问题标签 [mathematica-8]

我需要获得一组具有亚像素精度的二进制图像中组件的质心（质心）。

Mathematica 8 有一个很好的补充：

但是当这些结果显示与其他地方进行的其他计算不一致时，我遇到了一些麻烦。

所以我推出了自己的，也许不太好：

您可以看到这些结果之间存在 0.5 的偏移：

起初我认为问题与图像尺寸是偶数还是奇数有关，但事实并非如此。

我更喜欢使用ComponentMeasurements[ ..,"Centroid"]和纠正结果，但我担心未来的 Mma 版本可能会修改这种行为并破坏结果。

我还可以使用已知图像运行先前的“校准”并计算偏移量，因此它会自动更正，但我想先了解发生了什么。

这是一个错误吗？
关于为什么会发生这种情况的任何想法？

我在 MacOSX 上运行 Mathematica 8，试图将最简单的程序编译为 C。任何与 C 相关的东西在 Mathematica 中都不起作用。我安装了 GCC 4.2；我什至用 XCode 多次重新安装它。这是我正在做的事情以及我得到的错误：

首先，我总是评估命令

如果我将编译目标设置为 C，

我收到一条错误消息：Compile::nogen : A library could not be created from the compiled function。

如果我尝试创建一个库，

我收到一条消息$Failed。Wolfram 说这是因为我没有安装 C 编译器。我觉得这很难相信，因为当我跑步时

它告诉我已经安装了 GCC：{{"Name" -> "GCC", "Compiler" -> CCompilerDriver'GCCCompiler`GCCCompiler, "CompilerInstallation" -> "/usr/bin", "CompilerName" ->自动的}}

更重要的是，终端说我也安装了 GCC！任何帮助，将不胜感激。我真的很想将 Mathematica 编译为 C。

在 Mathematica 8 中是否有一种简单的方法可以执行以下操作？

1. 构建一个图形，并使用一些图形布局显示它。
2. 稍微修改图形（例如添加或删除边或顶点）。
3. 从原始布局开始重新计算布局，以或多或少保留对象的“形状”。例如，从先前布局的坐标开始重新运行弹簧电动布局算法。

如果图表在两个显示之间没有改变，那么布局也不应该改变（或者只是最小的改变）。使用新的显示器Graph或GraphPlot两者都可以接受。

编辑：本质上我需要类似图形的类似布局。我总是通过修改可能已经布置好的现有图表来获得类似的图表，但任何通用解决方案都是可以接受的。

编辑2：这是这种东西有用的例子。转到http://ccl.northwestern.edu/netlogo/models/GiantComponent并单击“在浏览器中运行”（需要 Java）。单击设置，然后单击开始。您可以看到图表的演变。如果我们在 Mathematica 中这样做，那么每个连续的图看起来都会完全不同，并且很难看出它是在进化的同一个图。在一些应用程序中，能够将图形的微小变化可视化是非常有用的。但是如果做了很多连续的改变，那么重新计算布局是必须的，简单地淡化或突出边缘是不够的。再说一次，这只是一个例子：我不是想使用 Mathematica 来为图形制作动画，或者将巨型组件的出现可视化。

我刚刚发现 aBarChart在使用Frame而不是Axes.

例子：

这是功能还是错误？如果它是一项功能，是否有一种简单的方法可以防止裁剪？

编辑

屏幕截图，根据请求：

如果你看一下Mathematica8中的Combinatorica包，你会发现函数的定义。我有兴趣知道 Mathematica 如何知道如何格式化使用消息。有些东西告诉我，我没有查看正确的文件。无论如何，让我们尝试以下方法：(mathematicapath)/AddOns/LegacyPackages/DiscreteMath/Combinatorica.m

这一行就是上面提到的文件中的682行。现在，如果我们在mathematica notebook 中运行它并使用?Cofactor，我们将看到完全相同的消息。但是如果我们得到包，那么消息就会被格式化。这是一个屏幕截图：

注意函数中的 m、i 和 j 是如何变化的，并且在消息中添加了一个双箭头。我认为箭头已添加到消息中，因为它存在文档。有人可以解释这种行为吗？

编辑：这是我的笔记本文件的屏幕截图，它自动保存到 m 文件。

如您所见，LandM是斜体时代的新罗马。现在我将加载包并查看使用情况。

到现在为止还挺好。现在让我们看看文档中心。我会寻找功能LineDistance。

如您所见，它显示了一条奇怪的消息。在这种情况下，我们只想显示没有任何样式的消息。我仍然无法弄清楚这个Combinatorica包是如何做到的。我按照这个来制作索引，以便文档中心可以显示摘要。摘要本质上是使用情况显示。让我知道是否需要更具体。

如果您已经使用Mathematica一段时间了，您可能已经对文档中心产生了浓厚的兴趣。在这些页面中总会发现一些新的东西。让它成为一个函数的选项，或者只是一些在某些时候对你没有用的例子。

您可能已经编写了具有您一直使用的专用功能的包。有时您可能会想到一个与您的函数一起使用的简洁示例，但它很可能最终被遗忘在硬盘的某个位置。如果您在想到它的那一刻就将其写入文档，那么您以后可能不会拼命寻找它。

出于这个原因，我想知道如何以编程方式将您自己的函数的文档与Mathematica 的文档中心集成。这个问题在这里探讨如何改编文档。如果您编写了可以帮助您执行此操作的脚本，请与社区分享。

