问题标签 [ff]
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r - ff/ffbase R 包中的 Data.table setDT 功能
计算包中的条件均值列ff/ffbase
。我正在搜索ff/ffbase
包中的功能,这允许我进行类似于以下使用data.table
包进行的数据操作:
中有一个条件均值函数ffbase
,但是,它创建了 中的类数长度的向量irisdf[,5]
:
,而不是长度为 的新向量nrow(irisdf)
。
正如@BondedDust 建议的那样ave(base)
给出正确的输出:
所以最后一个问题是,如何添加VectorOfMeans
,irisdf
我试过下面的代码,它有效:
使用来自SO答案的cbind.ffdf2,但我想,这个SO问题是关于更具体的问题,然后是主要的,我想有一种更简单(更快)的方法可以做到这一点。我希望能够在获得的数据集上运行(例如),你应该看看我关于合并的问题和在这种情况下(因为物理/虚拟存储模式存在我不详细了解的问题)。bigglm.ff
irisdf
VectorOfMeans
irisdf
r - 如何从 ffdf 对象中删除列?(右)
我可以轻松删除ffdf
对象列吗?
如何只包含Sepal.length
和Species
列?
r - 如何将 35 GB 数据加载到 R 中?
我有一个维度为 2000 万条记录和 50 列的数据集。现在我想将此数据集加载到 R 中。我的机器 RAM 大小为 8 GB,我的数据集大小为 35 GB。我必须在完整数据上运行我的 R 代码。到目前为止,我尝试了 data.table(fread)、bigmemory(read.big.matrix) 包来读取该数据但没有成功。是否可以将 35 GB 数据加载到我的机器(8 GB)中?
如果可能,请指导我如何克服这个问题?
提前致谢。
r - ff R 中的包:“无磁盘空间”错误是权限问题吗?
我正在使用ff
RStudio 中的包,它在我部门的 Windows 服务器上运行。我正在使用它来处理一些大型数据集,这些数据集也存储在网络驱动器上。我已经确认我对 Windows 中的驱动器具有完全读/写访问权限,但是当我使用ff
包中直接将平面文件写入磁盘的任何函数(例如ff()
或as.ff()
)时,我收到“无磁盘空间”错误。
但是,如果我将数据写入另一个驱动器,然后将其移动到使用它的网络驱动器,pattern()
它工作正常。ff
我的包裹只有这个问题。其他功能base
如save()
和write.csv()
工作正常。是否存在特定于ff
软件包的权限问题?我在下面包含了一个最小的工作示例。
这是 R 的软件版本信息:
r - 有效地将“个人打卡进出时间日志”转换为“建筑物随时间的总占用率”
所以我有 .csv 格式的数据,显示特定用户在几个月内进出建筑物的时间。我正在尝试使用 R 每 15/30 分钟将建筑物占用率制成表格以进行分析。
数据已被清理并采用大型ffdf
数据框(约 1100 万个条目)的形式。数据帧具有numeric
和factor
类型(它包括稍后可能有用的字符串和数字),并且打卡/打卡时间在格式为POSIXct
.
如果这是一个小得多的数据集,我会执行以下操作:
- 创建一个空的 .csv 文件(即
occupancy
)来存储入住率,时间作为列标题,日期作为行。 - 使用 for 循环在所有行中迭代以下内容:
- 计算建筑总时间(打卡时间 - 打卡时间)
- 从打卡条目中提取日期,存储为
inDate
- 使用
round_any
从plyr
包装中查找开始时间最近的 15 分钟上限,存储为nearest15
- 查找用户占用的完整 15 分钟积木的数量,通过
floor(as.numeric((clockouttime - clockintime)/15))
- 将 1 添加到用户正在构建的相关时间块数,从
occupancy[inDate, nearest15]
.
然而,遍历 1100 万行的 for 循环根本就没有效率。
有谁知道如何有效地做到这一点?我不知所措 -apply
据我所知,函数系列会将所有数据强制转换为单一类型。如果您不熟悉特定命令,则不需要它们,我只想有人指出正确的包和实现的总体思路。
我ff
目前正在使用访问数据,但如果有更好的包可以做到这一点,我愿意接受建议。
谢谢。
编辑:这是我正在查看的代码的编辑片段:
user_hash, section_hash, dept_id, col_a, col_b, clockin_datetime, clockout_datetime
EEDD1DA7F38CA42A35CF3C003B,85C7,TS,1,,2013-08-08 12:52:00,2013-08-08 23:00:00
2BCB6AA1603BB4357BC0D390C9,BFA3,VS,1,,2013-08-08 12:48:00,2013-08-08 22:58:00
46D859B55C4802DF51445025C5,943B,TS,1,,2013-08-08 11:58:00,2013-08-08 16:04:00
FE4EEA83AF6EA50CA5738B5610,00B3,VT,1,,2013-08-08 19:56:00,2013-08-08 23:04:00
8DB43D322F0AEF6D2B877862C3,DB1F,TS,1,,2013-08-08 12:49:00,2013-08-08 13:03:00
4E636571D425A74CA6B5FA7909,1860,VS,1,,2013-08-08 12:21:00,2013-08-08 14:01:00
26B41FA581408BDFD747234640,FDA4,VS,1,,2013-08-08 20:38:00,2013-08-08 23:03:00
A6C3C190BFFDCB4194774C1026,45C0,VT,1,,2013-08-08 12:58:00,2013-08-08 20:03:00
938506D977353EA65DC6BB5260,1819,VT,1,,2013-08-08 12:54:00,2013-08-08 16:01:00
E82F9350DA9FFC73EE6A66A286,04C1,VT,1,,2013-08-08 08:42:00,2013-08-08 12:45:00
6B92F1AB6B3EE193430B6B2793,6C2E,TS,1,,2013-08-08 09:58:00,2013-08-08 13:03:00
2B88836D8A4CA5183AAE5D3D9A,497C,TS,2,,2013-08-08 10:35:00,2013-08-08 16:06:00
我想到的期望输出是这样的,尽管任何显示我在任何给定时间段/日期入住的形式都可以。
date 12.00 12.15 12.30 12.45 .......
