问题标签 [ggtern]

我正在尝试使用 ggtern 生成三元混合物的响应曲面图。使用其中一个geom_interpolate_tern()或stat_interpolate_tern()我收到以下错误：

最初我使用的是我自己的数据，但我后退了一步，我使用的是随包提供的长石数据。当我直接使用文档中的示例时：

我收到相同的错误并生成以下图： Feldspar Ternary Plot with geom_point()andstat_interpolate_tern() But I should generate: Image from documentation

如您所见，该geom_point()图层显示正确，并且我已经测试了许多其他 ggtern 几何图形，它们都可以正常工作。我正在使用 R 4.0.0 和 ggtern 3.3.0。有人知道我在这里做错了什么吗？

我最初的问题：

在我使用 ggplot 创建的绘图中，它可以正常运行数月，轴文本突然丢失......除非我使用 ggsave。值得注意的是，在打开项目时，如果我尝试查看绘图，则会收到以下错误：

只有通过重新运行代码来生成绘图，我才能看到任何东西。仅缺少轴文本（刻度、刻度标签和轴标签）（在 x 和 y 轴上）。这些图在一天运行良好，然后在没有更改代码的情况下停止运行。

我尝试了什么：

我尝试了 dev.off() 和各种相关选项，但都没有任何效果。我更新了 RStudio，没有任何区别。我的地块在一个新项目中看起来不错。我卸下了所有不必要的包裹并一一重新连接。我更新了过时的软件包。基本故障排除。

最终解决了什么问题：

最终，我从我的工作区（全局环境）中清除了所有对象，这样我就可以在某种意义上重新开始。那是我的阴谋再次开始工作的时候。在绘图面板中，轴文本再次出现。

我的问题：

唔？为什么这样做？在过去的几年里，我只遇到过一两次这个问题（尽管不是在具有相同设置的同一台计算机上）。过去，dev.off() 解决了这个问题。虽然我的问题已经解决了，但我想了解发生了什么。下次遇到这个问题时，寻求见解和新知识，也许还有解决方法。影响 RStudio 图形设备的全局环境中存储了什么？ScalesList 错误是否提供了线索？

可能相关：

在我的绘图停止工作的几周前，我安装了最新版本的 ggtern，它是 ggplot2 的扩展，可以创建三元图。我还编写了一个用于创建特定绘图的函数，在该函数中，我删除了轴文本。但是，我没有在停止工作的图中使用此功能。我还安装了 ggpubr 和 ggmaps。

我正在尝试为某些数据绘制“密度模式”，但出现错误。

我收到这个丑陋的警告和错误：

警告消息：1：stat_density_tern：您尚未指定低于检测限 (bdl) 的值（请参阅 ?stat_density_tern 中的“bdl”和“bdl.v​​al”参数）。目前，您的 1x value/s 低于 0.010 的检测限，占您数据的 9.091%。由于 ILR 变换的数学计算，边缘处的密度值可能显得异常高。您可以： 1. 忽略此警告， 2. 适当设置 bdl 值，以便从 ILR 计算中省略边缘值，或 3. 接受高密度值（如果存在），并手动设置“breaks”参数，以便较低密度的计数被适当地表示。2：计算失败stat_density_tern()：未使用的参数 (z.range = c(6.93591401660315e-213, 8424.28848000516))

我在 Windows 中使用 RStudio 版本 1.3.959、R 4.0.1、ggtern 3.3.0。

我想使用 Shiny 创建一个三元绘图仪表板。但我陷入了这个错误。此代码采用 CSV 文件并更新三个下拉输入。然后创建的三元图具有这三个下拉值。问题是我不断从“aes”函数中收到一个错误，告诉我找不到对象“x_s”。这是我的代码：

我尝试了许多其他方法来实现这一点，但每次我得到同样的错误。

我想使用 Shiny 创建一个三元绘图仪表板。但我陷入了这个错误。此代码采用 CSV 文件并更新三个下拉输入。然后创建的三元图具有这三个下拉值。

问题是在将“geom_point()”添加到 obj 时出现此错误 -> CoordTern 需要以下缺失的美学 (tlr->xy)：z

当想要添加 stat_density_tern 时出现相同但不同的问题，我收到此错误 -> stat_density_tern 需要以下缺失的美学：z

我可以在基本的 R 中做到这一点，但是当尝试将它作为 Shiny 的一部分来实现时，我得到了错误，我不确定如何修复。

我正在尝试使用ggtern创建并排比较两个三元图的图像。创建图后，当我尝试使用 来排列它们时grid.arrange()，我收到以下错误：

以下代码重现了该错误：

如何为 提供美学grid.arrange()或以其他方式修复此错误以便显示我的图？

我想将我的数据绘制为三元图，其中基因在三种条件之一下上升或下降，即。更接近显示更高值的条件。

1. 每个变量的值是否独立于值进行了标准化？
2. 我可以为选定的“基因”变量添加一个标签，该变量声明变量“func2”吗？

这是我获得的（顶部）和我想要的（底部）的可重复示例

如何使用选定的红色/蓝色填充和黑色轮廓为 A 和 D 着色。检查我的 <geom_point> 以查看我尝试过的内容。谢谢！

期望的输出：

是什么让值点图重叠并在 ggtern 图上绘制在另一个之上？我怎样才能改变它？我想将我选择的彩色观察结果绘制在黑色观察结果之上。（根据我的数据，我有 1400 个观察值，即使点大小较小，这仍然会发生）

现在：

我尝试将颜色更改为“白色” col<-rep("white", length(unique(df$func1))) ，或者另一种选择是将黑点设为白色/透明？在col？

这是一些示例代码。

如何增加箭头和箭头的粗细？一旦我开始增加标签的大小，它们就太薄了。

另外，如何将参数 base_size 与 ggtern 主题一起使用？因为它似乎只适用于某些主题，所以如果我想扩大所有内容（包括箭头），我不确定我是否正确使用它。