问题标签 [mahotas]

嗨，我是 Python 新手，正在关注Python Image Tutorial。

安装教程中描述的包后，以下执行没有错误

但是，当我尝试阅读图像时

我明白了

image = mahotas.imread('image_file.jpg') Traceback（最近一次调用最后）：文件“”，第 1 行，在文件“/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/mahotas-0.6.4 -py2.6-linux-i686.egg/mahotas/ init .py"，第 68 行，在 imread 中引发 ImportError('mahotas.imread 依赖于 freeimage。找不到它。错误是：%s' % e) ImportError： mahotas.imread 依赖于 freeimage。找不到它。错误是：mahotas.freeimage：在以下任何目录中都找不到 libFreeImage：'/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/mahotas-0.6.4-py2.6-linux-i686.egg/ mahotas'、'/lib'、'/usr/lib'、'/usr/local/lib'、'/opt/local/lib'

我尝试安装 FreeImagePy 并且可以毫无问题地导入它，但它没有帮助。我尝试使用包 sys 添加到 Python 路径，但也无济于事。

编辑：我应该提到除了 pymorph 和 mahotas 之外的所有软件包都安装在我的 linux 机器上，执行“*sudo apt-get install package_name*”，而 pymorph 和 mahotas 是通过下载和执行“ sudo python setup.py install ”安装的。

我正在尝试使用 Mahotas 编写图像，但发现它非常困难。

我得到的错误是：

我在 OS X 上并使用 brew 来安装 freeimage。

最近我不得不在 Python 中做很多与视觉相关的工作，并且在格式之间切换时遇到了很多困难。当我使用 Mahotas 读取图像时，我似乎无法将其传输到 cv2，尽管它们都使用 numpy.ndarray。SimpleCV 可以轻松获取 OpenCV 图像，但为遗留 cv 或 mahotas 获取 SimpleCV 图像似乎是一项艰巨的任务。

一些格式转换语法将不胜感激。例如，如果我使用 mahotas 打开灰度图像，默认情况下它被视为浮点颜色空间，正如我所收集的那样。即使我将类型指定为 numpy.uint8，cv2 似乎也无法将其识别为数组。我不知道如何解决这个问题。我对彩色图像也没有太多运气。我在 Ubuntu Oneiric Ocelot 上使用 Python 2.7 32 位。

提前致谢！

我有一张由我的另一个代码保存的图像。图像是一个普通的 JPG 文件。我用imsave保存了它。

现在当我在另一个代码中阅读它时，它似乎是 3d ：S

图片在这里。

和一个简单的代码来阅读它是这样的：

I want to select (threshold) brown pixels (vessels) on medical image and compute the area which they do represent. How can I do that in Python like in Matlab or C++? Are there any good examples I could not find?

Thank you

我需要对图像进行二值化并计算选定的微血管（黑褐色），然后将图像阵列分成 100 个相等的部分并在这些图像区域中设置质心（黑色像素的最大和最小数量）并计算节点之间的图形边缘距离在这些中心。有没有人有经验并且知道在 Python 中使用哪些函数？

这是起始代码：

非常感谢

上面的代码给出了黑色背景上的白色像素，如何计算图像上的白色区域，然后将图像分割成 100 个矩形并找到具有最小、最大和平均像素数的矩形？谢谢

我是 python 新手，建议我使用 Canopy。我正在尝试按照本教程进行操作，但我陷入了 mahotas.imread 行。我收到一条错误消息，并以此结尾：

完全错误是：mahotas.freeimage：在以下任何目录中找不到 libFreeImage：'/Users/RJD/Library/Enthought/Canopy_32bit/User/lib/python2.7/site-packages/mahotas', '/lib' , '/usr/lib', '/usr/local/lib', '/opt/local/lib'

我已经通过包管理器添加了 mahotas 包，但无济于事。也尝试了这里的步骤，没有不同的结果。

我实际上能够在“/Users/RJD/Library/Enthought/Canopy_32bit/User/lib/python2.7/site-packages/mahotas”中找到“freeimage.py”和“freeimage.pyc”。我该如何告诉 Canopy 它在那里？！

任何帮助将不胜感激。

干杯，R

如何从一维 numpy 子数组的数组中选择子数组？

I wrote a method computing Robert Haralick image features (using Mahotas package) on .tif medical images in the working directory. I receive the print output in a column like:

I need to convert it to the horizontal row appearance like: 1789789 8909888 898098098 and, if possible, append the name of the processed file before that row of output (like: imagename 7897987 90890898...). Here is the code: