为止,我只能通过 来完成垂直树状图pvrect()
。
我相信该函数还有更多工作要做rect.dendrogram()
,但我不明白我需要从哪些值中获取pvclust()
以及将这些值放在哪里。
任何人都可以提供解决方案吗?非常感谢!
r - 在 R 中查看具有许多节点的 pvclust 树
有没有办法查看节点太多(大约 10000+)的层次树?更改文本大小根本不是查看标签的可行选项。我尝试转换为树状图并切割,但 p 值消失了。我还需要查看 p 值。