问题标签 [combn]

我有一个 18528 行和 3 列的数据框，如下所示：

我需要计算每组中值之间的差异：

然后，如果差异大于 2，则将该值设为“NA”，如：

我用combn来计算差异，但我得到了错误，我认为原因可能是组（2和4）中的长度不同。提前致谢

我想计算纬度/经度坐标的行对之间的距离。这可以通过 earth.dist 等各种函数轻松完成。我被困的地方是我希望这成为每晚数据质量检查过程的一部分，其中对数发生变化。每行都是唯一的主题/人。有时，一些受试者可能有四组坐标，有时最大的可能是三组。有没有一种优雅的方式来执行这个计算，例如，所有可能的组合由以下组成：

，其中 geototal 是给定日期的坐标集的数量，例如 x = 4 的集合：

纬度1，经度1，纬度2，经度2，纬度3，经度3，纬度4，经度4。

我当前的循环看起来像这样，但当然错过了许多可能的组合，尤其是。当 X 大于 4 时。

感谢您对此的任何想法！

我有一个看起来像这样的mx矩阵：n

按行获取所有可能组合的最快方法是什么？在这种情况下，那将是c(1,4), c(1,5), c(1,6), c(2,4), c(2,5) ... c(3,5), c(3,6)

如何使用矢量化方法解决这个问题？通常，mxn矩阵将具有n^m这样的组合。

我希望得到一些关于在 R 中管理大量组合的建议。

我是一名植物育种研究生，试图计算植物种群中 40 个亲本的各种组合的后代的最高平均值。我首先创建一个矩阵，其中包含通过交叉这些父项获得的值：

我通过找到包含各种父母组合的矩阵子集（“perse.hybrid”）的平均值来做到这一点：

理想情况下，我想找到 40 个父母的所有组合的后代值，但更现实一点，我想找到 2 到 11 个父母组合的值。这大约是 35 亿个组合。

我一直在努力加快速度并管理内存。为了加快速度，我将其设置为在 Amazon EC2 集群（通常是 3 个 m4.10xlarge 机器）上并行运行任务。为了解决内存挑战，我尝试将数据保存在 big.matrix 中。但是，我似乎遇到了combn。通常当我达到 40 选择 8 时，它会崩溃。看 htop，我相信那是因为内存使用。

我是新手 R 用户，并不完全了解 R 中的内存管理方式。如果我能以某种方式拆分 combn 函数，我似乎可以获得这些限制，这可能允许我并行运行它并避免内存限制。或者也许有一种方法可以在不使用 combn 的情况下用所有组合填充 big.matrix。有没有人有任何建议的策略？代码如下。太感谢了！

编辑：

随着更多的调查，看起来组合可能成为解决方案的一部分。Stackoverflow 在这里发布：使用 combn() 和 bigmemory 包生成一个非常大的字符串组合矩阵

我会做一些测试，看看这是否适用于大量数字。

我有一个数据框：

我对它执行 combn() ：

它返回一个这样的矩阵：

我想获得一个向量，其中每个向下的元素是 x 的每一列的 c(n,n+1,n+2) 中每个 n 的中值。像这样：

所以你会看到它被转换了，所以沿着 y 中的向量向下的每个项目都是列表的原始 combn() 向量中每个 n 元素的中值。

我需要 R 打印出前五个样本（即出现的“等级”的前五个组合）。我怎样才能让 R 做到这一点？

通过在上面输入该代码，显然它好像在输出整个向量（即不输出五行（每行都有一个组合），就像它应该的那样）。

编辑：我很抱歉应该更清楚：我正在尝试输出前五行。

如果我做：

我得到前七行，但我需要五行：

不确定我是否选择了一个好的标题...而且我不知道我是否使用了正确的术语，所以也许使用正确的搜索字词我会找到解决这个问题的方法...

我有一个字符串列表，我希望从中获得 3 的所有“排他”组合。

示例：使用以下内容

我得到一个表格，列出了这 6 个字符串中 3 个的所有可能组合（因此每一行代表 3 个的一个组合）：

但我想拥有 3 的所有组合，其中每个字符串只出现一次。所以我想要的输出看起来像这样：

所以这里每个子元素（$1, $2,$3等）包含 3 个字符串的 2 种组合（如 2*3=6; 有 6 个字符串）。在每个集合中，每个字符串不得出现超过一次。

mylist当然，如果这对于不是 的倍数的长度也是可能的，那就太好了n=3。如果我们假设有 10 个字符串（加上“strG”、“strH”、“strI”和“strJ”），我希望在每个组合中省略一个字符串。所以想要的结果就像

有人对此有解决方案吗？如果我的解释不清楚，请告诉我。

干杯

我有一个看起来像这样的数据框

我希望上面的数据框有一对从“bb”中挑选的元素，看起来像下面的框架

R 输入代码

我有一个具有以下结构的data.frame：

我想组合combn()但仅使用 1 个变量，我的意思是，得到这个结果：

而不是：（有太多我不需要的变量，我想选择 x[i]）

谢谢

如果我还与 ba、ca...dc 进行逆向组合，我应该如何编写代码。一共12种组合。