对于这个问题，Wolfram 的 Workbench 不是一个可接受的解决方案。一切都必须通过Mathematica的简单安装来完成。解决方案应涵盖以下几点：

1. 为函数创建文档（最好是模板）。
2. 创建指南和教程（如果他们认为有用）。
3. 将笔记本链接到文档中心。
4. 创建在不同环境中正确显示的“使用”消息。
   • 在 Mathematica 笔记本中?Symbol
   • 在文档中心Search: Symbol

这是一个非常广泛的话题，我有针对 1、2 和 3 的解决方案。我缺少第 4 点。那么请告诉我们，您如何使用文档中心记录您的功能？

更新

我添加了另一个答案。希望这个答案更能鼓励 Mathematica 的用户使用他们的包编写文档页面。我认为编写文档页面对应用程序编写者和应用程序用户都有好处。如果你下载我写的包，我建议你按照教程进行操作，这样你就可以看到每一步会发生什么。这将为您未来的项目提供宝贵的经验。

Github（2014 年 5 月 24 日）

自从我写了这个包以来，已经有几个人对这个包感兴趣。我已将包上传到 Github：https ://github.com/jmlopez-rod/ApplicationMaker 。如果您想成为存储库的贡献者，请与我联系。

在 Mathematica 7 和 8 中，我们发现 Mathematica 无法正确保存和获取拟合例程的结果。我希望这里有人知道：此错误的最佳实践解决方法是什么？

我们的任务是使用 NonlinearModelFit 拟合大量数据集，它为每个数据集返回一个 FittedModel。这些拟合需要一段时间，我们尝试使用 Save 和 DumpSave 将结果存储到文件中。随后的分析使用 Get 将 FittedModel(s) 拉回。

Mathematica 在没有警告的情况下执行 Save & Get，但返回的 FittedModel 有问题。我们调用 Get 并从磁盘加载 FittedModel，将结果称为“foo”。尝试 foo[10] 使用输入 10 评估拟合模型。我们看到的错误是 foo["BestFitParameters"] 应该返回一个规则列表，而是将字符串插入到函数中，因为它是像 10 这样的数字。尝试 foo [{"BestFitParameters","BestFitParameters"}] 应该在列表中给出规则两次，但在错误的 foo 中保持未评估。

除此之外，还有一个奇怪且具有误导性的行为，具体取决于我们是删除/清除 foo 还是退出内核：

• 将 FittedModel 计算为 foo
• 将 foo 保存或转储到磁盘
• 删除和/或清除 foo
• 从磁盘获取 foo
• foo 工作正常

但是如果我们重新启动内核它会失败

• 将 FittedModel 计算为 foo
• 将 foo 保存或转储到磁盘
• 杀死并重新启动内核
• 从磁盘获取 foo
• foo 是越野车

有没有人见过这种行为？

这个错误背后有很好的解释吗？

有没有好的解决方法？

旧习惯很难改掉，我意识到我一直在使用opts___Rule模式匹配和结构，就像thisoption /. {opts} /. Options[myfunction]我目前正在开发的非常大的包中一样。Sal Manango 的“Mathematica Cookbook”提醒我，后版本 6 的做法是opts:OptionsPattern[]和OptionValue[thisoption]. 无论如何，该软件包需要版本 8，但多年来我从未改变过编写此类代码的方式。

是否值得从我的 pre-version-6 做事方式中重构所有这些？有性能或其他好处吗？

问候

马鞭草属

编辑：总结

针对这个问题提出了很多好的观点，所以谢谢大家（当然还有一个）。总而言之，是的，我应该重构使用OptionsPatternand OptionValue。（注意：OptionsPattern不像OptionPattern我以前那样！）有很多原因：

1. 触摸速度更快（@Sasha）
2. 它更好地处理参数必须在的函数HoldForm（@Leonid）
3. OptionsPattern自动检查您是否将有效选项传递给该函数（FilterRules如果您传递给不同的函数，仍然需要（@Leonid）
4. 它处理RuleDelayed（:>）更好（@rcollyer）
5. Flatten它在不使用(@Andrew)的情况下处理嵌套的规则列表
6. 使用OptionValue /@ list而不是多次调用来分配多个局部变量要容易一些someoptions /. {opts} /. Options[thisfunction]（在@rcollyer和我之间的评论中出现）

编辑：7 月 25 日我最初认为，/.如果您故意从另一个函数中提取默认选项，而不是实际调用的那个，那么使用该语法可能仍然有意义。事实证明，这是通过使用其中OptionsPattern[]包含头部列表的形式来处理的，例如：（请参阅文档OptionsPattern[{myLineGraph, DateListPlot, myDateTicks, GraphNotesGrid}]中的“更多信息”部分）。我最近才解决了这个问题。

C 编译器和数学。

嗨，我想在数学中使用 CUDA 功能。但是，它需要一个工作的 c 编译器。我通常是一个 unix 人，但我有一个mathematica 的 Windows 副本。我尝试安装 Visual Studio Express 和 miniGW（某种 gcc 到 Windows 端口）。但是现在当我启动mathematica并在加载了需要的CCompilerDriver和CUDALink之后执行CCompiler []时，我得到了一个空的编译器列表。我需要设置一些隐藏的东西来让mathematica发现这些编译器。我完全迷失在这个 Windows 环境中。

我在 wolframs 网站上没有提到这一点，在他们的所有示例中，visual studio 都在那里并且已经在工作。

哦，是的，我的mathematica 是第8 版。

我想编写一段 C 代码并将其发送到每个处理器以执行它

这可能使用mathematica吗？

使用网关将 C 与mathematica 或其他任何东西联系起来

谢谢你们 .. ：）