我正在编写一个程序来从距离矩阵中绘制图形。它工作正常。现在我希望某个节点和某个边缘具有我选择的特定颜色。我怎么做？

该程序是在 Python 中并使用 Networkx 和 Graphviz

我想在我的页面中将链接显示为由节点组成的网络图。所以请推荐一些可以与 javascript 或 jQuery 一起使用的可视化库或插件。我想显示特定页面上的链接在哪里。

我知道方形二进制矩阵可以转换为图形。例如在下面的matlab矩阵中使用gplot可以转换为图形

可以用图来表示

但我想知道是否有办法转换一个矩形矩阵

在matlab或任何其他语言中以某种方式绘制图表？

我的行和列也是不同的变量。

我已经用 networkx 生成了一个图形，并将其导出为一个 .dot 文件以进行可视化。

.dot 文件看起来不错，有我创建的节点和节点属性，还有边缘数据（via如下），一切就绪。

我的问题是如何在 linux 上可视化这些数据？我试过gephi，它看起来是其中最有能力的，但它没有检测到边缘属性（via）。

我需要能够以交互方式探索数据。

这是一个简化的点文件，它显示了相同的行为

在networkx中，我像这样创建它

我试过的另一个查看器ZGRViewer也没有显示该数据。

更新

使用 cytoscape 3.0.0-beta1 时，当导入使用 networkx 导出为

错误是

cytoscape 2.8.3 中的错误如下所示：

我正在使用 GraphViz 可视化一系列流程。每个进程由程序顺序的一些读或写操作组成。自然地，希望针对每个处理以从左到右的顺序排列操作。

使用 GraphViz（2.28 版），我的代码如下所示：

很抱歉，我不允许发布声誉太低的输出图片。如果你可以运行代码，你会看到结果不是那么令人满意，因为 pid = 3 的过程中出现了乱序。具体来说，GraphViz 布局算法重新排列了（理想的）顺序“wf2-> wz2 -> wa1 -> wx3”到“wx3，wf2，wz2，wa1”。因此，我的问题是：

我的问题：如何在排名环境中强制执行从左到右的节点排序？

通过在这个网站上的探索，我发现了一些类似的问题和潜在的解决方案。但是，它们在我的具体示例中不起作用：

• Graphviz .dot 节点排序：约束 = false选项使我的 PDF 图片更糟。我检查了点用户手册，上面写着：

  在等级分配期间，边缘的头节点被限制在比尾节点更高的等级上。但是，如果边缘的约束=false，则不强制执行此要求。

  基于以上陈述，（我猜）约束=假选项在不同等级之间而不是在同一等级之间生效。

• Graphviz---随机节点顺序和通过标签的边：令人惊讶的是，constraint = false选项在同一等级中帮助了“有限状态机”很多。同样，它并没有使我免于麻烦。

• graphviz：循环布局，同时保留节点顺序：过程图在节点和边数上都是动态的。因此，使用节点的绝对位置可能没有吸引力（导致许​​多边缘交叉？）。

  感谢您的任何建议。可执行代码将不胜感激。

我在 Windows 7 上使用 GraphViz 2.28 （当前稳定版本），并且 Graphviz/Dot 因以下代码而崩溃。

当我对这个例子进行一些实验时，事情变得很奇怪：

1. 只有最后一条语句“wx2 -> wx1[style = dashed, color = red, label = “1”];”时效果很好 已移除;
2. 仅删除第八行“{rank = same;0;wx1;wx2;rx1;}”时效果很好；
3. 当仅删除最后一条语句中的标签（即“，标签=“1””）时，它也能很好地工作。

我已将问题报告给Graphviz 问题跟踪器，但尚未回复。你能帮忙找出原因吗？

谢谢你。

booggie 以 GraphML 格式保存图形，该格式也可以在图形可视化工具 Gephi 中打开。

有没有办法用 booggie 中可访问的属性来定义 Gephi 中节点的视觉外观？

在 booggie 2 中，我可以将图形导出为 yEd 的 graphML-Format。但是，我不知道元模型中的节点和边类型定义应该是什么样子，以便我可以控制它们的视觉外观

谁能提供一个例子？

我正在寻找一个高性能库，它可以绘制大量（10 甚至 100 万）相对简单的矢量形状（圆形、弧形或圆角矩形），用于 2D 图形布局的可视化。

我希望能够只传输动画开始和停止几何体，然后在 GPU 上“生成”插值动画。

在每一帧，我想通过简单地更新全局插值参数（通常从 0 到 1）来最小化从 CPU 到 GPU 的数据量。

由于我想基于 OpenGL，我相信顶点缓冲区对象 (VBO) 是我应该选择的。

我选择的语言是 C++11，我的平台是 Ubuntu 12.10。

能够将高质量的文本与形状叠加在一起是一大优势。

您应该推荐哪些库/API？

我相信 oglplus 是一个很好的候选人，但我不确定它是否对我的任务来说太低了。

我想通过我存储在哈希中的坐标点绘制一条连续的线，如果可能的话，是 3D 的，但可能是 2D 开始的。

我想处理大约十个点/秒，以便我可以看到随着时间的推移绘制的线。

有谁知道可视化这个的好方法？我考虑过在 Blender 中编写 Python 脚本，但我想知道是否有更快的方法来获得工作原型。