2013-08-01 1344 1632 3742 1024
2013-08-02 342 435 435 435
2013-08-03
2013-08-04
...
r - 如何在 Snow R 中使用大型多类型数据框?
我有一个 20M 行的大型 data.frame。这个数据框不仅是数字,还有字符。使用拆分和征服的概念,我想拆分这个数据帧以使用雪包(特别是 parLapply 函数)以并行方式执行。问题是节点内存不足,因为数据帧部分是在 RAM 中工作的。我寻找了一个包来帮助我解决这个问题,但我只找到了一个(考虑到多类型 data.frame):ff 包。另一个问题来自于这个包的使用。ffdf的拆分结果不等于commom data.frame的拆分。因此,无法运行 parLapply 函数。
你知道这个目标的其他包吗?Bigmemory 仅支持矩阵。
r - 为什么在 ffbase2 (dplyr_ffbase) 中汇总显示“as.vmode.default() (list) 对象中的错误不能强制输入'double'”?
我有一个包含 10 列的大型(2300 万行)ffdf 表(tbl_ffdf),其中 7 个是因子,3 个包含数字。它看起来像这样:
我想用 sum(Nx) 聚合数据以删除这种重复项并使我的表如下所示:
我正在使用从 github 安装的包 ffbase2(对于 ffdf 表来说是 dplyr)。我正在做以下事情:
然后它工作〜10秒并说
之后,它会根据我的 Rstudio 中的设置进入调试模式,他需要大约 3-5 分钟才能深入,停止挂起计算机并显示出错的功能代码:
在 Data 中,我们可以看到 x 是 F1 值的 data.frame。在 Traceback - 函数中
观察 ffbase2 的源代码并没有给我太多...我有类似方法 summarise_.grouped_ffdf 使用数据的递归切片,并且可能在最后一步它得到一些 data.frame 但想要得到一个矩阵?...这是“(列表)对象不能被强制输入'double'”错误的常见原因。
我不知道这个错误的真正原因是什么以及如何解决它。请帮忙!:-)
r - 如何删除R中的ffdf对象目录?
我正在使用该ffdf
包进行一些数据预处理。我的工作计算机有 4 个 CPU 内核和 8 Gb 的 RAM,我可以处理大约 0.2-3 亿个数据点,这真是太棒了。
但是,我还有另一个限制。大ffdf
对象占用了我电脑的磁盘空间。当我将 5 个表合并为一个,并在其上再添加 20 列时,我收到了一条消息"no disk space"
。
所以,我想删除ffdf
磁盘驱动器上未使用的对象。我可以在不退出 R 会话的情况下执行此操作吗?(我对该文件夹具有读取、写入和执行权限。)
我已经尝试了我所知道的一切,例如unlink()
, file.remove()
, delete()
, close()
, finalize()
, finalizer()
, ffdrop()
”。
r - 使用 tabplot 包时出现此错误“if (any(B < 1)) stop(“B too small”) 中的错误”是什么意思
我找到了用于可视化大型数据库的 tabplot 包。我使用下面的代码运行它,但在不同的数据帧上出现此错误:
这是一个例子:
任何想法如何克服这个问题?
更新- 我使用了另一台计算机,它工作正常。两台计算机都在 Windows 64 位上,但在我让它工作的计算机上,操作系统是 Win7 pro,而在出现错误的计算机上,操作系统是 WIN SERVER 2013
r - 从 R 中的 ff_object 中删除空格
我有一个 ff 对象。其中一列是字符串变量,有空格,我想删除这些。
我尝试了以下方法:
1)。 newcol <- gsub("[[:space:]]", "", mydata$mystr)
2)。 newcol<- as.ffdf(gsub("[[:space:]]", "", mydata$mystr))
我还尝试使用 as.character 命令,因此在应用 gsub 命令之前我说了以下内容:
但是,这些选项都不起作用。任何建议/帮助将不胜感激。
编辑:下面给出我的 AKRUN 的解决方案