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目前我能够打开、显示和对 DICOM 图像进行一些图像处理。我也可以用鼠标画多边形。

有人可以告诉我如何使多边形的内部为 1 和外部为 0。然后我想做的是将这个“掩码”与原始图像相乘，从而创建一个感兴趣的区域。我对该投资回报率中的信息感兴趣。

我已经安装了 OsiriX 是我的计算机，它是一个开源 DICOM 查看器。我想知道这与 PACS（图片存档和通信系统）或 RIS（放射学信息系统）有何不同。OsiriX 怎么能被纳入其中之一？

只是试图更好地理解这 3 个明显不同但相互关联的概念。

matlab中如何将DICOM图像转换为灰度图像？

谢谢。

这是我试图在 Python 中完成的工作（请记住，我对 Python 比较陌生）：

1. 将 DICOM 图像转换为 xyz 坐标列表及其各自的像素值，并将列表导出到 .csv 文件。
2. 从上一个任务中生成的 xyz 坐标和像素值列表重新生成相同的图像。

到目前为止，我已经能够读取 dicom 图像并通过使用 pydicom 和 numpy 将它们转换为数组。我还能够通过几个 for 循环提取像素和坐标值，并将该列表导出为 .csv。但是必须有更好的方法来保持某种质量控制，因为当我尝试重新生成图像时（通过使用另一组 for 循环），我没有得到原始图像。

我需要这两个函数在不同的 python 脚本中单独运行。

这是我到目前为止所拥有的：

对此问题的任何帮助将不胜感激。

干杯 AFH

我将致力于实现 dicom 文件的 3d 显示，我想知道哪种技术更易于使用：Java 3D 还是 VTK？我不是很有经验的程序员，但我已经创建了一个基于 dcm4che 开源库的 DICOM 查看器。

有什么提示或经验可以分享吗？

我目前正在从事图像处理项目。我正在使用 Python、SimpleITK、numpy 和其他几个库来获取一堆 DICOM 图像，将它们转换为 3D numpy 数组，然后使用 SITK 或其他数学技术（掩蔽、 ETC。）

现在，我正在尝试制作一个平均滤波器，它取 3x3 邻域的平均值，并用该平均值替换该邻域的中心像素。结果只是一个模糊的图像。由于 Python 并不擅长快速循环遍历 300x300x400 像素，因此我正在尝试使用 C 库来为我做这件事。问题是，我不擅长 C。（或者是 python ......）

下面是我的 C 代码：

这是我正在使用的一些 python 代码。poststack 是一个大型 3D numpy 数组。

我应该提一下，我查看了这篇 StackOverflow 帖子，我看不出我在做什么与提出原始问题的人不同......

将 Numpy 数组传递给 C 函数以进行输入和输出

我知道我犯了一个愚蠢的错误，但这是什么？

我有 3 个大小为 dicom 的堆栈512x512x133, 512x512x155 and 512x512x277。我想重新采样所有堆栈以制作尺寸512x512x277, 512x512x277 and 512x512x277。怎么做？

我知道我可以使用切片厚度和像素间距进行重采样。但这并不能确保在每种情况下都有相同数量的切片。

我正在使用 ct 扫描原始格式的医学图像。它基本上是一个 3d 体素矩阵（512*512*nb 个切片）。我想将文件的每个切片提取到单独的文件中。

结果绝对看起来像胸部 ct 扫描，但图像的纹理很奇怪，好像像素放错了位置。

一些相关信息可能位于关联的 .mhd 信息文件中，但我不确定在哪里查看：

我有一系列构成单次扫描的 DICOM 图像。我想构建一个 CGAL 网格，表示通过阈值化从该扫描中分割出来的 3D 体积。我更喜欢 Windows 和少数易于构建的依赖项（如果有的话）。

我听说 ITK 可以用于此目的，但它是一个大型库，与 CGAL 有很多重叠。还有其他选择吗？

我有 2 组 1 位受试者的 DICOM 图像数据，包括同时拍摄的 PET 扫描和 CT 扫描。Frame of Reference UID 不同，我认为这意味着它们的参考来源不同。这样就无法比较“图像位置患者”标签。

我想要做的是重新采样两个图像，使它们的空间尺寸相等并且它们的像素尺寸相等。这项任务似乎相对简单，但事实上它们的起源不同。

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