问题标签 [intel-mpi]

我正在尝试使用 Intel MPI 4.0.0.012 构建 Boost.MPI 1.47，但 Boost 无法找到安装。我using mpi ;在 user-config.jam 中尝试了各种 -variants，包括using mpi ;，using mpi : mpicl ;但using mpi : c:/path/to/mpi/mpicl.bat没有运气。我也尝试过使用using mpi : <find-shared-library>impi ;虽然我不确定<find-shared-library>真正做什么）。

使用using mpi ;我得到：

使用using mpi : mpicc我得到：

using mpi : <find-shared-library>impi ;结果是

如何将 Boost.MPI 与英特尔 MPI（Windows、Visual Studio 2010、x64）链接？

我有一个二维双精度数组，由多个进程并行操作。每个进程都操作数组的一部分，并且在每次迭代结束时，我需要确保所有进程都具有相同的二维数组副本。

假设一个大小为 10*10 的数组和 2 个进程（或处理器）。过程 1 (P1) 处理 2D 行的前 5 行（总共 5*10=50 个元素），P2 处理最后 5 行（总共 50 个元素）。在每次迭代结束时，我需要 P1 拥有（它自己的前 5 行 + P2 的最后 5 行）。P2 应该有（P1 的前 5 行 + OWN 最后 5 行）。我希望情况很清楚。

我正在尝试使用下面给出的代码进行广播。但是我的程序一直退出并出现此错误：“应用程序终止于退出字符串：挂断（信号 1）”。

我已经在使用一个连续的 2D 内存分配器，如此处所指出的：MPI_Bcast a dynamic 2d array by Jonathan。但我仍然遇到同样的错误。

有人可以帮我吗？

我的代码：

第 2 部分：上面的代码是使用一维分解的拉普拉斯方程并行求解器的一部分，我不想使用 Master-worker 模型。如果我使用 Master-worker 模型，我的代码会更容易吗？

可能重复：
将 MPI 主机文件配置为使用多个用户身份

有谁知道可以通过mpirun指定必须在与给定主机或 MPI 执行中的主机列表的特定ssh连接中使用的用户？我需要在不同的节点中使用不同的用户。

在大量内核上调试我的程序时，我遇到了非常奇怪的insufficient virtual memory. 我的调查导致代码和平，主人向每个奴隶发送小消息。然后我写了一个小程序，其中 1 个 master 简单地发送 10 个整数，MPI_SEND所有的 slave 用MPI_RECV. /proc/self/status之前和之后的文件比较MPI_SEND显示，内存大小之间的差异是巨大的！最有趣的事情（这使我的程序崩溃）是该内存不会在之后释放MPI_Send并且仍然占用大量空间。

有任何想法吗？

我正在尝试使用版本 11.1 20090511 在具有 MPICC 的集群上编译 milcv7.7.8/ks_spectrum 的源代码，当通过“make ks_spectrum_hisq”命令在 milcv7.7.8/ks_spectrum 中创建源代码时，最后错误出现为

com_mpi.o: 在函数initialize_machine': ../generic/com_mpi.c:(.text+0xb447): undefined reference to_mm_idivrem_epi32 '

我现在知道这个函数 _mm_idivrem_epi32 是 intel 编译器中 ia32intrin.h 文件的一部分。

当我在具有 14.0.0 20130728 版本的英特尔编译器的新集群上使用最新的英特尔 mpiicc 时，代码编译成功。那么有什么方法可以告诉链接器包含函数 _mm_idivrem_epi32 位置...

据我了解，MPI 通信器限制了通信范围，因此从一个通信器发送的消息永远不会在另一个通信器中接收。

然而，下面内联的程序似乎与此相矛盾。

我知道MPI_Send调用在发布匹配接收之前返回，因为它在引擎盖下进行了内部缓冲（而不是MPI_Ssend）。我也明白这MPI_Comm_free不会立即破坏通信器，而只是将其标记为释放并等待任何挂起的操作完成。我想我不匹配的发送操作将永远挂起，但是我想知道为什么同一个对象（整数值）会被第二个通信器重用！？

这是正常行为，MPI 库实现中的错误，还是我的程序不正确？

任何建议都非常感谢！

后期编辑：发布后续问题

输出：

这是我之前的问题的后续，其结论是程序错误，因此预期的行为是未定义的。

我在这里尝试创建的是一个简单的错误处理机制，为此我将针对空消息的 Irecv 请求用作“中止句柄”，将其附加到我的正常MPI_Wait调用（并将其转换为MPI_WaitAny），以便允许我取消阻止进程 1，以防进程 0 发生错误并且它无法再到达应该发布匹配的点MPI_Recv。

发生的事情是，由于内部消息缓冲，MPI_Isend可能会立即成功，而其他进程无法发布匹配的MPI_Recv. 所以没有办法取消它了。

我希望一旦所有进程调用，MPI_Comm_free我就可以一劳永逸地忘记该消息，但事实证明，情况并非如此。相反，它被传递到MPI_Recv以下通信器中。

所以我的问题是：

1. 这也是一个错误的程序，还是 MPI 实现（英特尔 MPI 4.0.3）中的一个错误？
2. 如果我把我的MPI_Isend电话变成MPI_Issend，程序按预期工作 - 我至少在这种情况下可以放心程序是正确的吗？
3. 我在这里重新发明轮子吗？有没有更简单的方法来实现这一点？

再次，非常感谢任何反馈！

输出：

我最近安装了 Intel 的 Cluster Studio，并且正在测试 IMPI。当我尝试使用 运行一个简单的 hello world 程序mpirun时，这个过程需要很长时间，我必须自己结束它。我使用了以下代码：

我用mpiicpc main.cpp -o main. 这是我添加-show选项时的输出：

我用mpirun -np 4 main.

附加信息：

更新：我也尝试使用g++而不是编译它icpc。没运气。我的猜测是 MPI 运行时有问题，但我找不到。调试不起作用。我认为程序一开始并没有初始化。

MPI_COMM_SPAWN_MULTIPLE使用英特尔 MPI 实现并使用 ifort 编译代码时，我遇到了内部崩溃。相同的代码使用 OpenMPI 并使用 gfortran 编译没有问题。相关代码贴在下面。

我的 Intel MPI 版本是 impi/5.0.2.044/intel64 安装在 RHEL 机器上。

我正在使用 java 使用以下代码调用 MPI 程序：

但是即使在exitValue()没有抛出异常的情况下已知，ps aux仍然显示一堆./myProgram，并且程序仍在写入结果文件，就好像它没有被杀死一样，只有在完成所有计算后才会终止。

目前，我发现成功终止的唯一方法./myProgram是Ctrl+C将控制台中使用的 java 终止到 java 程序。

我的意图是立即停止计算，让 java 程序安排一些其他的计算。是否有任何解决方法可以强制所有 mpi 实例终止，或者至少保证在小而明确的时间内（例如 30 秒或 1 分钟的轮询）终止？